甲亢疾病的易感基因及其应用制造技术

技术编号:8102577 阅读:291 留言:0更新日期:2012-12-20 05:24
本发明专利技术公开了甲亢疾病的易感基因及其应用。具体地,本发明专利技术公开了20个涉及人类甲亢疾病易感性的单核苷酸多态性位点(SNP)。本发明专利技术还首次证实了这20个单核苷酸多态性位点与甲亢疾病存在密切相关性。这些SNP可用于检测甲亢易感性、制备检测甲亢疾病易感性试剂及试剂盒、筛选甲亢药物等,从而为甲亢疾病的诊断、分型、预后和治疗提供新的方式。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物学和医学领域。更具体地,本专利技术涉及人类基因组中20个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)及其与甲允疾病的相关性。本专利技术还涉及检测这些SNP和甲亢易感性的方法和试剂盒。
技术介绍
甲状腺功能允进症(Hyperthyroidism,简称甲允)系指由多种病因导致甲状腺激素(TH)分泌过多引起的临床综合征。甲亢病人较复杂,其中以弥漫性甲状腺肿伴甲亢(Graves病,GD)为最多见。GD是一种伴甲状腺激素分泌增多的、器官特异性自身免疫性疾病,它是机体的免疫系统功能亢进,从而产生抗自身甲状腺的抗体(免疫球蛋白)而引起的,这种特异性的抗体刺激甲状腺增生、并使其分泌大量的甲状腺激素。一般Graves病多 见于女性,男女患病率之比为I : 4-7,特别是青春发育期、妊娠期和更年前期。经研究,Graves病是一种器官特异性自身免疫疾病,一种常见的多基因疾病,因此其发病具有较强的遗传基础。Graves病的发病原因一般被认为是由多种易感基因和环境因素共同造成的。已经发现人白细胞抗原(HLA) -II基因、细胞毒性T淋巴细胞抗原4 (CTLA-4)基因,促甲状腺受体(TSH-R)基因和甲状腺球蛋白(Tg)基因等多个基因与Graves病存在一定的联系。此外,还有其它的免疫相关基因,如白介素-I受体拮抗基因、肿瘤坏死因子β基因和甲状腺过氧化物酶基因等,但很多结果存在争议。群体中可能存在多于一种的称为“多态位点”的核酸序列,多态位点可以允许序列基于取代、插入或缺失而存在差异。因此取代、插入或缺失可以导致移码、产生过早终止密码子、多核苷酸所编码的一个或多个氨基酸的缺失、添加、改变剪切位点。以及影响mRNA的转运或稳定性。当多态位点长度为单独一个氨基酸时,将该位点称为单核苷酸多态性(SNP)。SNP是造成疾病易感性和药物反应差异的最普遍的遗传变异形式。SNP可以直接促成许多表型如患者间的疾病危险或药物反应差异,或者更普遍地作为所述表型的标记。由于甲亢疾病本身的复杂性、多个基因之间的相互作用,以及环境因素对甲亢疾病发展的影响,使甲亢易感基因的确定十分困难。因此,本领域迫切需要深入研究人类基因组,以期找到导致Graves病发生和发展的易感基因,并研发出可用于诊断和检测Graves病的试剂盒,以及相关的治疗药物。
技术实现思路
本专利技术人经过长期深入的研究,发现20个单核苷酸位点(SNP)与甲亢疾病的易感性密切相关。本专利技术的一个目的是证实20个单核苷酸多态性位点与甲亢疾病密切相关。本专利技术的另一个目的是证明所述SNP可用于检测甲亢易感性、制备检测甲亢疾病易感性试剂及试剂盒、筛选甲亢药物等。在本专利技术的第一方面,提供一种分离的含单核苷酸多态性(SNP)位点的多核苷酸,所述多核苷酸中的SNP位点对应于选自下组的SNP I 号染色体 155908307 位 rsl0908583C — T ;I 号染色体 155935902 位 rs3761959G —A;2 号染色体 204416891 位 rs231804C —T;2 号染色体 204429997 位 rsl024161C —T;2 号染色体 204449111 位 rs231726C —T;2 号染色体 204471289 位 rsl0197319A —G; 4 号染色体 39998408 位rs6832151T —G;6 号染色体 31166157 位rs4947296T —C;6 号染色体 31458683 位rsl521C —T;6 号染色体 32536263 位rs6903608T —C;6 号染色体 32771829 位rs6457617C —T;6 号染色体 33168096 位rs2281388C —T;6 号染色体 167293698 位 rs9366076T —C;6 号染色体 167303065 位 rs9355610A — G ;14 号染色体 80438570 位 rsl2050151T —C;14 号染色体 80502299 位 rsl79247G —A;14 号染色体 80514120 位 rs2284722G —A;14 号染色体 80520982 位 rsl2101261C —T;14 号染色体 80538707 位 rs4903964G — A ;14 号染色体 80592881 位 rsl7111394T — C。