【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种基于实时核酸序列依赖性扩增(Nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)技术的肠道病原体快速检测技术。具体涉及星状实时NASBA等温扩增快速检测试剂盒;还涉及所述试剂盒中使用的对于星状病毒基因组具有特异性的引物对和分子信标探针。
技术介绍
星状病毒(Astrovirus,AstV)于1975年由Appleton和Higgins使用电镜检测急性胃肠炎患儿粪便标本时被首次发现,因病毒颗粒在电镜下呈现5、6个角的特征外观,状如星形而由Madeley和Cosgrove命名为星状病毒。星状病毒是一种分布很广泛的,导致婴幼儿、老年人、免疫功能低下或缺失者急性腹泻的重要病原之一。星状病毒既可引起散发和医源性感染,也能形成暴发,有研究发现它亦是成人腹泻的重要病原。星状病毒基因组是单股正链RNA,长度约为6.8 kb,基因组从5’端到3’端顺序包括一个约85个核苷酸的5’非编码区(5’ non-coding region,NCR),三个开放读码框架(open reading frames ...
【技术保护点】
一种星状病毒检测用引物,其特征在于,包括正向引物F1和反向引物R1,所述正向引物F1和所述反向引物R1的碱基序列表示如下:正向引物F1:5’?TCARTCTWMTCARCGTGTCCGTA?3’;反向引物R1:5’?AATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGGAGDATRCACGCCTCRATYTC?3’。
【技术特征摘要】
1.一种星状病毒检测用引物,其特征在于,包括正向引物F1和反向引物R1,所述正向引物F1和所述反向引物R1的碱基序列表示如下:
正向引物F1:5’-TCARTCTWMTCARCGTGTCCGTA-3’;
反向引物R1:
5’-AATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGGAGDATRCACGCCTCRATYTC-3’。
2.根据权利要求1所述的一种星状病毒检测用引物,其特征在于:所述反向引物R1的5’端的25个碱基是增加的T7噬菌体启动子序列,而3’端23个碱基是与星状病毒ORF2互补的特异性序列,所述正向引物F1和所述反向引物R1的3’端的病毒核酸变异位点使用简并碱基。
3.一条星状病毒检测用分子信标探针,其特征在于,所述分子信标探针的碱基序列表示如下:
分子信标探针P1:
5’-HEX-CCAAGCAACTCAGGAAACARGGTGTCGCTTGG-DABCYL-3’,
所述分子信标探针P1在其寡核苷酸DNA分子的5’端标记荧光报告基团HEX,3’端标记荧光淬灭基团DABCYL。
4.根据权利要求3所述的一条星状病毒检测用分子信标探针,其特征在于:所述分子信标探针P1的5’端和3...
【专利技术属性】
技术研发人员:莫秋华,谭华,李卫岗,杨泽,刘志明,林继灿,杜田,
申请(专利权)人:珠海国际旅行卫生保健中心,
类型:发明
国别省市:
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