用于测量生物标记概况的系统和方法技术方案

技术编号:7155342 阅读:171 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及用于诊断具有情感障碍的患者的方法和系统。该方法也用于预测受试者中对于情感障碍的易感性。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】本申请含有2009年8月25日创建、大小148,658字节、以电子形式作为文件名 71021-W0-PCT_SequenceListing_ST25. txt提交的序列表。序列表在此整体引入作为参考。1专利
本专利技术提供了通过概况分析且比较相对于患病受试者的在对照受试者中基因的 mRNA表达水平,鉴定在患有病症的受试者中的转录概况的方法和组合物。本专利技术进一步提供了通过测定与此类受试者中的生物标记相关的转录概况,用于预测和诊断受试者中的病症例如情感障碍的方法和组合物。
技术介绍
本申请自始至终通过在括号内引用提及各种出版物。这些出版物的公开内容整体在此引入本申请内作为参考,以便更全面地描述本专利技术所属领域状态。目前精神病诊断分类,特别是用于情感障碍的那些,缺乏独特的临床描述,并且不包括生物学特征以描绘一种诊断实体与另一种。尽管今天的分类法允许进一步指定情感障碍例如主要性抑郁障碍的临床特征,但标准仍是主要讨论的问题且不一定遵循生物学原理 (Parker,等人 Am. J. Psychiatry 2000,157(8) :1195-1203)。在情感障碍中,存在许多临床分割,例如双相型障碍I和II、精神抑郁症和主要性抑郁障碍,包括精神病性抑郁症、重度与轻度或中度抑郁症比较、忧郁症与非典型抑郁症比较等。像这样,对于这些分割没有描述独特的生物学标记或生物标记。此外,缺乏关于特定病症的分割可以具有治疗牵涉。此外,共病对于无法描绘2种病症存在的医生是成问题的。总的来说,精神病学中的临床评估和非特异性临床诊断标准突出了关于生物学标记的需要,以便识别共享类似生物学的需要。这看起来是关于情感障碍的特定困境,因为存在关于显示临床差异和独特生物学特征的亚型的新出现证据(Gold和Chrousos,Mol. Psychiatry 2002,7(3) :254-275) 0然而,迄今为止,没有生物学标记一致地显示描绘就情感障碍而言的患者群体的分割。先前研究已探索了测量具有抑郁症的受试者与对照受试者比较,或在治疗前和后的受试者中的生物学改变的测试,例如地塞米松/促肾上腺皮质素释放激素(DEX/CRH)测试。然而,此类测试已在少量患者中进行检查,仍未再现,和/或仍未使生物学读数与特(Ising, Μ.等)κ, Biol. Psychiatry, 2006 Nov 20, e-pub ahead of print ; Kunugi, H.等人,Neuropsychopharm. 2006,31 (1) :212-20)。这是适当的,因为临床上相关的生物标记必须与特定生物学和特定表型相关,并且理想地,应通过治疗回到正常水平。对于糖尿病、阿尔茨海默氏病和癌症已鉴定了蛋白质生物标记(参见例如,美国专利号7,125,663 ;7, 097,989 ;7, 074,576 ;和6,925,389。)然而,用于检测蛋白质生物标记的方法,例如质谱法和与抗体特异性结合,通常获得不能再现的数据,并且这些方法不利于高流通量使用。使用微阵列的高流通量表达分析方法已用于评估基因表达改变,具有混合结果或无关结果(Brenner,S.等人 Nat Biotechnol. 2000,18(6) 597-8 ;Schena 等人Science. 1995,270(5235) :467-70 ;Velculescu, V. Ε.等人,Science. 1995,270(5235) 484-7)。由于测量的基因表达与受试者数目的大量比,并且考虑到抑郁性病症的异质性,对于微阵列数据预期大量假阳性。(关于综述,参见Iwamoto K和Kato T., Neuroscientist 2006,12(4) :349-61 ;Bunney WE, ^A, Am J Psychiatry2003,160(4) 657-66 ;和 Iga J, Ueno S 和 Ohmori T.,Ann Med 2008,40(5) :336_42。)