一种检测人结核杆菌相关易感基因CISH +1320位点的单核苷酸多态性的方法技术

本发明专利技术属于医学分子生物学领域，公开了一种检测人结核杆菌相关易感基因CISH+1320位点的单核苷酸多态性的方法。该方法应用PCR-荧光标记单碱基-毛细管电泳分离检测技术检测CISH+1320位点多态性，具体方法包括人全血基因组DNA提取、单核苷酸多态性位点扩增引物及延伸引物设计与合成、PCR扩增产物质量验证、单核苷酸多态性位点检测样本的制备及检测、数据分析、与测序结果的对照评价。本发明专利技术在保证结果可靠性的基础上，不需要像测序法那样检测较长的无关片段，只需要产生单个碱基的信号，避免了无关片段的复杂结构对检测的干扰，检测周期和成本均显著低于测序法，结果可读性强。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于医学分子生物学领域，涉及一种检测人结核杆菌相关易感基因CISH+1320位点的单核苷酸多态性的方法。
技术介绍
随着人类基因组测序计划的完成，人类已进入后基因组时代。该时代的研究重点是个体间的遗传差异。这种差异最常见的是单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphism, SNP)，即在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性，它具有密度高、遗传稳定、易于自动化分析等特点，被认为是继限制性片段长度多态性、微卫星多态性之后的第三代遗传标记，可用于基因定位、多态性分析等方面，是研究疾病易感性、 疾病诊断、药物筛选等的常用指标。单碱基延伸法(single base primer extension)又称微测序法、模板介导染料终止剂掺人分析或单核苷酸多态性鉴定技术(single-nucleotidepolymorphism-identification technology, SNP-IT),是在双脱氧测序法的基础上发展出来的单核苷酸多态性检测方法。其原理是首先设计I对PCR引物，从基因组DNA中扩增出含有目的单核苷酸多态性位点的片段，再设本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测人结核杆菌相关易感基因CISH+1320位点的单核苷酸多态性的方法，其特征方法在于检测方法包括如下步骤：(1)设计CISH单核苷酸多态性位点的扩增引物及延伸引物；(2)制备人全血基因组DNA样本；(3)PCR扩增靶片段；(4)PCR扩增产物纯化；(5)单碱基延伸反应制备CISH？1320+位点多态性的样本；(6)采用毛细管电泳检测样本单核苷酸多态性位点；(7)采用Fragment程序分析，根据片段分析结果中单碱基延伸所产生的峰来判读相应的碱基，确定CISH+1320位点的单核苷酸多态性。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：俞杨，王自正，邬兰，焦杰，杜同信，瞿卫，谢玉为，
申请(专利权)人：俞杨，王自正，邬兰，焦杰，杜同信，瞿卫，谢玉为，
类型：发明
国别省市：