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一种用于对食品中的麦角菌进行鉴定的方法技术

技术编号:13604339 阅读:119 留言:0更新日期:2016-08-28 00:56
本发明专利技术提供了一种用于检测麦角菌的试剂盒,其包括引物、Bst DNA聚合酶、反应缓冲液和核酸染料。本发明专利技术还提供了一种检测麦角菌的LAMP方法。使用本发明专利技术的LAMP试剂盒或方法能够快速、准确地对麦角菌进行鉴定和检测,具有高特异性、耗时短、灵敏度高、鉴定简便等优点,适于实验室或田间检验使用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及微生物检测领域,具体地说,本专利技术涉及一种用于检测麦角菌的试剂盒及检测方法。
技术介绍
麦角菌(Claviceps purpurea)属麦角菌科、麦角菌属,是一类主要以禾本科杂草和粮谷类植物为寄生宿主的真菌。其寄生于宿主的子房内,受侵染的子房不形成种子而是形成坚硬的菌核。菌核结构比较致密,并且外面包有一层角状外壳,由此得名“麦角”(Ergots)(Alderman,1999)。麦角菌在高湿度、高水分条件下生长旺盛,容易感染植株。大部分麦角病菌的麦角是其宿主植物种子的1-4倍。由麦角病菌及其菌核所导致宿主植物所发生的病一般称为“麦角病”(Ergotdiseases)。麦角病是麦类和禾本科植物牧草的重要病害,不但使麦类大幅度减产,而且麦角中的生物碱对人、畜有毒,历史上因误食含麦角的谷物而引起中毒事件时有发生,如牲畜误食带麦角的饲草中毒死亡,人摄入过多含麦角的谷物食品也会发生流产甚至死亡现象。因此,需要开发适于田间或实验室对麦角菌进行快速检测的试剂盒或方法。目前分子生物学检测以其快速、灵敏的特点,在微生物检测领域逐渐取代传统的形态学鉴定,成为热门研究方向。环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification of DNA,LAMP)是日本学者Notomi于2000年建立的一种新型的核酸扩增技术。该技术针对靶基因6个区域设计4条引物,利用具有链置换活性的DNA聚合酶在恒温条件下快速、高特异性地扩增靶基因,产物是两端带有茎环结构
的哑铃状DNA分子。与实验室常规检测的PCR方法相比,LAMP技术具有操作简便、灵敏度高、特异性强等优势,在食品、动植物检验检疫中被广泛应用于各种病原检测。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种用于检测麦角菌的LAMP试剂盒及LAMP方法。为了实现本专利技术的目的,在一个方面中,本专利技术提供一种用于检测麦角菌的LAMP试剂盒,其包括引物、反应缓冲液、Bst DNA聚合酶和核酸染料,其中所述引物如下所示:外引物F3:CGGACACTCAAGATCGACC(SEQ ID NO:1)外引物B3:CGATATCGGGCCTTGTGAAT(SEQ ID NO:2)内引物FIP:TGGGGTTCGTTTCGGCTTGAA-GACAAGCGTGCTTGACCAAT(SEQ ID NO:3)内引物BIP:GAGAATCTGAGGCCGGCTACTG-TCCTTCCTATGCCCTGCT(SEQ ID NO:4)。优选地,所述反应缓冲液由2mM dNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、0.6mM甜菜碱和6mM Mg2+组成。优选地,所述核酸染料为1000×SYBR Green I。优选地,本专利技术的试剂盒进一步包括DNA提取试剂以及阳性对照和阴性对照。优选地,所述DNA提取试剂例如CTAB抽提缓冲液。在另一个方面中,本专利技术提供了引物在制备用于检测麦角菌的LAMP试剂盒中的应用。所述引物如序列SEQ ID NOs:1-4所示。在又一个方面中,本专利技术还提供了一种检测麦角菌的LAMP方法,其中使用本专利技术的试剂盒,所述方法包括以下步骤:(1)向待测样品中加入CTAB抽提缓冲液,按照常规CTAB法提
取DNA;(2)在PCR管中制备LAMP反应体系,包括0.2μmol/μl的外引物F3 1μl、0.2μmol/μl的外引物B3 1μl、1.2μmol/μl的内引物FIP 1μl、1.2μmol/μl的内引物BIP 1μl、反应缓冲液2.5μl、8U/μl的Bst DNA聚合酶1μl、模板DNA 2μl,加水补充至25μl,并以麦角菌基因组DNA作为阳性对照,以100mM Tris-HCl pH 8.0和50mM EDTA作为阴性对照;(3)将步骤(2)中的PCR管于63℃恒温反应60min;(4)分析判断反应产物结果:在(3)中所得反应产物中加入1μl核酸染料SYBR Green I,如反应液颜色为橙色,表示结果为阴性,食品中不含麦角菌,如反应液颜色为绿色,表示结果为阳性。本专利技术的专利技术人针对麦角菌序列的6个区域设计出4条引物,灵敏度高、特异性好。本专利技术用于检测麦角菌的LAMP试剂盒及方法能够准确鉴定食品、谷物、田间的麦角菌,假阳性率低、快速、高效,且通过肉眼观察颜色变化即可判定结果,无需电泳和紫外观察等步骤,成本低、操作简单、鉴定简便,适于基础实验室和现场检测,值得推广应用。具体实施方式以下实施例用于说明本专利技术,但不用来限制本专利技术的范围。本领域技术人员应当领会的是,可以在不偏离本专利技术精神的情况下进行多种修改,这些修改将包含在本专利技术的范围内。实施例1 本专利技术的试剂盒的制备1.1试剂引物由天根生化科技(北京)有限公司合成;Bst DNA聚合酶和10×ThermoPol反应缓冲液购自Takara;SYBR Green I购自Invitrogen;其余PCR试剂和配制CTAB抽提缓冲液所需的试剂购自Sigma。1.2试剂盒的制备:获得以下试剂,以制备本专利技术的试剂盒:CTAB抽提缓冲液:按照以下配方配制:100mM Tris-HCl pH 8.0、50mM EDTA、1M NaCl、1%(v/v)β-巯基乙醇、2%CTAB,调整pH值至7.2;反应缓冲液:按照以下配方配制:2mM dNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、0.6mM甜菜碱、6mM MgSO4;引物:外引物F3,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;外引物B3,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;内引物FIP,其核苷酸序列如SEQID NO:3所示,内引物BIP,其核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。其中外引物F3和B3的浓度为0.2μmol/μl,内引物FIP和BIP的浓度为1.2μmol/μl。浓度为8U/μl的Bst DNA聚合酶;核酸染料:1000×SYBR Green I;阳性对照:麦角菌基因组DNA;阴性对照:100mM Tris-HCl(pH 8.0)和50mM EDTA。实施例2 麦角菌特异性检测2.1LAMP特异性检测2.1.1待测植株待测植株包括来自河北省农林科学院的麦角病植株8株(包括黑麦3株、大麦5株)、炭疽病黄瓜2株、白粉病豌豆2株以及健康的大麦2株。麦角病植株穗上均可见麦角形成。2.1.2样品预处理:将麦角病植株从茎基部剪断,将上部用无菌水冲洗后,用消毒剪刀将其剪成小段,置于PDA培养基上,25度恒温培养,直至形成菌落。用接种环刮取白粉病豌豆植株叶片上的白色霉层,接种于PDA平板上,划线培养。用消毒剪刀剪下炭疽病黄瓜叶片适量,在PDA培养基上分离培养炭疽病菌。挑取上述病菌菌落的菌丝少量,在光学显微镜下观察其形态学特征。观察显示,培养所得菌落均符合相应病菌的菌落特征。2.1.3LAMP检测使用实施例1制备的试剂盒按照以下步骤进行检测:(1)收集PDA平板上的菌落并离心,加入CTAB抽提缓冲液,按照常规CTAB法提取DNA;(2)在PCR管中制备LAMP反应体系,其中四种引物各1μl、反应缓冲液2.5μl、8U/μl的Bst DNA聚合酶1μl、步骤(1)所得模板DNA2μl,加水补充至25μl,并以麦角菌基因组D本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种用于检测麦角菌的LAMP试剂盒,其特征在于,可以包括特异性引物组、反应缓冲液、Bst DNA聚合酶和核酸染料,其中所述引物如下所示:外引物F3:CGGACACTCAAGATCGACC(SEQ ID NO:1)外引物B3:CGATATCGGGCCTTGTGAAT(SEQ ID NO:2)内引物FIP:TGGGGTTCGTTTCGGCTTGAA‑GACAAGCGTGCTTGACCAAT(SEQ ID NO:3)内引物BIP:GAGAATCTGAGGCCGGCTACTG‑TCCTTCCTATGCCCTGCT(SEQ ID NO:4)。