在另一优选例中,所述SNP是甲亢易感相关的SNP,详细信息如表I所示表I权利要求1.一种分离的含单核苷酸多态性(SNP)位点的多核苷酸,其特征在于,所述多核苷酸中的SNP位点对应于选自下组的SNP I 号染色体 155908307 位 rsl0908583 C →T ; 1号染色体 155935902 位 rs3761959 G →A; 2号染色体 204416891 位 rs231804 C →T; 2 号染色体 204429997 位 rsl024161 C →T; 2 号染色体 204449111 位 rs231726 C →T; 2 号染色体 204471289 位 rsl0197319 A →G; 4 号染色体 39998408 位 rs6832151 T →G; 6 号染色体 31166157 位 rs4947296 T →C; 6 号染色体 31458683 位 rsl521 C →T; 6 号染色体 32536263 位 rs6903608 T →C ; 6 号染色体 32771829 位 rs6457617 C →T; 6 号染色体 33168096 位 rs2281388 C →T; 6 号染色体 167293698 位 rs9366076 T →C ; 6 号染色体 167303065 位 rs9355610 A →G; 14 号染色体 80438570 位 rsl2050151 T →C; 14 号染色体 80502299 位 rsl79247 G →A; 14 号染色体 80514120 位 rs2284722 G →A; 14 号染色体 80520982 位 rsl2101261 C →T; 14 号染色体 80538707 位 rs4903964 G →A ; 14 号染色体 80592881 位 rsl7111394 T →C。2.如权利要求I所述的多核苷酸,其特征在于,所述的SNP是选自表2的与治疗后抗体持续阳性(TRab+)相关的SNP。3.如权利要求I所述的多核苷酸,其特征在于,所述的SNP选自下组 rs9355610A →G 或 rs6832151T →G。4.如权利要求I所述的多核苷酸,其特征在于,所述的多核苷酸包括引物、探针、扩增产物、或质粒。5.如权利要求I所述的多核苷酸,其特征在于,所述的多核苷酸的长度为8-5000bp,较佳地 10-3000bp,更佳地 15-1000bp,最佳地 18_500bp。6.一种核酸引物对,其特征在于,所述引物对长度为15-50bp,且特异性地杂交并扩增出单核苷酸多态性(SNP)的扩增产物,其中所述的SNP选自表本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种分离的含单核苷酸多态性(SNP)位点的多核苷酸,其特征在于,所述多核苷酸中的SNP位点对应于选自下组的SNP:1号染色体155908307位??rs10908583??C→T;1号染色体155935902位??rs3761959???G→A;2号染色体204416891位??rs231804????C→T;2号染色体204429997位??rs1024161???C→T;2号染色体204449111位??rs231726????C→T;2号染色体204471289位??rs10197319??A→G;4号染色体39998408位???rs6832151???T→G;6号染色体31166157位???rs4947296???T→C;6号染色体31458683位???rs1521??????C→T;6号染色体32536263位???rs6903608???T→C;6号染色体32771829位???rs6457617???C→T;6号染色体33168096位???rs2281388???C→T;6号染色体167293698位??rs9366076???T→C;6号染色体167303065位??rs9355610???A→G;14号染色体80438570位??rs12050151??T→C;14号染色体80502299位??rs179247????G→A;14号染色体80514120位??rs2284722???G→A;14号染色体80520982位??rs12101261??C→T;14号染色体80538707位??rs4903964???G→A;14号染色体80592881位??rs17111394??T→C。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:宋怀东潘春明赵双霞
申请(专利权)人:上海交通大学医学院附属瑞金医院
类型:发明
国别省市:

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