一种VHL基因突变检测特异性引物和液相芯片制造技术

本发明专利技术公开了一种VHL基因检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对T240A位点的SEQ?ID?NO.13以及SEQ?ID?NO.14；针对T254C位点的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16；针对T266A位点的SEQ?ID?NO.17及SEQ?ID?NO.18；针对C286T位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对G388C位点的SEQ?ID?NO.21及SEQID?NO.22；和/或针对444delT位点的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种VHL基因突变检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
VHL基因得名于Von Hippel-Lindau (VHL)病，含有14543bp，包含3个外显子和2个内含子。VHL病为临床十分罕见的家族性常染色体显性遗传性肿瘤病，包括中枢神经系统血管母细胞瘤、内脏肿瘤和囊肿等，1993年，Latif等通过连锁分析将VHL基因定位于染色体3p25-26，并首次成功克隆了 VHL基因。VHL基因为抑癌基因，该基因的失活会导致正常的VHL蛋白合成障碍，与肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma, CCRCC)的发生发展有着密切的关系。目前对于VHL基因的结构与功能及其调控途径的研究取得重要进展，而且已明确VHL基因的失活机制，主要包括基因突变，杂合性缺失和甲基化。本专利技术主要检测VHL基因常见的六种基因型T240A、T254C、T266A、C286T、G388C和444delT。目前，对VHL基因突变进行检测和分析的方法很少，主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种VHL基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对VHL基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对T240A位点的SEQ?ID?NO.13以及SEQ?ID?NO.14；针对T254C位点的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16；针对T266A位点的SEQ?ID?NO.17及SEQ?ID?NO.18；针对C286T位点的SEQID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对G388C位点的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；和/或针...

【技术特征摘要】
1.一种VHL基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有 (A).针对VHL基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为针对T240A位点的SEQ ID NO. 13以及SEQ ID NO. 14 ;针对T254C位点的SEQ ID NO. 15 及 SEQ ID NO. 16 ;针对 T266A 位点的 SEQ ID NO. 17 及 SEQ ID NO. 18 ;针对C286T 位点的 SEQID NO. 19 及 SEQ ID NO. 20 ;针对 G388C 位点的 SEQ ID NO. 21 及 SEQ IDNO. 22 ;和/或针对444delT位点的SEQ ID NO. 23及SEQ ID NO. 24 ;所述tag序列选自SEQID NO.1 SEQ IDNO. 12 ； (B).有ant1-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述ant1-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述ant1-tag序列选自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述ant1-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的VHL基因突变检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对 T240A、T254C、T266A、C286T 位点的 SEQ ID NO. 37 及 SEQ ID NO. 38 ;和 / 或针对 G388C、444delT 位点的 SEQ ID NO. 39 及 SEQ ID NO. 40。3.根据权利要求1所述的VHL基因突变检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为针对T240A位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO. 13组成的序列以及由SEQ ID NO. 2和SEQIDNO. 14组成的序列；针对T254C位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 15组成的序列以及由SEQID NO. 4和SEQ ID NO. 16组成的序列；针对T266A位点的由SEQ ID NO. 5和SEQ IDNO. 17组成的序列以及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18组成的序列；针对C286T位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19组成的序列以及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20组成的序列；针对G388C位点的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21组成的序列以及由SEQ ID NO. 10和SEQ ID NO. 22组成的序列；和/或针对444delT位点...

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，吴诗扬，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：