本发明专利技术提供了用于鉴定可能与植物中的商业上相关的性状相关的核酸和多肽序列的方法，特别地，由此鉴定的核酸和多肽序列是产量基因ＥＧ８２０１３和ＥＧ８１３４５。由此鉴定的序列可用于增强栽培植物或野生祖先植物中的商业上需要的性状、鉴定相关的核酸序列、对植物进行基因分型和标志物辅助的培育。由此鉴定的序列还可用于产生异源ＤＮＡ、转基因植物和转染的宿主细胞。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及用于鉴定核酸和多肽序列的分子的和改良的技术，所述核酸和多肽序 列对应于祖先植物和栽培植物中的商业上相关的性状，例如产量；鉴定的核酸和多肽序列； 以及使用所述鉴定的核酸和多肽序列的方法。
技术介绍
人类培育植物和动物已有数千年，选择那些商业上有价值的和/或美观的性状。 栽培植物与其野生祖先或科成员的区别在于以下性状，例如，产量、花期短、蛋白和/或油 的含量、收获的容易性、味道、疾病抗性和干旱抗性。驯化的动物与其野生祖先或科成员的 区别在于以下性状，例如，脂肪和/或蛋白含量、产奶量、温顺性、生殖力和达到成熟所需的 时间。目前，促成上述差异的多数基因都是未知的，更重要的是，不知道这些基因中发生了 何种特定变化以提供这些能力。理解关于栽培的植物和驯化的动物与其野生祖先或科成 员之间的这些差异的基础将为保持和增强这些性状提供有用的信息。在农作物植物的情 况下，鉴定控制想要的性状的特定基因将允许以之前不可能的方式进行直接的和迅速的改 良O鉴定那些相对于同源的祖先的基因而言已经进化以赋予独特的、增强的或改变的 功能的驯化物种的基因可用于开发调节这些功能的试剂。鉴定潜在的驯化物种的基因和已 经发生的特定核苷酸变化以及进一步表征由这些进化的基因所编码的蛋白的物理和生物 化学变化，能够为解释想要的性状的机理提供有价值的信息。这种有价值的信息可应用于 DNA标志物辅助的培育或DNA标志物辅助的选择。或者，这种信息可用于开发进一步增强靶 蛋白功能的试剂。或者，对起负责作用的基因的进一步工程化改造可以修饰或增强想要的 性状。另外，可能发现所鉴定的基因在其它栽培植物或科成员中具有控制所关注的性状的 作用。通过人工选择，人类已经对农作物植物提供了强烈的选择压力。该压力反映在驯 化生物与其野生祖先或科成员的同源基因之间的进化上的显著变化上。已经发现仅有少数 基因控制栽培的农作物植物的商业上关注的性状，例如10-15个基因/物种。这些少数基 因通过标准的植物分子生物学方法是极其难以鉴别的。在上文所列的相关专利和申请中描述了鉴定由于驯化而发生变化的基因的方法。 DNA标志物辅助的培育(MAB)和DNA标志物辅助的选择(MAS)方法是本领域技术人员熟 知的，并且在很多公开物中有描述(参见例如Peleman and van der Voort, Breeding by Design, TRENDS inPlant Science 8(7) :330-334)。此类方法可以通过在开发新的植物品 种的过程中增强选择和引入与想要的表型相关的特定等位基因的能力而使植物培育更加 高效。现今一般使用的标志物的一个问题是，它们会通过重组与靶基因或性状分离(参见 Holland在2004年9月沈日至10月1日在澳大利亚布里斯班召开的第4届国际农作物科 学大会上的论文)。事实上，Holland举出了使用标志物比常规培育效果更好的例子，以及 常规培育提供比标志物辅助的培育结果更好的其它例子。Holland指出“标志物不可能在短时期内普遍用于操作复杂的性状，例如产量”。标志物用于操作复杂的性状例如产量所需 要的是负责此等复杂性状的具体基因，而非仅在有些时候与此等复杂性状相关的标志物。
技术实现思路
