使用抗CD19嵌合抗原受体治疗癌症制造技术

本发明专利技术提供了例如通过与激酶抑制剂(例如，本文所述的激酶抑制剂)组合施用包含如本文所述的CD19 CAR的重组T细胞，来治疗与表达CD19相关的疾病的组合物和方法。本发明专利技术也提供本文所述的试剂盒和组合物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用抗CD19嵌合抗原受体治疗癌症本申请要求2014年4月7日提交的美国系列号61/976,396、2014年6月3日提交的美国系列号62/007,309、2014年8月12日提交的美国系列号62/036,493、2014年11月6日提交的美国系列号62/076,238、2014年12月5日提交的美国系列号62/087,888和2014年12月29日提交的美国系列号62/097,278的优先权，所述文献的内容通过引用的方式完整并入本文。序列表本申请含有已经通过电子方式以ASCII格式提交并因而通过引用方式完整并入的序列表。2015年4月6日创建的所述ASCII副本命名为N2067-7051WO_SL.txt并且大小为252,236比特。
本专利技术总体上涉及经工程化以表达嵌合抗原受体(CAR)的T细胞的用途，例如，与另一种药剂如(例如，激酶抑制剂和/或细胞因子)组合，用于治疗与表达分化抗原簇19蛋白(CD19)相关的疾病。专利技术背景许多B细胞恶性肿瘤患者用标准治疗不可治愈。此外，常规的治疗选项经常具有严重的副作用。已经在癌症中尝试免疫疗法，然而，几种障碍使得实现临床效果成为非常困难的目标。尽管已经鉴定到数百种所谓的肿瘤抗原，但是这些抗原通常从自身衍生并因此是免疫原性差的。另外，肿瘤使用几种机制使自身对抗免疫攻击的发动和扩大。最近利用嵌合抗原受体(CAR)修饰的自体T细胞(CART)疗法(其依赖于使T细胞针对癌细胞(如B细胞恶性肿瘤)上的合适细胞表面分子重定向)的开发在利用免疫系统能力治疗B细胞恶性肿瘤和其他癌症方面显示出有前景的结果(参见，例如，Sadelain等人.,CancerDiscovery3:388-398(2013))。鼠衍生的CART19(即，“CTL019”)的临床结果已经在CLL患者中以及在ALL儿童中建立完全缓解方面显示出前景(参见，例如，Kalos等人,SciTranslMed3:95ra73(2011)；Porter等人,NEJM365:725-733(2011)；Grupp等人,NEJM368:1509-1518(2013))。除基因修饰的T细胞上的嵌合抗原受体识别和摧毁靶向细胞的能力外，成功的治疗性T细胞疗法需要具有增殖和随时间推移持续存在的能力和进一步监测白血病细胞逃逸的能力。T细胞的可变性质，无论这是否为失能、抑制或疲惫所致，将影响CAR转化的T细胞的表现，但是熟练执业者此时对此仅具有有限的控制能力。为了有效，CAR转化的患者T细胞需要持续存在并维持响应于CAR的抗原而增殖的能力。已经显示ALL患者T细胞可以用包含鼠scFv的CART19做到这一点(参见，例如，Grupp等人,NEJM368:1509-1518(2013))。专利技术概述本公开至少部分地以使用免疫效应细胞(例如，T细胞或NK细胞)治疗疾病如癌症(例如，血液癌或其他B细胞恶性肿瘤)的组合物和方法为特征，所述免疫效应细胞表达嵌合抗原受体(CAR)分子，例如，与B细胞抗原(例如分化抗原簇19蛋白(CD19)(例如，OMIM登录号107265，SwissProt登录号P15391))结合的CAR。组合物包含表达靶向B细胞的CAR的免疫效应细胞(例如，T细胞或NK细胞)，并且方法包括施用这些免疫效应细胞，所述免疫效应细胞与激酶抑制剂(例如，CDK4/6抑制剂、BTK抑制剂、mTOR抑制剂、MNK抑制剂、PI3K/mTOR双重抑制剂或其组合中一者或多者)组合。在一些实施方案中，如与单独的任一种疗法相比，组合维持或具有更好的临床效果。