本申请公开了一种与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因及其应用。本申请的与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因，由野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变而成。本申请的APOE突变基因是阿尔茨海默病的一种新的相关的致病突变基因，该APOE突变基因或致病突变位点的发现，进一步拓展和完善了阿尔茨海默病的检测和研究，为该疾病的诊断或治疗提供了新的检测位点，以及新的检测方法和途径，也为靶点药物的开发提供了一个新的靶标位点。
APOE Mutant Gene Associated with Alzheimer's Disease and Its Application
This application discloses an APOE mutation gene associated with Alzheimer's disease and its application. The APOE mutant gene associated with Alzheimer's disease in this application is mutated by c.48G>A in the coding region of wild-type APOE gene. The APOE mutation gene in this application is a new related pathogenic mutation gene of Alzheimer's disease. The discovery of APOE mutation gene or pathogenic mutation site further expands and improves the detection and research of Alzheimer's disease, provides a new detection site for the diagnosis or treatment of the disease, as well as a new detection method and approach, and also provides a new target drug development. A new target site.
【技术实现步骤摘要】
一种与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因及其应用
本申请涉及基因领域，特别是涉及一种与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因及其应用。
技术介绍
阿尔茨海默病(Alzheimer’sdisease,缩写AD，俗称老年性痴呆)是一种起病隐匿的进行性发展的神经系统退行性疾病。临床早期表现主要为患者记忆力的减退和生活自理能力的下降，最终导致发生进行性认知功能障碍和缺失、神经行为异常，出现精神状况及生活自理能力的完全丧失，病因未明。迄今为止，阿尔茨海默病基因研究发现β-淀粉样前体蛋白(缩写APP)、早老素1和2(分别缩写为PSEN1、PSEN2)共3种致病基因；同时证实载脂蛋白E(缩写APOE)等位基因为其重要遗传因素。并且这些基因相关的阿尔茨海默病遗传模式均为常染色体显性遗传。虽然，目前在这些基因上已经发现了一些突变会导致阿尔茨海默病，但是仍然有许多患者病因未明。但是，在这些基因上或其它基因上，仍然存在很多未被发现或检测到的突变，这直接导致通过现有的检测方法不能准确地对疑似患病的患者是否患病进行准确判断，对于阿尔茨海默病的诊断、阻断疾病在家族中的遗传，以及靶点药物开发等都有很大影响。
技术实现思路
本申请的目的是提供一种新的与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因，以及该突变基因的应用。本申请采用了以下技术方案：本申请的一方面公开了一种与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因，该APOE突变基因由野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变而成。具体的，本申请的APOE突变基因的序列为SeqIDNo.1所示序列。需要说明的是，本申请在大量的研究和实践过程中发现了一种新的与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因，该APOE突变基因是野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变而成，即野生型APOE基因的编码区中，第48位碱基由G突变为了A。该突变直接导致原始编码色氨酸Trp的密码子突变为了终止密码子，即APOE突变基因最终只能编码15个氨基酸的短多肽，改变了原始多肽的结构和功能，进而导致阿尔茨海默病发生。本申请的另一面公开了一种与阿尔茨海默病相关的多肽，该多肽为野生型APOE的氨基酸序列发生p.Trp16Ter终止突变而成。其中，p.Trp16Ter终止突变，即表示原始的多肽序列中第16位为色氨酸，现在变为了终止密码子，即原始多肽序列中自第16位氨基酸起都突变缺失了，只保留了前面15个氨基酸。具体的，本申请的多肽为SeqIDNo.2所示序列。需要说明的是，本申请的多肽，实际上就是本申请的APOE突变基因编码的多肽，因此，该多肽的出现或存在是直接与阿尔茨海默病相关的。本申请的另一方面公开了本申请的APOE突变基因或本申请的多肽在制备阿尔茨海默病检测试剂、试剂盒或设备中的应用。