结直肠癌相关疾病的生物标志物制造技术

本发明专利技术提供了用于预测与微生物相关的疾病(特别是结直肠癌和结直肠中的进展性腺癌)的风险的生物标志物和方法。

Biomarkers of colorectal cancer related diseases

The present invention provides biomarkers and methods for predicting the risks associated with microbial diseases (especially colorectal cancer and progression of adenocarcinoma in colorectal).

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】结直肠癌相关疾病的生物标志物相关申请的交叉引用无领域本专利技术涉及用于预测与微生物相关的疾病，特别是结直肠癌和结直肠中的进展性腺瘤的风险的生物标志物和方法。背景结直肠癌(CRC)是全球前三位最常诊断的癌症之一，是癌症死亡的主要原因。其在较发达国家的发病率较高，但在诸如东亚、西班牙和东欧等历史低风险地区，由于所谓的西方生活方式，发病率正在迅速上升。在结直肠癌的发展中，遗传学改变累积了多年，通常涉及肿瘤抑制基因腺瘤性结肠息肉病基因(APC)的丧失，以及随后分别发生在KRAS、PIK3CA和TP53中的激活或失活突变(Brenner,H.,Kloor,M.&Pox,C.P.Colorectalcancer.Lancet383,1490-502(2014)，通过引用并入本文)。虽然大多数CRC病例是散发性的，但在其出现之前通常发生异常腺瘤，该异常腺瘤可进展为恶性形式，这称为腺瘤-癌顺序。结直肠腺瘤和结直肠癌的早期诊断不仅有助于防止死亡，而且也有助于降低手术干预的费用。CRC是研究最多的与肠道微生物群相关的疾病之一。然而，该疾病的因果关系通常通过施用抗生素混合剂疗法来研究，所述抗生素混合本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于在受试者中预测或诊断与微生物群相关的疾病或确定受试者是否具有形成所述疾病的风险的生物标志物组，其包含以下生物标志物：(1)MLG 317或其一个或多个特异性片段，所述MLG 317由SEQ ID NO：933‑1052组成；(2)MLG 3770或其一个或多个特异性片段，所述MLG 3770由SEQ ID NO：1053‑1281组成；和(3)MLG 3840或其一个或多个特异性片段，所述MLG 3840由SEQ ID NO：238‑639组成；任选地，所述生物标志物组还包含以下生物标志物中的一种或多种：(4)MLG 665或其一个或多个特异性片段，所述MLG 665由SEQ ID N...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于在受试者中预测或诊断与微生物群相关的疾病或确定受试者是否具有形成所述疾病的风险的生物标志物组，其包含以下生物标志物：(1)MLG317或其一个或多个特异性片段，所述MLG317由SEQIDNO：933-1052组成；(2)MLG3770或其一个或多个特异性片段，所述MLG3770由SEQIDNO：1053-1281组成；和(3)MLG3840或其一个或多个特异性片段，所述MLG3840由SEQIDNO：238-639组成；任选地，所述生物标志物组还包含以下生物标志物中的一种或多种：(4)MLG665或其一个或多个特异性片段，所述MLG665由SEQIDNO：640-932组成；(5)MLG721或其一个或多个特异性片段，所述MLG721由SEQIDNO：120-237组成；(6)MLG1738或其一个或多个特异性片段，所述MLG1738由SEQIDNO：1471-2436组成；(7)MLG1340或其一个或多个特异性片段，所述MLG1340由SEQIDNO：2893-3067组成；(8)MLG5954或其一个或多个特异性片段，所述MLG5954由SEQIDNO：1-119组成；(9)MLG711或其一个或多个特异性片段，所述MLG711由SEQIDNO：1282-1470组成；和(10)MLG4668或其一个或多个特异性片段，所述MLG4668由SEQIDNO：2437-2892组成；优选地，所述生物标志物组包含如(1)-(8)中定义的生物标志物。2.权利要求1的生物标志物组，其中所述特异性片段的长度为至少30bp，或至少40bp，或至少50bp，或至少60bp，或至少70bp，或至少80bp，或至少90bp，或至少100bp，或至少150bp，或至少200bp，或至少250bp，或至少300bp，或至少350bp，或至少400bp，或至少450bp，或至少500bp，或至少600bp，或至少700bp，或至少800bp，或至少900bp，或至少1000bp，或至少1500bp，或至少2000bp。3.权利要求1或2的生物标志物组，其特征还在于以下项中的任一项或多项：(1)所述MLG5954的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：1-119或其任意组合；(2)所述MLG721的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：120-237或其任意组合；(3)所述MLG3840的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：238-639或其任意组合；(4)所述MLG665的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：640-932或其任意组合；(5)所述MLG317的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：933-1052或其任意组合；(6)所述MLG3770的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：1053-1281或其任意组合；(7)所述MLG711的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：1282-1470或其任意组合；(8)所述MLG1738的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：1471-2436或其任意组合；(9)所述MLG4668的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：2437-2892或其任意组合；和(10)所述MLG1340的一个或多个特异性片段选自SEQIDNO：2893-3067或其任意组合。4.权利要求1-3中任一项的生物标志物组，其中所述疾病是结直肠中的进展性腺瘤。5.权利要求1-4中任一项的生物标志物组，其中所述受试者是哺乳动物，诸如灵长类动物，优选为人。6.权利要求1-5中任一项的生物标志物组，其中所述生物标志物组用于区分患有进展性腺瘤的患者与健康受试者。7.一种用于在受试者中预测或诊断与微生物群相关的疾病，或确定受试者是否具有形成所述疾病的风险的试剂盒，其包含用于测定权利要求1-6中任一项的生物标志物组的每种生物标志物在样品中的水平或其量的试剂。8.权利要求7的试剂盒，其中所述试剂选自：(a)引物组，其包含：(a1)能够特异性扩增MLG317或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG317由SEQIDNO：933-1052组成；(a2)能够特异性扩增MLG3770或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG3770由SEQIDNO：1053-1281组成；和(a3)能够特异性扩增MLG3840或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG3840由SEQIDNO：238-639组成；任选地，所述引物组还包含以下引物的一种或多种：(a4)能够特异性扩增MLG665或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG665由SEQIDNO：640-932组成；(a5)能够特异性扩增MLG721或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG721由SEQIDNO：120-237组成；(a6)能够特异性扩增MLG1738或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG1738由SEQIDNO：1471-2436组成；(a7)能够特异性扩增MLG1340或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG1340由SEQIDNO：2893-3067组成；(a8)能够特异性扩增MLG5954或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG5954由SEQIDNO：1-119组成；(a9)能够特异性扩增MLG711或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG711由SEQIDNO：1282-1470组成；和(a10)能够特异性扩增MLG4668或其一个或多个特异性片段的一种或多种引物，所述MLG4668由SEQIDNO：2437-2892组成；优选地，所述引物组包含如(a1)-(a8)中定义的引物；(b)探针组，其包含：(b1)能够与MLG317或其一个或多个特异性片段特异性杂交的一种或多种探针，所述MLG317由SEQIDNO：933-1052组成；(b2)能够与MLG3770或其一个或多个特异性片段特异性杂交的一种或多种探针，所述MLG3770由SEQIDNO：1053-1281组成；和(b3)能够与MLG3840或其一个或多个特异性片段特异性杂交的一种或多种探针，所述MLG3840由SEQIDNO：238-639组成；任选地，所述探针组还包含以下探针的一种或多种：(b4)能够与M...

【专利技术属性】
技术研发人员：冯强，梁穗莎，贾慧珏，王俊，
申请(专利权)人：深圳华大基因研究院，
类型：发明
国别省市：广东,44