KRAS基因突变检测试剂盒及检测方法技术

技术编号:8239317 阅读:796 留言:0更新日期:2013-01-24 19:18
本发明专利技术适用于生物技术及医学领域,提供了一种KRAS基因突变检测试剂盒,该试剂盒包括PCR缓冲液,7对特异性引物,1对质控引物,特异性探针,锁核酸探针,内标系统,酶溶液和参比染料。本发明专利技术还提供了一种人类KRAS基因七种突变检测方法。本发明专利技术的检测试剂盒具有以下优点:1.灵敏度高;2.特异性强;3.减少污染,确保结果真实可信;4操作简单快速。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物技术及医学领域,尤其涉及一种人类KRAS基因突变检测试剂盒及检测方法
技术介绍
Ras为一种原癌基因,其参与人类肿瘤的发生发展,最初是从大鼠肉瘤病毒中克隆而得。自1982年Weinberg等人发现人的膀胱癌细胞中有活化的H-Ras基因后,Ras基因引起人们极大关注。Ras基因编码的蛋白质是P21蛋白,分子量为21KD,由188-189个氨基酸组成,也称之为P21高度相关蛋白。Ras基因家族中,KRAS对人类癌症影响最大。KRAS蛋白是EGFR信号传导通路中·的一个关键的下游调节因子,KRAS突变型编码异常的蛋白,刺激促进恶性肿瘤细胞的生长和扩散,且不受EGFR信号影响。在研究EGFR突变与吉非替尼治疗进展期NSCLC患者的疗效间的关系的过程中也发现了 KRAS基因点突变,而且研究表明,KRAS基因突变与NSCLC对吉非替尼、厄洛替尼等靶向治疗药物的原发性耐药有关。有研究发现KRAS基因的突变使结直肠癌患者对西妥昔单抗的治疗产生耐药性。因此检测KRAS基因的突变可作为EGFR靶向治疗耐药性产生的重要预测指标。美国国家癌症综合网络(NCCN) 2009年版的临床指南中明确指出KRAS基因是人体肿瘤中常见的致癌基因。该基因的突变常见于多种恶性肿瘤,在肺癌患者中的突变率为15-30%,在结直肠癌患者中为20-50%。导致KRAS处于激活状态的突变部位主要是位于外显子2的密码子12和13。NCCN指出KRAS基因突变会使肺癌患者对EGFR酪氨酸激酶抑制剂产生耐药;使结直肠癌患者对抗EGFR抗体类药物产生耐药。所以NCCN提出肿瘤患者接受EGFR靶向药物治疗之前,必须进行KRAS基因突变检测,根据检测结果决定是否使用EGFR靶向药物作为临床治疗措施。因此KRAS基因突变检测能提高肿瘤临床治疗的针对性,降低治疗费用,节省宝贵的治疗时间。KRAS基因突变包括以下七种常见突变类型1. Glyl2Asp (GGT)GAT),2.Gly12Ala (GGT>GCT), 3. Glyl2Val (GGT>GTT), 4. Glyl2Ser (GGT>AGT),5.Glyl2Arg(GGT>CGT), 6. Glyl2Cys (GGT>TGT), 7. Glyl3Asp (GGOGAC)。KRAS 基因突变为体细胞突变,因此其检测方法也不同于一般性遗传突变的检测。其检测主要存在两个方面的难点一是需要高灵敏度,因为样品模板中突变比例未知,可能突变含量只有1%甚至更低,这就需要较高检测灵敏度以准确检出这些稀有细胞。另一方面是需要高特异性,因为样品中细胞可能绝大多数都是野生型,如何在大量野生型背景中准确检出突变细胞是KRAS基因突变检测的另一个难点。目前KRAS基因突变检测的方法很多,如直接测序法,焦磷酸测序法,高分辨率溶解曲线检测法(High Resolution Melting Analysis, HRM),高效液相色谱法,突光定量PCR法等。其中最常见方法还是直接测序法,该法费用较低,但操作耗时长,并且它有两个明显的缺点一是灵敏度低,一般需要突变基因丰度达到10%以上才能准确检测。二是由于后续需要对PCR产物进行处理,容易出现污染导致结果不准确。因此在本领域需要一种可以高效快速准确全面地检测出KRAS基因全部七种突变的产品及方法,以便及时准确地获得KRAS基因突变的信息。
技术实现思路
本专利技术实施例的目的在于提供一种人类KRAS基因突变检测试剂盒及检测方法,旨在解决现有技术中检测周期长、灵敏度低且检测结果不够准确的问题。本专利技术实施例是这样实现的,一种KRAS基因突变检测试剂盒,该试剂盒包括PCR缓冲液,酶溶液,7对特异性引物,I对质控引物,特异性探针,锁核酸探针,内标系统和参比染料,其中,所述7对特异性引物序列分别为SEQ ID N0:1和SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5 和 SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:7 和 SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:9 和SEQ ID NO: 10,SEQ ID NO: 11 和 SEQ ID NO: 12,SEQ ID NO: 13 和 SEQ ID NO: 14,所述 I 对 质控引物为 SEQ ID NO: 15 和 SEQ ID NO: 16。