一种CDKN2A基因突变检测特异性引物和液相芯片制造技术

本发明专利技术公开了一种CDKN2A基因检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对G128T位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对C143T位点的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；针对T281A位点的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；针对G322A/C/T位点的SEQ?ID?NO.25以及SEQ?ID?NO.26、SEQ?ID?NO.27和SEQ?ID?NO.28中的一种以上；针对G329A位点的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30；针对G330A位点的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32；针对C341T位点的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34；针对G358T位点的SEQ?ID?NO.35及SEQ?ID?NO.36；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种⑶KN2A基因突变检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
细胞周期依赖性激酶抑制基因(cyclin-dependentkinase inhibitor, CDKN2A),是一种重要的抑癌基因，属于细胞周期依赖性激酶抑制因子基因家族，具有调节细胞增殖与凋亡的作用。人⑶KN2A定位于染色体9p21，编码两种不同的抑癌蛋白，一是细胞周期依赖性激酶抑制蛋白Pl6 INK4a,由外显子I α、2和3编码；另一个为其可变读框基因(alterativereading frame, ARF)pl4ARF产物，由外显子I β、2和3编码，因此，CDKN2A基因又称INK4a-ARF基因，抑癌基因CDKN2A编码的周期抑制蛋白pl6INK4a和pl4ARF具有重要的细胞周期调控作用，CDKN2A基因的变异是肿瘤发生及进展过程中的常见现象。目前，对CDKN2A基因突变进行检测和分析的方法很少，主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种CDKN2A基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对CDKN2A基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对G128T位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对C143T位点的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；针对T281A位点的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；针对G322A/C/T位点的SEQ?ID?NO.25以及选自SEQ?ID?NO.26、SEQ?ID?NO.27和SEQ?ID?NO.28中的...

【技术特征摘要】
1.一种⑶KN2A基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有 (A).针对CDKN2A基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为针对G128T位点的SEQ ID NO. 19及SEQ ID NO. 20 ;针对C143T位点的SEQ ID NO. 21 及 SEQ ID NO. 22 ;针对 T281A 位点的 SEQ ID NO. 23 及 SEQ ID NO. 24 ;针对G322A/C/T 位点的 SEQ ID NO. 25 以及选自 SEQ ID NO. 26、SEQ ID NO. 27 和 SEQ ID NO. 28中的一种以上；针对G329A位点的SEQ ID NO. 29及SEQ ID NO. 30 ;针对G330A位点的SEQID NO. 31 及 SEQ IDNO. 32 ;针对 C341T 位点的 SEQ ID NO. 33 及 SEQ ID NO. 34 ;和 / 或针对 G358T 位点的 SEQ IDNO. 35 及 SEQ ID NO. 36 ;所述 tag 序列选自 SEQ ID NO.1 SEQ IDNO. 18 ； (B).有ant1-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述ant1-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述ant1-tag序列选自SEQ ID NO. 37 SEQ ID NO. 54，且所述ant1-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的CDKN2A基因突变检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对G128T和 / 或 C143T 位点的 SEQ ID NO. 55 及 SEQ ID NO. 56 ;和 / 或针对 T281A、G322A/C/T、G329A、G330A、C341T、G358T 位点的 SEQ ID NO. 57 及 SEQ ID NO. 58。3.根据权利要求1所述的CDKN2A基因突变检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为针对G128T位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO. 19组成的序列以及由SEQ ID NO. 2和SEQ IDNO. 20组成的序列；针对C143T位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 21组成的序列以及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 22组成的序列；针对T281A位点的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 23组成的序列以及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 24组成的序列；针对G322A/C/T位点的由SEQ IDNO. 7和SEQ ID NO. 25组成的序列以及选自由SEQ ID NO. 8和SEQ IDNO. 26组成的序列、由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 27组成的序列、由SEQ ID NO. 10和SEQID NO. 28组成的序列中的一种以上；针对G329A位点的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 29组成的序列以及由SEQ IDNO. 12和SEQ ID NO. 30组成的序列；针对G330A位点的由SEQ IDNO. 13和SEQ ID NO. 31组成的序列以及由SEQ ID NO. 14和SEQ ID NO. 32组成的序列；针对C341T位点的由SEQ ID NO. 15和SEQ ID NO. 33组成的序列以及由SEQ ID NO. 16和SEQID NO. 34组成的序列；和/或针对G358T位点的...

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，郭靖，甘丹翠，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：