本发明专利技术公开了一种SLCO1B3基因多态性检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对T182G位点的SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.6；和/或针对G77A位点的SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.8；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种SLC01B3 基因多态性检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
有机阴离子转运多妝0ATP1B3 (又称 organic anion-transporting polypeptide8，0ATP8，编码基因SLC01B3)，OATP1B3药物转运体在耐药和药代动力学方面起到非常重要的作用，它与药物的耐受、吸收、分布、排泄、药效发挥、以及药物毒性作用等密切相关。有研究表明，SLC01B3基因多态性与其编码蛋白的活性密切相关。目前，对SLC01B3基因多态性进行检测和分析的方法很少，主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，以上这些方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。本专利技术目标检测的SLC01B3基因突变位点(多态性位点)，如表所示权利要求1.一种SLC01B3基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有(A).针对SLC01B3基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为针对T182G位点的SEQ IDN0. 5和SEQ IDN0. 6 ;和/或针对G77A位点的 SEQID NO. 7 和 SEQ ID NO. 8 ;所述 tag 序列选自 SEQ ID NO. I SEQ ID NO. 4 ；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 12，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。2.根据权利要求I所述的SLC01B3基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对T182G位点的SEQ ID NO. 13和SEQ ID NO. 14 ;和/或针对G77A位点的SEQ IDNO. 15 和 SEQ IDN0. 16。3.根据权利要求I所述的SLC01B3基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为针对T182G位点的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 5组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ IDN0. 6组成的序列；和/或针对G77A位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 7组成的序列及由SEQID NO. 4和SEQ ID NO. 8组成的序列。4.根据权利要求I所述的SLC01B3基因多态性检测液相芯片，其特征是(A)所述ASPE引物为针对T182G位点的由SEQIDN0. I和SEQ IDN0. 5组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 6组成的序列；和/或针对G77A位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ IDN0. 7组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 8组成的序列；(B)有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 12，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).所述扩增引物为:针对T182G位点的SEQID NO. 13和SEQ ID NO. 14 ;和针对G77A位点的 SEQ ID NO. 15 和 SEQ ID NO. 16。5.根据权利要求1-4任一项所述的SLC01B3基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂为5-10个T。6.用于SLC01B3基因多态性检测的特异性引物，其特征是，所述特异性引物序列为针对 T182G 位点的 SEQ ID NO. 5 和 SEQ ID NO. 6 ;和 / 或针对 G77A 位点的 SEQ ID NO. 7 和 SEQIDN0. 8。全文摘要本专利技术公开了一种SLCO1B3基因多态性检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为针对T182G位点的SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6；和/或针对G77A位点的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。文档编号C12N15/11GK102952872SQ20111025166公开日2013年3月6日 申请日期2011年8月29日 优先权日2011年8月29日专利技术者许嘉森, 何嘉英 申请人:广州益善生物技术有限公司本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种SLCO1B3基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对SLCO1B3基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对T182G位点的SEQ?IDNO.5和SEQ?IDNO.6；和/或针对G77A位点的SEQID?NO.7和SEQ?ID?NO.8；所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.4；(B).有anti?tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti?tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti?tag序列选自SEQ?ID?NO.9～SEQ?ID?NO.12，且所述anti?tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，何嘉英，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。