一种用于胃腺癌诊断的生物标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种用于胃腺癌诊断的生物标志物，所述生物标志物为LINC01234。LINC01234在胃腺癌患者中表达水平显著上调，TCGA数据库交叉验证了这种差异表达；对LINC01234进行ROC曲线分析，发现LINC01234具有较高的AUC值，以及较高的准确性和特异性，提示LINC01234可作为潜在的标记物应用于胃腺癌的早期诊断。

【技术实现步骤摘要】
一种用于胃腺癌诊断的生物标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及一种用于胃腺癌诊断的生物标志物，具体的所述生物标志物为LINC01234。
技术介绍
胃癌作为世界上具有较高发病率的一种肿瘤，对人类健康和生存产造成严重的威胁，在全球范围内胃癌的发病率和死亡率都排在恶性肿瘤的前列。胃癌在我国各种恶性肿瘤中居首位，胃癌发病有明显的地域性差别，在我国的西北与东部沿海地区胃癌发病率比南方地区明显为高。好发年龄在50岁以上，男女发病率之比为2：1。胃癌的癌变是一个多因素、多步骤、多阶段发展过程，世界范围内的统计学数据显示胃癌区域化差异也非常明显，这可能与不同地域的环境和饮食文化差异有一定关系。胃癌从组织病理学的角度可以分为两大类型：一种是普通类型的胃癌，也就是我们最常见的腺癌，腺癌根据分化程度的不同又有高、中、低等不同的分化类型，也有一些特殊分化类型的腺癌比如印戒细胞癌、粘液腺癌等。另外一种则是一些较为少见类型的胃癌，比如胃的腺鳞癌、胃的鳞状细胞癌、类癌以及未分化癌等。早期的胃癌常常没有明显的临床症状，而部分患者表现出来的反酸、恶心等不适也常常会与胃炎、胃溃疡相混淆，所以对于大多数胃癌患者而言即使肿瘤发展至局部进展期或者晚期，也没有特异性临床症状出现。在我国早期胃癌的诊断率非常低，临床常用的诊断技术如胃镜、上消化道造影、CT等由于较高的检查费用以及要承担一定的痛苦和风险很难普及，常规的血清学检查中肿瘤标记物如CEA，CA199，CA724等不论是敏感性特异性都表现的不尽人意，寻找新型肿瘤标志物一直是肿瘤研究领域的重要课题。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，简称lncRNA)是最近备受瞩目的哺乳动物转录组重要成员。随着关于lncRNA的研究日渐深入，人们逐渐发现了lncRNA的多种重要的细胞调控功能，并参与到细胞代谢、发育等多种生命过程中，包括基因印记、染色体重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和反义调控等。近年来，在肿瘤组织中陆续发现了一些异常表达的lncRNA，其作为肿瘤标志物、肿瘤治疗靶点的潜力更是日渐显现。探索lncRNA在胃癌中的作用为胃癌的诊断和治疗以及机制研究提供了新策略。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术提供了一种与胃腺癌发生发展相关的生物标志物，通过检测分子标志物的表达水平来判断患者是否患有胃腺癌或者患胃腺癌的风险，从而指导临床医生进行早期干预和治疗，提高患者的生存率和生存质量。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了检测lncRNA的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用，所述lncRNA为LINC01234。进一步，所述lncRNA在胃腺癌患者样本中表达上调。进一步，所述产品通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术的方法检测LINC01234基因的表达水平。进一步，所述核酸扩增技术选自聚合酶链式反应(PCR)、逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、转录介导的扩增(TMA)、连接酶链式反应(LCR)、链置换扩增(SDA)和基于核酸序列的扩增(NASBA)。其中，PCR需要在扩增前将RNA逆转录成DNA(RT-PCR)，TMA和NASBA直接扩增RNA。进一步，所述LINC01234包括如序列SEQIDNO.1所示核苷酸序列的多核苷酸或其片段、同系物、变体或衍生物。本专利技术提供了一种体外检测样本中LINC01234表达水平的产品，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒。进一步，所述产品包括特异性识别LINC01234的探针；或特异性扩增LINC01234的引物。本专利技术提供了体外检测样本中LINC01234表达水平的产品在制备诊断早期胃腺癌工具中的应用。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的芯片，所述产品包括固相载体，以及固定在固相载体上的寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针特异性识别LINC01234。所述固相载体包括无机载体和有机载体，所述无机载体包括但不限于有硅载体、玻璃载体、陶瓷载体等；所述有机载体包括聚丙烯薄膜、尼龙膜等。