在一个实施方式中，本专利技术包括用于鉴定植物中的EG81345同源核酸序列或 EG81345等位基因的方法。该方法包括以下步骤。在一个步骤中，将植物核酸序列的至少 一部分与至少一个核酸进行比较。该核酸可以是下列任意项包含选自SEQ ID NO :31、SEQ ID NO :32、SEQ ID NO :33、SEQ ID NO :34、SEQ ID NO :35、SEQ ID NO :36、SEQ ID NO :37、 SEQ IDNO 38,SEQ ID NO 39、SEQ ID NO 40、SEQ ID NO :41、SEQ ID NO :42、SEQ ID NO :43、 SEQ ID NO :44、SEQ ID NO :45、SEQ ID NO :46、SEQ IDNO :47、SEQ ID NO :48、SEQ ID NO 49、SEQID NO :50、SEQ ID NO :51、SEQ ID NO :53、SEQ ID NO :54、SEQ ID NO 55 ；SEQ ID NO 56,SEQ IDNO :57、SEQ ID NO :59和SEQ ID NO 60的核酸的至少20个连续核苷酸的分 离的核酸；与上述核酸具有至少大约80%序列同一性并且是植物中的产量标志物或产量 基因的核酸；和任意上述核酸的互补物。该方法还包括鉴定植物中的与任意上述核酸相同 的至少一个核酸序列。该方法还可以以EG81345多肽进行。或者，该方法包括比较上述SEQ ID NO之一，或其至少20个核苷酸的部分，或其互补物，并鉴定与其具有至少大约80%序列 同一性的至少一个核酸序列。在另一个实施方式中，本专利技术包括用于鉴定植物中的EG82013同源核酸序列或 EG82013等位基因的方法。该方法包括以下步骤。在一个步骤中，将植物核酸序列的至少 一部分与至少一个核酸进行比较。该核酸可以是下列任意项包含选自SEQ ID NO=U SEQ ID NO :2、SEQ ID NO :3、SEQ ID NO :4、SEQ ID NO :6、SEQ ID NO :7、SEQ ID NO :8、SEQ ID NO 9, SEQ ID NO: 10、SEQ ID NO =IUSEQ ID NO: 12、SEQ ID NO: 13、SEQ IDNO : 14、SEQ ID NO :15, SEQ ID NO :16, SEQ ID NO :17, SEQ ID NO :18、SEQ ID NO :19, SEQ ID NO :20、SEQ ID N0:21、SEQ ID NO :22、SEQ IDNO :23、SEQ ID NO :24、SEQ ID NO :25、SEQ ID NO :26、SEQ ID NO :27, SEQ ID NO :28, SEQ ID NO :29, SEQ ID NO :30, SEQ ID NO :58 禾口 SEQ ID61 的核 酸的至少20个连续核苷酸的分离的核酸；与上述核酸具有至少大约80%序列同一性并且 是植物中的产量标志物或产量基因的核酸；和任意上述核酸的互补物。该方法还包括鉴定 植物中的与任意上述核酸相同的至少一个核酸序列。该方法还可以以EG82013多肽进行。 或者，该方法包括比较上述SEQ ID NO之一，或其至少20个核苷酸的部分，或其互补物，并 鉴定与其具有至少大约80%序列同一性的至少一个核酸序列。在另一个实施方式中，本专利技术包括用于标志物辅助的培育的方法，包括就特定的 EG81345核酸序列进行植物的标志物辅助的培育的方法。该实施方式包括以下步骤。一个 步骤包括，对于至少一种植物，将所述植物的核苷酸序列的至少一部分与本专利技术的特定的 EG81345核酸序列进行比较，所述特定的EG81345核酸序列是例如选自下列的核酸序列的 至少一部分(i)包含选自下列的核酸的核酸包含选自SEQ ID NO :31、SEQ ID NO 32,SEQ 本文档来自技高网...
【技术保护点】
１．分离的ＥＧ８１３４５核酸，其包括选自下列的核酸：ａ）选自ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９和ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０的核酸；ｂ）与ａ）中的核酸具有至少大约８０％序列同一性并且是植物中的产量基因或产量标志物的核酸。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：W·麦斯尔，
申请(专利权)人：进化基因组学公司，
类型：发明
国别省市：US
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