本专利技术还涉及工程化细胞(例如，免疫效应细胞(例如，T细胞或NK细胞))表达与B细胞抗原(例如，CD19)结合的CAR分子以治疗与表达B细胞抗原(例如，CD19)相关的疾病(例如，癌症，例如，血液癌)的用途，其中所述工程化细胞与激酶抑制剂(例如，选自以下一者或多者的激酶抑制剂：细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)抑制剂、Bruton酪氨酸激酶(BTK)抑制剂、mTOR抑制剂、促分裂原活化蛋白激酶相互作用激酶(MNK)抑制剂，磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/mTOR双重抑制剂或其组合)组合。因此，在一个方面，本专利技术涉及一种治疗患有与表达B细胞抗原(例如，CD19)相关的疾病的受试者(例如，哺乳动物)的方法。该方法包括向哺乳动物施用有效量的表达结合B细胞抗原的CAR分子的细胞(例如，免疫效应细胞(例如，T细胞或NK细胞)，所述细胞与激酶抑制剂(例如，本文所述的激酶抑制剂)组合。在一个实施方案中，CAR分子与CD19结合，例如，本文所述的结合CD19的CAR分子。在其他实施方案中，CAR分子与CD20、CD22或ROR1中一者或多者结合。在一个实施方案中，与表达B细胞抗原(例如，表达CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)相关的疾病选自增生性疾病如癌症、恶性肿瘤或癌前期病状如脊髓发育不良、骨髓增生异常综合征或白血病前期，或是与表达B细胞抗原(例如，表达CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)相关的非癌相关性适应症。在一个实施方案中，疾病是实体肿瘤或液体肿瘤。在一个实施方案中，癌是胰腺癌。在一个实施方案中，疾病是血液癌。在一个实施方案中，血液癌是白血病。在一个实施方案中，癌选自一种或多种急性白血病，包括但不限于B细胞急性淋巴样白血病(BALL)、T细胞急性淋巴样白血病(TALL)、小淋巴细胞白血病(SLL)、急性淋巴样白血病(ALL)；一种或多种慢性白血病，包括但不限于慢性髓性白血病(CML)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)。额外的血液癌或血液学疾病包括但不限于套细胞淋巴瘤(MCL)、B细胞幼淋巴细胞白血病、母细胞性浆细胞样树状细胞肿瘤、Burkitt淋巴瘤、弥散性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡淋巴瘤、多毛细胞白血病、小细胞或大细胞滤泡淋巴瘤、恶性淋巴细胞增生性疾病、MALT淋巴瘤、边缘区淋巴瘤、多发性骨髓瘤、脊髓发育不良和骨髓增生异常综合征、非何杰金淋巴瘤、何杰金淋巴瘤、浆母细胞淋巴瘤、浆细胞样树状细胞肿瘤和Waldenstrom巨球蛋白血症。在某些实施方案中，与B细胞抗原(例如，CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)表达相关的疾病是“白血病前期”，其是依据髓样血细胞无效产生(或发育异常(dysplasia))而统一的血液学疾病的多样性集合。在一些实施方案中，与B细胞抗原(例如，CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)表达相关的疾病包括，但不限于表达B细胞抗原(例如，CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)的非典型和/或非经典癌症、恶性肿瘤、癌前期病状或增生性疾病。本文所述的与B细胞抗原(例如，CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)表达相关的疾病的任何组合可以用本文所述的方法和组合物治疗。在一个实施方案中，与表达B细胞抗原(例如，CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)相关的疾病是淋巴瘤，例如，MCL、何杰金淋巴瘤或DLBCL。在一个实施方案中，与表达B细胞抗原(例如，CD19、CD20、CD22或ROR1中一者或多者)相关的疾病是白血病，例如，SLL、CLL和/或ALL。在一个实施方案中，与表本文档来自技高网...

