白色念珠菌环介导等温扩增快速检测方法技术

技术编号:1765418 阅读:282 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及一种白色念珠菌环介导等温扩增快速检测方法。其中的试剂包括环介导等温扩增反应液、Bst DNA聚合酶和显色剂;其中的反应液含有反应缓冲液、dNTP、硫酸镁、上游内引物5-CACATTTTGGATAAGGTTCACCATT-ATAGAAACCTCAAGATTTCCGT-3、下游内引物5-TCGTGTTCGTGAAAGTGAAGATAAT-CTTTCTATCATCCAAATCGTAGA-3、上游外引物5-ACCGTTGATTTCCAATTCG-3、下游外引物5-TTAACTTGAGCCATGGAGAT-3和甜菜碱;检测白色念珠菌的方法包括真菌DNA的提取、白色念珠菌的环介导等温扩增、显色检测。本发明专利技术的特点是快速、特异性强、灵敏度高而且成本低。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种利用环介导等温扩增(LAMP)技术进行菌样的快速检测的方 法,具体是一种。
技术介绍
白色念珠菌(Canidia Albicans)属于真菌界半知菌亚门一芽孢菌纲一隐球酵 母目一隐球酵母科,是双相型单细胞酵母菌。在人体中,无症状时常表现为酵母 细胞型;侵犯组织和出现症状时常表现菌丝型。白色念珠菌是一种腐物寄生菌, 广泛存在于自然界,是人体正常菌群之一,平时生存于人体的皮肤、粘膜、消化 道及其他脏器中,当机体抵抗力降低时,白色念珠菌就会繁殖,达到一定量时, 人体就会发病,所以白色念珠菌是一种条件致病菌。妇女阴道上皮细胞糖原增加, 酸性增强时,白色念珠菌会繁殖引起阴道炎,故本病常见于孕妇、糖尿病患者及 接受雌激素治疗的患者。白色念珠菌可侵犯人体许多部位,引起(1)皮肤念珠 菌病,好发于皮肤皱褶处(腑窝、腹股沟,乳房下,肛门周围及甲沟,指间),皮 肤潮红、潮湿、发亮,有时盖上一层白色或呈破裂状物,病变周围有小水泡。(2) 粘膜念珠菌病,以鹅口疮、口角炎、阴道炎最多见,在粘膜表面盖有凝乳大小不 等的白色薄膜,剥除后,留下潮红基底,并产生裂隙及浅表溃疡。(3)内脏及中枢 神经念珠菌病,可由粘膜皮肤等处病菌播散引起,有肺炎、肠胃炎、心内膜炎、 脑膜炎、脑炎等,偶而也可发生败血症。现有的白色念珠菌的检测方法有芽管法、NGL酶法、显色培养法、普通PCR、荧 光定量PCR和直接免疫荧光法等,其中芽管法和NGL酶法均易出现假阳性,特异性 不高;PCR灵敏却有高成本。环介导等温扩增方法可弥补这些不足,目前尚未见用 环介导等温扩增方法检测白色念珠菌的报道。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种,以克服 现有技术的缺点,从而为食品安全提供科学的依据和指导作用。本专利技术的主要原理为(1)特殊设计一组可以识别靶DNA六个不同序列的两个 内引物(上游内引物和下游内引物)和两个外引物(上游外引物和下游外引物), 内引物包含靶DNA的正义链和反义链;(2)其中一个内引物首先和靶DNA杂交,随 后的链置换DNA合成在具有高度链置换活性的DNA聚合酶的参与下由一个外引物启 动,释放出单链DNA,并作为由杂交到靶的另一端的一个内引物和一个外引物启动的DNA合成模板,产生一个原始的茎环DNA; (3)内引物以原始茎环DNA做模板,启 动链置换DNA的合成,产生一个原始的茎环DNA和一个新的由两倍茎长度的茎环 DNA; (4)在等温条件下,内引物以茎环DNA为模板,通过链置换形成多个含有耙 DNA重复序列的茎环DNA,在一小时内该循环反应可使耙DNA累积到109拷贝,可通过 荧光染料来观察扩增结果。本专利技术涉及的中,包括的试剂如下 (1) - (4):(1)环介导等温扩增(LAMP)反应液 其中包括10XThermopol反应缓冲液、1.0 — 1.4 mmol/L dNTP、 4一10mmol/L 硫酸镁(MgS04)、 0.8 — 1.6[Jmol/L上游引内物(FIP)、 0. 8 — 1, 6pmol/L下游内引 物(BIP)、 0.2—0.3iJmol/L上游外引物(F3)、 0. 2—0. 3iJmol/L下游外引物(B3) 和l一1.5mol/L甜菜碱; 上游内引物5- CACATTTTGGATAAGGTTCACCATT-ATAGAAACCTCAAGATTTCCGT -3 、下游内引物5画TCGTGTTCGTGAAAGTGAAGATAAT陽CTTTCTATCATCCAAATCGTAGA-3 、 上游外引物5-ACCGTTGATTTCCAATTCG-3、 下游外引物5墨TTAACTTGAGCCATGGAGAT陽3 、其中混合物dNTP内的四种脱氧核糖核酸的质量比为dUTP:dATP:dGTP:dCTP =2:1:1:1。其中所述的10XThermopol反应缓冲液中含有200隱ol pH8.8的三羟基甲基氨 基甲烷一盐酸(Tris—HC1)、 100 mmol/L氯化钾(KC1)、 100鹏ol/L硫酸铵((NH4) 2S04)、 20咖ol/L硫酸镁(MgS04)和1X曲拉通X—100 (Triton X—100);(2) UNG酶1 U/pL;(3) Bst DNA聚合酶8 U /|jL;(4) 显色剂为10X的荧光染料SYBR GREEN I或者DNAGreen。 上面所述环介导等温扩增(LAMP)反应液每管共有22pL,其最佳组成为2. 5|JL10XThermopol反应缓冲液、1. 4yL 25mmol/L dNTP (四种脱氧核糖核酸的混合物)、 4.0pL 10iJmol/L上游内引物(FIP)、 4. OyL 10iJmol/L下游内引物(BIP)、 0. 5pL 1(Hmo1/L上游外引物(F3)、 0.5pL 10iJmol/L下游外引物(B3)、 2pL 100 mmol/L MgS04、 5|JL 5M甜菜碱和2. 1|JL ddH20 (灭菌双蒸水)。使用上述方法检测白色念珠菌,依次包括下列步骤(1) _ (3):(1) 待检样品或真菌DNA的提取提取待检样品核酸,其中提取的样品DNA 0D26。/0D28。在1.6-2.0范围内,浓度 在10-100 ng/iJL范围内。(2) 进行白色念珠菌的环介导等温扩增反应A. 在装有22pL LAMP反应液的反应管中加入2IJL待检模板DNA,和O. 5yL的UNG 酶,于恒温水浴上5(TC放置3 min, 95。C放置3—5 min,立即置于冰上1一3 min;B. 在反应管中加入1IJL Bst DNA聚合酶,并于水浴锅中恒温水浴上60—65'C 扩增反应45—90 min;C. 将水浴调到80—85'C终止反应,3—5min后取出待检;(3) 显色检测在待检的每个反应管中加入lpL显色剂,直接用肉眼观察颜色变化,反应液颜 色变为绿色,说明待检样品含有或为白色念珠菌。本专利技术是根据白色念珠菌SAP基因的六个序列设计了两个特异性内引物和两个 特异性外引物,该基因序列为白色念珠菌各不同菌株型所共有,以保证检测不同 来源的白色念珠菌的可靠性。本专利技术采用环介导等温扩增(LAMP)技术,该技术 特异性强,与PCR检测方法有相同的高灵敏度,但不需要昂贵的PCR仪,只需普通 的水浴锅即可,且结果不必用凝胶电泳方法来观察,使用荧光染料来观察即可, 简单而快速,特别适用于基层医疗机构。 具体实施例方式下列实施例进一步说明本专利技术,但不应当作对本专利技术的限制。 实施例l按下列配方制作白色念珠菌的环介导等温扩增反应液 (1) LAMP反应液含有2.5nL 10XThermopol反应缓冲液、1. 4|jL 25咖ol/L dNTP (四种脱氧核 糖核酸的混合物)、4.0iJL10iJmol/L上游内引物(FIP)、 4. O(JL 10iJmol/L下游内引 物(BIP)、 0.5|JL 10pmol/L上游外引物(F3)、 0. 5|JL 10ijmol/L下游外引物(B3)、 2|JL 100 mmol/L MgS04、 5|jL 5M甜菜碱和2. lpL ddH20 (灭菌双蒸水)。其中所述的上游内引物 5- CACATTTTGGATAAGGTTCACC本文档来自技高网
...

