一种FGFR3基因突变检测特异性引物和液相芯片制造技术

技术编号:8559720 阅读:183 留言:0更新日期:2013-04-10 23:45
本发明专利技术公开了一种FGFR3基因检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物,所述特异性引物序列为:SEQ?ID?NO.22及SEQ?ID?NO.23;SEQ?ID?NO.24及SEQ?ID?NO.25;SEQ?ID?NO.26及SEQ?ID?NO.27;SEQ?ID?NO.28及SEQ?ID?NO.29;SEQ?ID?NO.30及SEQ?IDNO.31;SEQ?ID?NO.32及SEQ?ID?NO.33;SEQ?ID?NO.34及SEQ?ID?NO.35;SEQ?ID?NO.36以及选自SEQ?ID?NO.37、SEQ?ID?NO.38、SEQ?ID?NO.39、SEQ?ID?NO.40中的一种以上;和/或SEQ?ID?NO.41及SEQ?ID?NO.42;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】
—种FGFR3基因突变检测特异性引物和液相芯片
本专利技术属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种FGFR3基因突变检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factors, FGFs)是一组结构相似的多肽类家族,并通过跨膜高亲和力的成纤维细胞生长因子受体(fibroblast growth factor receptors, FGFRs)发挥作用。成纤维细胞生长因子受体3 (Fibroblast growth factor receptors 3,FGFR3)是一种酪氨酸激酶受体,它在细胞有丝分裂的发生、促进血管新生、伤口愈合及肿瘤形成中起重要作用。FGFR3属于跨膜蛋白质,当受体细胞外段与配体FGFs结合后,受体形成同源或异源二聚体,使细胞内段的酪氨酸激酶活化,在细胞内引起一系列级联反应,最终导致DNA合成和细胞分裂。FGFR3可以同时启动Ras-MAPK介导的丝裂原信号转导途径和对细胞生长起抑制作用的STAT信号转导途径,在正常发育时,细胞在两条信号系统的作用下生长和分化,FGFR3突变时,受体的功能异常活化,本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有:(A).针对FGFR3基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为:针对R248C位点的SEQ?ID?NO.22及SEQ?ID?NO.23;针对G370C位点的SEQ?ID?NO.24及SEQ?ID?NO.25;针对S371C位点的SEQ?ID?NO.26及SEQ?ID?NO.27;针对Y373C位点的SEQID?NO.28及SEQ?ID?NO.29;针对G380R位点的SEQ?ID?NO.30及SEQ?ID?NO.31;针...

【技术特征摘要】
1.一种FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有 (A).针对FGFR3基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为针对R248C位点的SEQ ID NO. 22及SEQ ID NO. 23 ;针对G370C位点的 SEQ ID NO. 24 及 SEQ ID NO. 25 ;针对 S371C 位点的 SEQ ID NO. 26 及 SEQ ID NO. 27 ;针对 Y373C 位点的 SEQID NO. 28 及 SEQ ID NO. 29 ;针对 G380R 位点的 SEQ ID NO. 30 及 SEQID NO. 31 ;针对 A391E 位点的 SEQ ID NO. 32 及 SEQ ID NO. 33 ;针对 D641N 位点的 SEQ IDNO. 34 及 SEQ ID NO. 35 ;针对 K650Q/E/T/M 位点的 SEQ ID NO. 36 以及选自 SEQ ID NO. 37、SEQ ID NO. 38、SEQ IDNO. 39、SEQ ID NO. 40 中的一种以上;和 / 或针对 G697C 位点的 SEQID NO. 41 及 SEQ ID NO. 42,所述 tag 序列选自 SEQ ID NO.1 SEQ ID NO. 21 ; (B).有ant1-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述ant1-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述ant1-tag序列选自SEQ ID NO. 43 SEQ ID NO. 63,且所述ant1-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对; (C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为针对 R248C位点的 SEQ ID NO. 64 及 SEQ ID NO. 65 ;针对G370C、S371C、Y373C、G380R、A391E位点的 SEQ ID NO. 66 及 SEQ ID NO. 67 ;针对 D641N、K650Q/E/T/M 位点的 SEQ ID NO. 68 及SEQ ID NO. 69 ;和 / 或针对 G697C 位点的 SEQ ID NO. 70 及 SEQ ID NO. 71。3.根据权利要求1所述的FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物为针对R248C位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO. 22组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQID NO. 23组成的序列;针对G370C位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 24组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 25组成的序列;针对S371C位点的由SEQ ID NO. 5和SEQ IDNO. 26组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 27组成的序列;针对Y373C位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ IDNO. 28组成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 29组成的序列;针对G380R位点的由SEQ IDNO. 9和SEQ ID NO. 30组成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQID NO. 31组成的序列;针对A391E位点的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 32组成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 33组成的序列;针对D641N位点的由SEQ ID NO. 13和SEQID NO. 34组成的序列及由SEQ ID NO. 14和SEQ ID NO. 35组成的序列;针对K650Q/E/T/M位点的由SEQ ID NO. 15和SEQ ID NO. 36组成的序列以及选自由SEQ ID NO. 16和SEQ IDNO. 37组成的序列、由SEQ ID NO. 17和SEQ IDNO. 38组成的序列、由SEQ ID NO. 18和SEQID NO. 39组成的序列、由SEQ ID NO. 19和SEQ IDNO. 40组成的序列中的一种以上;和/或针对G697C位点的...

【专利技术属性】
技术研发人员:许嘉森刘志明
申请(专利权)人:广州益善生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:

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