本专利技术还提供一种KRAS基因突变检测方法,包括以下步骤(I)制备本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒;(2)取I只质控管和7只突变检测管,分别向其中加入步骤(I)中的PCR缓冲液、酶溶液、参比染料、特异性探针和内标系统,并向该质控管中加入质控引物,向该7只突变检测管中分别加入7对特异性引物,且该7只突变检测管中均加入锁核酸探针;(3)提取待测样品DNA,分别加入至所述I只质控管和7只突变检测管中,进行PCR反应。本专利技术KRAS基因突变检测试剂盒采用TaqMan探针法,建立了针对人类KRAS基因12和13密码子7种常见突变的多重实时PCR检测方法,本专利技术KRAS基因突变检测试剂盒中采用锁核酸探针用于阻断野生型,大大降低野生型背景,提高特异性,同时引入内标系统和UNG酶防污染系统,能更加准确,稳定的对样品进行分型检测。本专利技术的检测试剂盒及检测方法具有以下优点1.灵敏度高,可以在IOng野生型基因组DNA背景下准确检出1%的突变DNA ;2.特异性强针对7种不同突变位点设计引物,同时结合锁核酸探针降低了背景,能特异的识别对应突变;3.使用荧光定量PCR技术进行检测,检测过程均为闭管反应,显著降低污染,并且加入UNG酶防污染系统,确保结果真实可信;4操作简单快速,能在100分钟内完成检测,并且结果判读简单客观,便于分析。附图说明图I为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因野生型样品的扩增曲线图;图2为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第12密码子GGTXTGT突变型样品的扩增曲线图;图3为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第12密码子GGT>AGT突变型样品的扩增曲线图;图4为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第12密码子GGT>CGT突变型样品的扩增曲线图5为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第12密码子GGT>GTT突变型样品的扩增曲线图;图6为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第12密码子GGT>GAT突变型样品的扩增曲线图;图7为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第12密码子GGT>GCT突变型样品的扩增曲线图;图8为本专利技术的KRAS基因突变检测试剂盒检测KRAS基因第13密码子GGOGAC突变型样品的扩增曲线图。具体实施例方式·为了使本专利技术要解决的技术问题、技术方案及有益效果更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本专利技术进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本专利技术,并不用于限定本专利技术。本专利技术实施例提供一种KRAS基因突变检测试剂盒,该试剂盒包括PCR缓冲液,酶溶液,7对特异性引物,I对质控引物,特异性探针,锁核酸探针,内标系统和参比染料,其中,所述本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种KRAS基因突变检测试剂盒,该试剂盒包括PCR缓冲液,酶溶液,7对特异性引物,1对质控引物,特异性探针,锁核酸探针,内标系统和参比染料,其中,所述7对特异性引物序列分别为SEQ?ID?NO:1与SEQ?ID?NO:2、SEQ?ID?NO:3与SEQ?ID?NO:4、SEQ?ID?NO:5与SEQ?ID?NO:6、SEQ?ID?NO:7与SEQ?ID?NO:8、SEQ?ID?NO:9与SEQ?ID?NO:10、SEQ?ID?NO:11与SEQ?ID?NO:12、SEQ?ID?NO:13与SEQ?ID?NO:14,所述1对质控引物为SEQ?ID?NO:15和SEQ?ID?NO:16。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡从利张喆周鹏飞
申请(专利权)人:武汉友芝友生物制药有限公司
类型:发明
国别省市:

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