可以理解，本申请的APOE突变基因作为一个新发现的阿尔茨海默病相关的致病突变基因，本领域技术人员可以按照现有的突变基因检测方法和技术，针对本申请的APOE突变基因序列设计检测试剂，形成试剂盒或专用检测设备，例如针对本申请的APOE突变基因序列按照常规方法设计相应的检测引物、荧光探针、基因杂交探针、锁式探针等，对阿尔茨海默病进行检测。同样的，本申请的多肽也是一种全新的物质，并且该多肽的存在与阿尔茨海默病直接相关，因此，本领域技术人员可以按照现有的蛋白质或多肽检测方法，针对本申请的多肽设计检测试剂，形成试剂盒或专用检测设备。本申请的另一方面公开了一种含有本申请的APOE突变基因的重组载体。本申请的另一方面公开了一种含有本申请的重组载体的重组细胞。可以理解，为了研究方便，完全可以将本申请的APOE突变基因插入到载体中，制成重组载体，以方便后续的研究或检测。具体的载体类型，可以根据研究目的不同而选择，例如，作为阿尔茨海默病检测的阳性对照时，载体可以选择常规的pMD18-T或pMD19-T等；至于重组载体的制备方法可以参考现有技术。同样的，重组细胞也是为了方便后续的研究或检测，将插入有本申请的突变基因的重组载体导入而成，具体宿主细胞类型可以根据研究目的不同而选择，此不做限定。本申请的再一方面公开了一种检测阿尔茨海默病的试剂盒，该试剂盒中包括检测本申请的APOE突变基因的试剂，和/或检测本申请的多肽的试剂。优选的，试剂盒中还包括本申请的重组载体。优选的，试剂盒中还包括本申请的重组细胞。优选的，本申请的试剂盒中，检测本申请的APOE突变基因的试剂包括一对扩增引物，该扩增引物的正向引物为SeqIDNo.3所示序列，反向引物为SeqIDNo.4所示序列，SeqIDNo.3：5’-TGGTCAAAAGACCTCTATGC-3’SeqIDNo.4：5’-TGATAGTGACAACTCGTGGA-3’。需要说明的是，SeqIDNo.3所示序列和SeqIDNo.4所示序列的引物，是针对野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变，这个靶标位点设计的，即引物的扩增片段中包含c.48G>A突变；在本申请的一种实现方式中，采用SeqIDNo.3所示序列和SeqIDNo.4所示序列的引物对提取的DNA进行扩增后，通过对扩增产物进行测序分析，确定是否存在c.48G>A，因此，可以将SeqIDNo.3所示序列和SeqIDNo.4所示序列的引物单独的作为检测阿尔茨海默病的试剂盒。可以理解，检测本申请的突变基因序列的试剂并不只限于SeqIDNo.3所示序列和SeqIDNo.4所示序列的引物，针对本申请的c.48G>A突变，还可以设计出更多的扩增引物，此处的扩增引物特指扩增片段包含c.48G>A突变的引物，通过这些扩增引物对DNA进行扩增后，分析扩增片段中是否含有本申请的突变，由此确认是否存在本申请的突变基因序列。此外，也可以根据c.48G>A突变设计特异性引物或特异性探针，特异性探针例如实时荧光探针、基因杂交探针、锁式探针等；而对于c.48G>A突变的确认方法也不仅限于测序，还可以通过特异性引物或特异性探针对c.48G>A突变进行确认；当然，测序是最直接、有效且准确的方法。本申请的有益效果在于：本申请的APOE突变基因是阿尔茨海默病的一种新的相关的致病突变基因，该APOE突变基因或致病突变位点的发现，进一步拓展和完善了阿尔茨海默病的检测和研究，为该疾病的诊断或治疗提供了新的检测位点，以及新的检测方法和途径，也为靶点药物的开发提供了一个新的靶标位点。附图说明图1是本申请实施例中阿尔茨海默病患者测序结果中，位于c.48G>A突变位点附近的测序峰图。具体实施方式目前虽然已经有一些阿尔茨海默病的相关致病基因研究和报道，但是，其致病基因或者基因位点突变仍然存在相当一部分的未知；因此，本申请在对阿尔茨海默病进行深入研究的基础上，发现了一种新的突变的基因，即野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变产生的突变基因，该基因突变目前暂无文献报道。下面通过具体实施例对本申请作进一步详细说明。以下实施例仅对本申请进行进一步说明，不应理解为对本申请的限制。实施例一本例选取一位阿尔茨海默病患者，对其血液样品进行外显子测序；外显子测序采用BGIExomeV4Kit59M全外显子捕获Kit，结合BGISEQ-500高通量测序平台本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因，其特征在于：所述APOE突变基因由野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变而成。
【技术特征摘要】
1.一种与阿尔茨海默病相关的APOE突变基因，其特征在于：所述APOE突变基因由野生型APOE基因的编码区发生c.48G>A突变而成。2.根据权利要求1所述的APOE突变基因，其特征在于：所述APOE突变基因为SeqIDNo.1所示序列。3.一种与阿尔茨海默病相关的多肽，其特征在于：所述多肽为野生型APOE的氨基酸序列发生p.Trp16Ter终止突变而成。4.根据权利要求3所述的多肽，其特征在于：所述多肽为SeqIDNo.2所示序列。5.根据权利要求1或2所述的APOE突变基因，或者权利要求3或4所述的多肽，在制备阿尔茨海默病检测试剂、试剂盒或设备中的应用。6.一种含有权利要求1或2所述的APOE突变基因的重组载体。7.一种含有权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：黄小燕，刘汉奎，张建国，张振馨，
申请(专利权)人：深圳华大基因研究院，
类型：发明
国别省市：广东,44
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