【技术特征摘要】
1.一种用于检测麦角菌的LAMP试剂盒,其特征在于,可以包括特异性引物组、反应缓冲液、Bst DNA聚合酶和核酸染料,其中所述引物如下所示:外引物F3:CGGACACTCAAGATCGACC(SEQ ID NO:1)外引物B3:CGATATCGGGCCTTGTGAAT(SEQ ID NO:2)内引物FIP:TGGGGTTCGTTTCGGCTTGAA-GACAAGCGTGCTTGACCAAT(SEQ ID NO:3)内引物BIP:GAGAATCTGAGGCCGGCTACTG-TCCTTCCTATGCCCTGCT(SEQ ID NO:4)。2.根据权利要求1所述的用于检测麦角菌的LAMP试剂盒,其中所述反应缓冲液由2mM dNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、0.6mM甜菜碱和6mM Mg2+组成。3.根据权利要求1或2所述的用于检测麦角菌的LAMP试剂盒,其进一步包括DNA提取试剂以及阳性对照和阴性对照。4.根据权利要求3所述的用于检测麦角菌的LAMP试剂盒,其中所述DNA提取试剂是CTAB抽提缓冲液。5.一种检测麦角菌的LAMP方法,所述方法用于对食品中的麦角菌进行鉴定,其包括以下步骤:(1)向待测样品中加入CTAB抽提缓冲液,按照常规CTAB法提取DNA;(2)在PCR...

【专利技术属性】
技术研发人员:张梅
申请(专利权)人:张梅
类型:发明
国别省市:河北;13

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