本发明专利技术公开了一种SLC22A1基因检测液相芯片和特异性引物，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对C117T位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对T198C位点的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；针对C86T位点的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；针对C97G位点的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26；针对C164T位点的SEQ?ID?NO.27及SEQID?NO.28；针对G123T位点的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30；针对G127A位点的SEQ?IDNO.31及SEQ?ID?NO.32；针对A148G位点的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34；和/或针对G129C位点的SEQ?ID?NO.35及SEQ?ID?NO.36；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种SLC22A1基因多态性检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
有机阳离子转运体I (0CT1，编码基因SLC22A1)是一种具有基因多态性的转运蛋白，主要分布于人的肝脏，介导一些药物、毒物和内源性化合物等一系列有机阳离子的转运。SLC22A1在许多外源性药物的吸收、分布和排泄中发挥着重要的作用。有研究表明，SLC22A1基因多态性是造成其转运功能个体差异的主要原因。目前，对SLC22A1基因多态性进行检测和分析的方法很少，主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，以上这些方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。本专利技术目标检测的SLC22A1基因突变位点，如表所示 序号 SLC22A1位点突变的内容简写~SEQ ID NO. 75的第117位核苷酸，发生C —T突变C117T 2SEQ ID NO. 75的第198位核苷酸，发生T — C突变T198C~SEQ ID NO. 76的第86位核苷酸，发生C — T突变C86T~SEQ ID NO. 76的第97位核苷酸，发生C — G突变C97G 5SEQ ID NO. 77的第164位核苷酸，发生C — T突变C164T ~6SEQ ID NO. 78的第123位核苷酸，发生G — T突变G123T ~1SEQ ID NO. 79的第127位核苷酸，发生G — A突变G127A SEQ ID NO. 79的第148位核苷酸，发生A — G突变A148G 9SEQ ID NO. 80的第129位核苷酸，发生G — C突变G129CSEQ ID NO. 75TCCTCATCTTATGCCTGCTGTCGGCTGCCTTTGCGCCCATCTGTGTGGGCATCGTCTTCCTGGGTTTCACACCTGACCACCACTGCCAGAGTCCTGGGGTGGCTGAGCTGAGCCAGCGCTGTGGCTGGAGCCCTGCGGAGGAGCTGAACTATACAGTGCCAGGCCTGGGGCCCGCGGGCGAGGCCTTCCTTGGCCAGTGCAGGCGCTATGAAGTGGACTGGAACCAGAGCGCCCTCAGCTGTGTAGACCCCCTGGCTAGCCTGGCCACCAACAGGAGCCACCTGCCGCTGGGTCCCTGCCAGGATGGCTGGGTGTATGACACGCCCGGCTCTTCCATCGTCACTGSEQ ID NO. 76GAGCAACAGCATCACCCCGCTCAGGGCTGAACGTCAGACCGAGGAAAATGCCAGATAGTGATGAGTGGTGTTCGCAGGTGTGTGCCGGAGTCCCCTCGGTGGCTGTTATCACAAAAAAGAAACACTGAAGCAATAAAGATAATGGA CCACATCGCTCAAAAGAATGGGAAGTTGCCTCCTGCTGATTTAAAGGTGAAATCTAGGAAGGGGTATCTCACATCACTGAATCTGGGGCTGGGTTCTGGTGCAGATTCGTCTGGGGCTGCCAGGGGAAAGAGCAGAACTGTGCCCCTSEQ ID NO. 77 GAAGCACGGTGGTGGCAAGGCTCACCTCCCCAGGGGCTCCCAGGTGGCTCTGCTCATGACAGCGTGAGTGTGGCTGATGCTCTCCCTCCCTCCTAGATGCTTTCCCTCGAAGAGGATGTCACCGAAAAGCTGAGCCCTTCATTTGCAGACCTGTTCCGCACGCCGCGCCTGAGGAAGCGCACCTTCATCCTGATGTACCTGTGGTGAGGGGCGTTCCTGTGCGTCTCTCCAGGCAGAATCAGCACGCTYGCCCAAGCACTGGGCTATAGATTAGAGACAGTGGAATACTCAGGTGGAAAAAGAGAAAGGGAAASEQ ID NO. 78CCTGGGAACTGTGCTGGTCAACGCGGTGTCGGGCGTGCTCATGGCCTTCTCGCCCAACTACATGTCCATGCTGCTCTTCCGCCTGCTGCAGGGCCTGGTCAGCAAGGGCAACTGGATGGCTGGCTACACCCTAAGTAATTATCATGGGGATGAGGCCAGGTCTCAGGGTAGAATGGGATGGGCCTAACGTGGGTAGGGGGTTGTTTGTGGGGTCAAGGAGCTTGCGGGGCACCAGTTCCTTGTATTTATGTGACTAGGGCAGGACATGGGCTSEQ ID NO. 79GTGCTCTATCAGGGGCTCATCCTGCACATGGGCGCCACCAGCGGGAACCTCTACCTGGATTTCCTTTACTCCGCTCTGGTCGAAATCCCGGGGGCCTTCATAGCCCTCATCACCATTGACCGCGTGGGCCGCATCTACCCCATGGCCATGTCAAATTTGTTGGCGGGGGCAGCCTGCCTCGTCATGATTTTTATCTCACCTGGTAAGTTGGTAAGTTGTCTGCTTTCATCATTTCCCAGGCAATCGAAGTGTGGGGAAAGTGTTGTGACTCTTTGATAAGCCTCTGGAATGAGAACAAAGATGAGGTGCSEQ ID NO. 80GAGCACTGGACAGCCACAGCAAGCTGCAGGTATTGGCATTGTACTTGTTTTAGCATCAGGTGAACATTTGGAAAAGTGAATCACAGAATTATCGTATTTTTTGTCCTTTGTATTTTATCAGGAACCTCGGAGTGATGGTGTGTTCCTCCCTGTGTGACATAGGTGGGATAATCACCCCCTTCATAGTCTTCAGGCTGAGGGAGGTCTGGCAAGCCTTGCCCCTCATTTTGTTTGGTAAGATTTTGTGGAGCATATATCATTCCTTCTTTTGCAGCTCGGCAGTGGGCTCAGCATGGGTGGAACTGAGTGTGAGTACTCAGTCGTATTTGTTGAGTGAAGGGAATGATATCTCTCAGTGAGTTTACAGAAGGCAAGGATGATGCATGCTCTTGGGATGTCTTCTGGCTTA
技术实现思路
本专利技术的目的之一是提供SLC22A1基因多态性检测液相芯片，该液相芯片可用于单项或者并行检测SLC22A1基因九种常见基因型C117T、T198C、C86T、C97G、C164T、G123T、G127A、A148G和G12本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种SLC22A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对SLC22A1基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对C117T位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对T198C位点的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；针对C86T位点的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；针对C97G位点的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26；针对C164T位点的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28；针对G123T位点的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30；针对G127A位点的SEQ?ID?NO.31及SEQ?IDNO.32；针对A148G位点的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34；和/或针对G129C位点的SEQ?IDNO.35及SEQ?ID?NO.36；所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.18；(B).有anti?tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti?tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti?tag序列选自SEQ?ID?NO.37～SEQ?ID?NO.54，且所述anti?tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，罗可银，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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