【技术保护点】
环介导等温扩增检测白色念珠菌的试剂,其特征是该试剂包括(1)-(4): (1)环介导等温扩增反应液: 包括10×Thermopol反应缓冲液、1.0-1.4mmol/L dNTP、4-10mmol/L硫酸镁(MgSO4)、0.8-1.6μmol/L上游引内物(FIP)、0.8-1.6μmol/L下游内引物(BIP)、0.2-0.3μmol/L上游外引物(F3)、0.2-0.3μmol/L下游外引物(B3)和1-1.5mol/L甜菜碱;其中10×Thermopol反应缓冲液含有200mmol/L pH8.8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸、100mmol/L氯化钾、100mmol/L硫酸铵、20mmol/L硫酸镁和1%曲拉通X-100; 其中,上游内引物: 5-CACATTTTGGATAAGGTTCACCATT-ATAGAAACCTCAAGATTTCCGT-3; 下游内引物: 5-TCGTGTTCGTGAAAGTGAAGATAAT-CTTTCTATCATCCAAATCGTAGA-3; 上游外引物:5-ACCGTTGATTTCCAATTCG-3; 下游外引物:5-TTAACTTGAGCCATGGAGAT-3; (2)UNG酶:1U/μL; (3)Bst DNA聚合酶:8U/μL; (4)显色剂:为10%的荧光染料SYBR GREEN I或者DNAGreen。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:雷质文贺楠姜英辉刘云国房保海李正义唐静马维兴张健祝素珍贾俊涛赵丽青
申请(专利权)人:山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心
类型:发明
国别省市:95[中国|青岛]

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1