Sibille 等人 (Neuropsychopharm. 2004,29(2) :351-61)执行了大规模基因组分析,然而,未发现关于与抑郁症和自杀相关的分子差异证据,并且无法再现关于先前发现与抑郁症相关的基因在表达水平中的改变。因为此类困难,一致概况仍未得到鉴定。关于多重相关基因的聚焦阵列和qPCR已用于鉴定应激相关基因,但这些研究仍未鉴定与抑郁症相关的诊断概况(Rokutan等人,J.Med. Invest. 2005,52 (3-4) :137-44; Ohmori等人,J. Med. Invest. 2005, 52 (Suppl) :266-71)。在大鼠脑区域中,特定基因的转录改变已牵涉情绪和焦虑的控制,然而,这些改变与人血样无关(W02007106685A2)。3专利技术概述本专利技术提供了诊断测试受试者中的情感障碍的方法,该方法包括评估测试受试者的生物标记概况中的多个生物标记的多个特征是否满足值集合,其中满足该值集合预测测试受试者具有所述情感障碍,并且其中多个特征是多个生物标记的可测量方面,多个生物标记包含表IA中列出的至少2个生物标记。本专利技术还提供了计算机程序产品,其中所述计算机程序产品包含计算机可读存储介质和其中嵌入的计算机程序机制,所述计算机程序机制包含用于执行诊断方法的指令。本专利技术的一个方面提供了计算机,所述计算机包含一个或多个处理器和与一个或多个处理器连接的存储器,所述存储器存储用于执行诊断方法的指令。本专利技术的另一个方面提供了测定测试受试者显示出情感障碍症状的可能性的方法,该方法包括评估测试受试者的生物标记概况中的多个生物标记的多个特征是否满足值集合,其中满足该值集合提供了测试受试者显示出情感障碍症状的所述可能性,并且其中多个特征是多个生物标记的可测量方面,所述多个生物标记包含表IA中列出的至少2个生物标记。在另一个方面,本专利技术提供了其为关于从多个对照受试者中收集的每种生物样品的转录分析测量的转录概况。例如,本专利技术提供了其为关于从多个抑郁、严重抑郁或双相型受试者中收集的每种生物样品的转录分析测量的转录概况。本专利技术进一步提供了其为关于从多个边缘型人格障碍受试者中收集的每种生物样品的转录分析测量的转录概况。本专利技术还提供了其为关于从多个PTSD受试者中收集的每种生物样品的转录分析测量的转录概况。本专利技术还提供了包含存储在例如数据库中的第一批多个对照受试者的集体测量的转录概况。使用分类算法使包含第二批多个受试者例如患病受试者的集体测量的转录概况与第一批多个对照受试者的转录概况比较。分类算法提供了使受试者各自分类的输出。本专利技术提供了用于诊断情感障碍的方法,通过鉴定患者中的转录概况,使此类转录概况与对照受试者或对照受试者组的概况比较,从而基于转录概况中改变的存在或不存在诊断患者的情感障碍。本专利技术的一个方面提供了用于诊断具有情感障碍的受试者的方法,其包括(a)从多个对照受试者和多个患病受试者中获得生物样品;(b)测量在多个对照受试者和多个患病受试者样品中基因的mRNA表达水平,其中所述基因选自 ADA、ARRB1、ARRB2、CD8a、CD8b、CREB1、CREB2、DPP4、ERK1、ERK2、Gi2、Gs、GR、 IL1 b、I本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种诊断测试受试者中的情感障碍的方法,所述方法包括:评估所述测试受试者的生物标记概况中的多个生物标记的多个特征是否满足值集合,其中满足所述值集合预测所述测试受试者具有所述情感障碍,并且其中所述多个特征是所述多个生物标记的可测量方面,所述多个生物标记包含表1A中列出的至少2个生物标记。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:I·安东尼耶维克
申请(专利权)人:H隆德贝克有限公司
类型:发明
国别省市:DK

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