【技术保护点】
包含表达结合CD19的CAR分子的细胞(例如，细胞群体)(“表达CAR19的细胞”)的组合物，用于与一种或多种激酶抑制剂组合来治疗患有与表达CD19相关的疾病的哺乳动物，其中激酶抑制剂选自Bruton酪氨酸激酶(BTK)抑制剂、细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)抑制剂、mTOR抑制剂或促分裂原活化蛋白激酶相互作用激酶(MNK)抑制剂。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.04.07 US 61/976,396;2014.06.03 US 62/007,309;1.包含表达结合CD19的CAR分子的细胞(例如，细胞群体)(“表达CAR19的细胞”)的组合物，用于与一种或多种激酶抑制剂组合来治疗患有与表达CD19相关的疾病的哺乳动物，其中激酶抑制剂选自Bruton酪氨酸激酶(BTK)抑制剂、细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)抑制剂、mTOR抑制剂或促分裂原活化蛋白激酶相互作用激酶(MNK)抑制剂。2.治疗患有与表达CD19相关的疾病的哺乳动物的方法，包括向哺乳动物施用有效量的表达结合CD19的CAR分子的细胞(例如，细胞群体)(表达CAR19的细胞)，所述细胞与选自Bruton酪氨酸激酶(BTK)抑制剂、细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)抑制剂、mTOR抑制剂或促分裂原活化蛋白激酶相互作用激酶(MNK)抑制剂的一种或多种激酶抑制剂组合。3.根据权利要求1或2所述的用途或方法，其中将激酶抑制剂和表达CAR19的细胞作为一线疗法施用至哺乳动物。4.根据权利要求1或2所述的用途或方法，其中将表达CAR19的细胞在施用激酶抑制剂后施用至哺乳动物。5.根据权利要求4所述的用途或方法，其中：(i)将表达CAR19的细胞在停止施用激酶抑制剂后施用；或(ii)激酶抑制剂的施用在施用表达CAR19的细胞之前开始，并且表达CAR19的细胞与激酶抑制剂的持续施用组合来施用。6.根据权利要求1-4中任一项所述的用途或方法，其中哺乳动物是或经鉴定是对BTK抑制剂(例如，依鲁替尼)的完全或部分应答者或对表达CAR19的细胞的完全或部分应答者。7.根据权利要求1-6中任一项所述的用途或方法，其中BTK抑制剂选自依鲁替尼、GDC-0834、RN-486、CGI-560、CGI-1764、HM-71224、CC-292、ONO-4059、CNX-774或LFM-A13。8.根据权利要求1-6中任一项所述的用途或方法，其中CDK4抑制剂选自：帕布昔利布、aloisineA、夫拉平度、2-(2-氯苯基)-5,7-二羟基-8-[(3S,4R)-3-羟基-1-甲基-4-哌啶基]-4-色烯酮；克里唑替尼(PF-02341066，P276-00、RAF265、indisulam、roscovitine、dinaciclib、BMS387032、MLN8054、AG-024322、AT7519、AZD5438、BMS908662；或ribociclib。9.根据权利要求1-6中任一项所述的用途或方法，其中mTOR抑制剂选自：雷帕霉素、雷帕霉素类似物如依维莫司、坦罗莫司、地磷莫司、塞马莫德、AZD8055、PF04691502、SF1126、XL765或OSI-027。10.根据权利要求1-6中任一项所述的用途或方法，其中MNK抑制剂选自：CGP052088、CGP57380、尾孢酰胺、ETC-1780445-2或4-氨基-5-(4-氟苯胺基)-吡唑并[3,4-d]嘧啶。11.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中激酶抑制剂是依鲁替尼并且依鲁替尼具有每日约250mg、300mg、350mg、400mg、420mg、440mg、460mg、480mg、500mg、520mg、540mg、560mg、580mg或600mg的剂量。12.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中细胞表达包含抗CD19结合结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域的CAR分子。13.根据权利要求12所述的用途或方法，其中胞内信号传导结构域包含共刺激结构域和初级信号传导结构域。14.根据权利要求12或13所述的用途或方法，其中CAR分子包含抗CD19结合结构域，所述抗CD19结合结构域包含抗CD19结合结构域的轻链互补决定区1(LCCDR1)、轻链互补决定区2(LCCDR2)、轻链互补决定区3(LCCDR3)、重链互补决定区1(HCCDR1)、重链互补决定区2(HCCDR2)和重链互补决定区3(HCCDR3)。