The invention discloses a primer and probe for rapid detection of the genotype of porcine epidemic diarrhea virus. The invention also discloses a kit containing the primers and probes, and a method for quickly detecting the genotype of porcine epidemic diarrhea virus. Using the primers, probes and methods of the invention to detect porcine epidemic diarrhea virus of different genotypes, it has high specificity, good reproducibility and high sensitivity, and can quickly and accurately detect the genotypes of porcine epidemic diarrhea virus.
【技术实现步骤摘要】
快速检测猪流行性腹泻病毒基因型的引物和探针、方法
本专利技术涉及病毒检测
,尤其是一种快速检测猪流行性腹泻病毒基因型的引物和探针、方法。
技术介绍
猪流行性腹泻(porcineepidemicdiarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus,PEDV)引起的以腹泻、呕吐和脱水为典型特征的一种急性高度接触性肠道传染病。哺乳仔猪、架子猪或育肥猪等各种年龄的猪均易感,但哺乳仔猪受害最为严重,死亡率最高可达100%。自从1971年英国首次报道猪流行性腹泻(PED)以来,相继在比利时、德国、加拿大、日本、瑞士等多个国家报道了本病的发生,我国从1976年开始就陆续有PED的报道,但临床危害较轻。该病2010年在我国大规模暴发,由于其发病率高、死亡率高(初生仔猪因水样腹死亡率可高达100%),传播迅速,短短几年时间,造成我国生猪存栏量持续走低,给我国生猪养殖造成巨大经济损失的同时,也严重影响了国计民生。2014年该病由东南亚、东北亚逐步蔓延至美国(美国自2013年5月在爱荷华州发生PED以来的一段时间,每周损失10万 ...
【技术保护点】
快速检测猪流行性腹泻病毒基因型的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针的核苷酸序列如下:上游引物:GAACCCACTAACTTGGGTGT(SEQ ID NO:1);下游引物:AGGTTCAACAATCTCAACTA(SEQ ID NO:2);探针:ATCTGGACCTGCTGTTGCCATTGCC(SEQ ID NO:3),其中,所述探针的5‘端结合荧光报告基团,所述探针的3‘端结合荧光淬灭基团。
【技术特征摘要】
1.快速检测猪流行性腹泻病毒基因型的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针的核苷酸序列如下:上游引物:GAACCCACTAACTTGGGTGT(SEQIDNO:1);下游引物:AGGTTCAACAATCTCAACTA(SEQIDNO:2);探针:ATCTGGACCTGCTGTTGCCATTGCC(SEQIDNO:3),其中,所述探针的5‘端结合荧光报告基团,所述探针的3‘端结合荧光淬灭基团。2.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,所述荧光报告基团为FAM、HEX、VIC、CY5或TET,所述荧光淬灭基团为TAMRA、MGB或BHQ。3.快速检测猪流行性腹泻病毒基因型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1或2所述的引物和探针。4.快速检测猪流行性腹泻病毒基因型的方法,其特征在于,包括以下步骤:1)从样品中提取病毒核酸;2)以核酸为模板,利用权利要求1或2所述的引物和探针,进行RT-PCR扩增反应获得扩增产物;3)对扩增产物进行HRM分析,确定病毒的基因型...
【专利技术属性】
技术研发人员:张春红,张建峰,刘志成,沈海燕,孙俊颖,
申请(专利权)人:广东省农业科学院动物卫生研究所,
类型:发明
国别省市:广东,44
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