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的试剂盒，所述试剂盒包括所述试剂盒包括检测LINC01234的一种或多种试剂；和选自下组的一种或多种物质：容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂。进一步，所述试剂盒包括通过RT-PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片、高通量测序方法检测LINC01234的表达水平用试剂。本专利技术还提供了LINC01234的抑制剂在制备治疗胃腺癌的药物组合物中的应用。进一步，所述LINC01234的抑制剂包括：以LINC01234或其转录本为靶序列、且能够抑制LINC01234基因表达或基因转录的干扰分子，包括：shRNA(小发夹RNA)、小干扰RNA(siRNA)、dsRNA、微小RNA、反义核酸，或能表达或形成所述shRNA、小干扰RNA、dsRNA、微小RNA、反义核酸的构建物。附图说明图1是利用QPCR检测LINC01234在胃腺癌患者中的表达情况图；图2是利用TCGA数据库交叉验证LINC01234在胃腺癌患者中的差异表达图；图3是LINC01234在胃腺癌组织和癌旁组织中的ROC曲线图。具体的实施方式本专利技术经过广泛而深入的研究，通过高通量测序方法，检测胃腺癌标本中lncRNA在肿瘤组织和癌旁组织的表达，发现其中具有明显表达差异的lncRNA片段，探讨其与胃腺癌的发生之间的关系，从而为胃腺癌的早期检测及靶向治疗寻找更好的途径和方法。通过筛选，本专利技术发现了LINC01234在胃腺癌组织样本中显著性上调，使用生物信息学方法证明，LINC01234作为分子标志物应用于胃腺癌的早期诊断具有较高的准确性。生物标志物“生物标志物”是其在组织或细胞中的表达水平与正常或健康细胞或组织的表达水平相比发生改变的任何基因。“差异表达基因”或“基因差异表达”是指，与正常或对照用靶的表达相比，在患有胃腺癌的患者体内得到更高或更低水平的活化的基因。此外，“差异表达基因”或“差异基因表达”包括相同疾病的不同分期内得到更高或更低水平的活化的基因。这种差异可通过如多肽的mRNA水平、表面显示、分泌或其他分配上的变化而得以证明。从本专利技术的目的出发，将“差异基因表达”视为从正常的或患有疾病的受试者中，或从患有疾病的受试者的各分期中的取得的基因的表达之间存在1.5倍或以上、约4倍或以上、约6倍或以上、约10倍或以上的差异时存在的现象。本领域技术人员将认识到，本专利技术的实用性并不局限于对本专利技术的标志物基因的任何特定变体的基因表达进行定量。作为非限制性的实例，标志物基因LINC01234基因可具有SEQIDNO.1所示的核苷酸序列。在一些实施方案中，其具有与所列的序列至少70％相同或相似的cDNA序列，诸如上述所列的序列至少75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或至少99％相同或相似的cDNA序列。LINC01234基因LINC01234基因位于12号染色体长臂2区4带上，该基因目前存在5个转录本，一种代表性的人LINC01234基因的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。本专利技术中的lncRNA包括如序列SEQIDNO.1所示核苷酸序列的多核苷酸或其片段、同系物、变体或衍生物。本领域技术人员将认识到本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测lncRNA的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用，其特征在于，所述lncRNA为LINC01234。

【技术特征摘要】
1.检测lncRNA的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用，其特征在于，所述lncRNA为LINC01234。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术的方法检测LINC01234基因的表达水平。3.根据权利要求1或2任一项所述的用途，其特征在于，所述LINC01234包括如序列SEQIDNO.1所示核苷酸序列的多核苷酸或其片段、同系物、变体或衍生物。4.一种体外检测样本中LINC01234表达水平的产品，其特征在于，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒。5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，包括：特异性识别LINC01234的探针；或特异性扩增LINC01234的引物...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨承刚，宋宏涛，李曙光，
申请(专利权)人：北京泱深生物信息技术有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11