15.根据权利要求12-14中任一项所述的用途或方法，其中抗CD19结合结构域包含表7的鼠轻链可变区、表7的鼠重链可变区或这两者。16.根据权利要求12-15中任一项所述的用途或方法，其中抗CD19结合结构域包含SEQIDNO:5的LCCDR1、SEQIDNO:26的LCCDR2和SEQIDNO:27的LCCDR3。17.根据权利要求12-16中任一项所述的用途或方法，其中抗CD19结合结构域包含SEQIDNO:19的HCCDR1、SEQIDNO:20-23任一者的LCCDR2和SEQIDNO:24的HCCDR3。18.根据权利要求12-17中任一项所述的用途或方法，其中抗CD19结合结构域包含SEQIDNO:59的序列，或与其具有95-99％同一性的序列。19.根据权利要求12-14、16或17中任一项所述的用途或方法，其中抗CD19结合结构域是人源化抗CD19结合结构域。20.根据权利要求19所述的用途或方法，其中人源化抗CD19结合结构域包含选自：SEQIDNO:1、SEQIDNO:2、SEQIDNO:3、SEQIDNO:4、SEQIDNO:5、SEQIDNO:6、SEQIDNO:7、SEQIDNO:8、SEQIDNO:9、SEQIDNO:10、SEQIDNO:11和SEQIDNO:12的序列，或与其具有95-99％同一性的序列。21.根据权利要求19或20所述的用途或方法，其中人源化抗CD19结合结构域是scFv，所述scFv包含经接头与重链可变区连接的轻链可变区，例如，其中接头包含SEQIDNO:53的序列。22.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中CAR分子包含选自以下蛋白质的跨膜结构域：T细胞受体的α、β或ζ链、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137或CD154。23.根据权利要求22所述的用途或方法，其中跨膜结构域包含SEQIDNO:15的序列。24.根据权利要求12所述的用途或方法，其中抗CD19结合结构域通过铰链区与跨膜结构域连接，例如，其中铰链区包含SEQIDNO:14或SEQIDNO:45的序列。25.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中CAR分子包含共刺激结构域，例如，其中共刺激结构域包含选自以下的蛋白质的功能性信号传导结构域：OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)或4-1BB(CD137)，例如，其中共刺激结构域包含SEQIDNO:16或SEQIDNO:51的序列。26.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中CAR分子包含胞内信号传导结构域，例如，其中胞内信号传导结构域包含4-1BB的功能性信号传导结构域、CD3ζ的功能性信号传导结构域或这两者，或其中胞内信号传导结构域包含CD27的序列、CD3ζ的功能性信号传导结构域或这两者。27.根据权利要求26所述的用途或方法，其中胞内信号传导结构域包含SEQIDNO:16的序列、SEQIDNO:17的序列或这两者；其中胞内信号传导结构域包含SEQIDNO:16的序列、SEQIDNO:43的序列或这两者；其中胞内信号传导结构域包含SEQIDNO:51的序列、SEQIDNO:17的序列或这两者；或其中胞内信号传导结构域包含SEQIDNO:51的序列、SEQIDNO:43的序列或这两者。28.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中CAR分子还包含前导序列，例如，其中前导序列包含SEQIDNO:13的氨基酸序列。29.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，其中CAR分子包含SEQIDNO:58、SEQIDNO:31、SEQIDNO:32、SEQIDNO:33、SEQIDNO:34、SEQIDNO:35、SEQIDNO:36、SEQIDNO:37、SEQIDNO:38、SEQIDNO:39、SEQIDNO:40、SEQIDNO:41或SEQIDNO:42的氨基酸序列。30.根据前述权利要求任一项所述的用途或方法，与抑制选自以下的免...

【专利技术属性】
技术研发人员：J·布罗格顿，J·伯德，J·杜博夫斯基，J·弗拉伊塔，S·吉尔，D·格拉斯，A·约翰逊，C·H·琼，S·肯德利安，J·曼尼克，M·毛斯，L·墨菲，N·穆图萨米，D·L·波特，M·鲁艾拉，W·R·塞勒斯，M·瓦西克，
申请(专利权)人：诺华股份有限公司，宾夕法尼亚大学托管会，
类型：发明
国别省市：瑞士,CH