一种SLCO1B1基因多态性检测特异性引物和液相芯片制造技术

本发明专利技术公开了一种SLCO1B1基因多态性检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对T130C位点的SEQ?ID?NO.13和SEQ?ID?NO.14；针对T127C位点的SEQ?ID?NO.15和SEQ?ID?NO.16；针对T56C位点的SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.18；针对G107C位点的SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.20；针对A96T位点的SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22；和/或针对A132G位点的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个多态性位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种SLC01B1基因多态性检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
有机阴离子转运多肽0ATP1B1 (又称OA TP-C，0ATP2，LS Tl，编码基因SLC01B1)是一种特异性分布于肝细胞基底膜上的一种转运蛋白，和体内诸多内源性或外源性物质的肝脏摄取作用关系密切。近年来，SLC01B1基因上已陆续发现多个单核苷酸多态性(SNP)，其中有些SNP已经在体外或体内实验中证实与转运功能异常有关。目前，对SIX01B1基因多态性进行检测和分析的方法很少，主要是PCR-RFLP分析法，PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，PCR-RFLP分析法存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。本专利技术目标检测的SLC01B1基因突变位点(多态性位点)，如表所示权利要求1.一种SLC01B1基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有 (A).针对SLC01B1基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为:针对T130C位点的SEQ ID NO. 13和SEQ ID NO. 14 ;针对T127C位点的 SEQ ID NO. 15 和 SEQ ID NO. 16 ;针对 T56C 位点的 SEQ ID NO. 17 和 SEQ ID NO. 18 ;针对G107C位点的 SEQ ID NO. 19 和 SEQ ID NO. 20 ;针对A96T位点的 SEQ ID NO. 21 和 SEQ IDNO. 22 ;和/或针对A132G位点的SEQ ID NO. 23和SEQ ID NO. 24 ;所述tag序列选自SEQID NO. I SEQ ID NO. 12 (B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。2.根据权利要求I所述的SLC01B1基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对 T130C 位点的 SEQ ID NO. 37 和 SEQ ID NO. 38 ;针对 T127C 位点的 SEQ ID NO. 39 和SEQ ID NO. 40 ;针对T56C位点的 SEQ ID NO. 41 和 SEQ ID NO. 42 ;针对G107C位点的 SEQ IDNO. 43 和 SEQ ID NO. 44 ;和 / 或针对 A96T、A132G 位点的 SEQ ID NO. 45 和 SEQ ID NO. 46。3.根据权利要求I所述的SLC01B1基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为针对T130C位点的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 13组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 14组成的序列；针对T127C位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 15组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 16组成的序列；针对T56C位点的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 17组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18组成的序列；针对G107C位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19组成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20组成的序列；针对A96T位点的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21组成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQ ID NO. 22组成的序列；和/或针对A132G位点的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 23组成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 24组成的序列。4.根据权利要求I所述的SLC01B1基因多态性检测液相芯片，其特征是， (A).所述ASPE引物为针对T130C位点的由SEQID NO. I和SEQ ID NO. 13组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 14组成的序列；针对T127C位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 15组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 16组成的序列；针对T56C位点的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 17组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18组成的序列;针对G107C位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19组成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20组成的序列；针对A96T位点的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21组成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQID NO. 22组成的序列；和针对A132G位点的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 23组成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 24组成的序列； (B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).所述扩增引物为:针对T130C位点的SEQID NO. 37和SEQ ID NO. 38 ;针对T127C位点的 SEQ ID NO. 39 和 SEQ ID NO. 40 ;针对 T56C 位点的 SEQ ID NO. 41 和 SEQ ID NO. 42 ；针对G107C位点的SEQ ID NO. 43和SEQ ID NO. 44 ;和针对A96T、A132G位点的SEQ ID NO. 45和 SEQ ID NO. 46。5.根据权利要求1-4任一项所述的SLC01B1基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂为5-10个T。6.用于SLC01B1基因多态性检测的特异性引物，其特征是，所述特异性引物序列为针对T130C位点的SEQ ID NO. 13和SEQ ID NO. 14 ;针对T127C位点的SEQ ID NO. 15和SEQ IDNO. 16 ;针对 T56C位点的 SEQ ID NO. 17 和 SEQ ID NO. 18 ;针对G107C位点的 SEQ ID NO. 19和 SEQ ID NO. 20 ;针对 A96T 位点的 SEQ ID NO.本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种SLCO1B1基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对SLCO1B1基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对T130C位点的SEQ?ID?NO.13和SEQ?ID?NO.14；针对T127C位点的SEQ?ID?NO.15和SEQ?ID?NO.16；针对T56C位点的SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.18；针对G107C位点的SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.20；针对A96T位点的SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22；和/或针对A132G位点的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24；所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.12：(B).有anti?tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti?tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti?tag序列选自SEQ?ID?NO.25～SEQ?ID?NO.36，且所述anti?tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，郭靖，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：