一种CDH1基因突变检测特异性引物和液相芯片制造技术

本发明专利技术公开了一种CDHl基因检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对D370H位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12；针对A634V位点的SEQ?ID?NO.13及SEQ?ID?NO.14；针对R732Q位点的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16；针对V82fs*13位点的SEQ?ID?NO.17及SEQ?ID?NO.18；和/或针对T263fs*3位点的SEQ?IDNO.19及SEQ?ID?NO.20；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种⑶Hl基因突变检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
上皮钙黏蛋白编码基因(E-Cadherin，⑶HI)是一种肿瘤抑制基因和肿瘤转移抑制基因，与多种上皮来源的恶性肿瘤的发生、发展、侵袭转移密切相关。CDHl基因定位于16q22. 1，由1237个腺嘌呤、1177个胞嘧啶、1128个鸟嘌呤和1236个胸腺嘧啶组成，有研究表明，CDHl基因突变与肿瘤的发生相关。目前，对CDHl基因突变进行检测和分析的方法很少，主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，以上这些方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。
技术实现思路
本专利技术的目的之一是提供⑶Hl基因突变检测液相芯片，该本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种CDH1基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对CDH1基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对D370H位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12；针对A634V位点的SEQ?ID?NO.13及SEQ?ID?NO.14；针对R732Q位点的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16；针对V82fs*13位点的SEQ?ID?NO.17及SEQ?ID?NO.18；和/或针对T263fs*3位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID...

【技术特征摘要】
1.一种⑶Hl基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有 (A).针对CDHl基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为针对D370H位点的SEQ ID NO. 11及SEQ ID NO. 12 ;针对A634V位点的SEQ IDNO. 13 及 SEQ ID NO. 14 ;针对 R732Q 位点的 SEQ ID NO. 15 及 SEQ ID NO. 16 ;针对 V82fs*13位点的 SEQ ID NO. 17 及 SEQ ID NO. 18 ;和 / 或针对 T263fs*3 位点的 SEQ ID NO. 19 及 SEQID NO. 20 ;所述 tag 序列选自 SEQ ID NO.1 SEQ ID NO. 10 ； (B).有ant1-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述ant1-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述ant1-tag序列选自SEQ ID NO. 21 SEQ ID NO. 30，且所述ant1-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的CDHl基因突变检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对D370H位点的 SEQ ID NO. 31 及 SEQ ID NO. 32 ;针对A634V位点的 SEQ ID NO. 33 及 SEQIDNO. 34 ;针对 R732Q 位点的 SEQ ID NO. 35 及 SEQ ID NO. 36 ;针对 V82fs*13 位点的 SEQ IDNO. 37 及 SEQ ID NO. 38 ;和 / 或针对 T263fs*3 位点的 SEQ ID NO. 39 及 SEQ ID NO. 40。3.根据权利要求1所述的CDHl基因突变检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为针对D370H位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO. 11组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQID NO. 12组成的序列；针对A634V位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 13组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 14组成的序列；针对R732Q位点的由SEQ ID NO. 5和SEQ IDNO. 15组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 16组成的序列；针对V82fs*13位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ IDNO. 17组成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 18组成的序列；和/或针对T263f...

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，何嘉英，陈家欣，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：