用于乳腺肿瘤的病理分级的方法和试剂盒技术

本公开为一种用于鉴定受试者的乳腺组织中的肿瘤类型的方法。该方法包括下列步骤：执行一种或多种基于核酸的测定，用于依据第一测试模块和第二测试模块鉴定从受试者获得的乳腺组织中存在的突变，各测试模块均与一个或多个基因中的至少一个预定突变的检测相关联，且各测试模块均配置为提供与组织中检测到至少一个预定突变相对应的阳性结果或与样品中不存在可检测的预定突变相对应的阴性结果；以及基于所提供的第一和第二测试模块的结果来鉴定乳腺组织的肿瘤的类型。优选地，第一测试模块与MED12基因突变和/或RARA基因突变的检测相关联，而第二测试模块与FLNA基因突变、SETD2基因突变和/或MLL2基因突变的检测相关联。

Methods and kits for pathological classification of breast tumors

The present disclosure is a method of identifying a tumor type in a breast tissue of a subject. The method comprises the following steps: performing one or more nucleic acid based assay for mutation, the proof for the existence of the first test module and test module identification from second subjects of the breast tissue, the test module and one or more genes in at least one predetermined mutation detection and associated. The test modules are configured to provide tissue detected negative results at least detectable mutations are not predetermined corresponding to a predetermined mutation corresponding to the results or with the sample; and the type of the first and second test modules are provided based on the results of identification of breast tumors. Preferably, the first test module is associated with the detection of a MED12 mutation and / or RARA gene mutation, while the second test module is associated with a FLNA mutation, a SETD2 mutation, and / or a MLL2 mutation.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于乳腺肿瘤的病理分级的方法和试剂盒
本公开涉及能够对受试者的乳腺组织进行病理分层或鉴定肿瘤类型的方法。更具体地，本公开的方法通过根据与感兴趣的突变相关联的预定测试模块检测或定位同时存在于乳腺组织中的突变来鉴定肿瘤类型、阶段或组。本公开还提供了被配置为能实现本公开的方法的试剂盒。
技术介绍
乳腺纤维上皮肿瘤是以上皮和基质成分两相增殖为特征的病种。纤维上皮性乳腺肿瘤包括纤维腺瘤(FAs)和叶状肿瘤(PTs)，其后者可以根据组织学特征1进一步细分为良性、边缘性以及恶性等级。FAs每年在世界范围内影响数百万妇女3，PTs发生的频率约占乳腺肿瘤的1％或更少，以及高达7％的亚洲乳腺癌4。与FAs相比，PTs具有更晚的中位发病年龄(35岁相对于43岁)，以及更高的局部复发倾向，远处转移也发生在一些恶性PTs中5。以前的研究表明，PTs和FAs可能高度相关4。在PTs组织病理学检查中FA类似区域并不罕见，一些研究提出了从FA到PT的克隆发展6-10。在分子水平上，最近在FAs和PTs中观察到RNA聚合酶II转录中介亚基12(MED12)外显子2的频繁突变2,11-14，而基因表达和DNA甲基化分析本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于鉴定受试者的乳腺组织中的肿瘤类型的方法，包括：执行一种或多种基于核酸的测定，从而通过第一测试模块和第二测试模块鉴定从受试者获得的乳腺组织中存在的突变，所述第一和第二测试模块中的每一个均与一个或多个基因中的至少一个预定突变的检测相关联，并且均配置为提供与组织中检测到至少一个预定突变相对应的阳性结果或与样品中不存在可检测的预定突变相对应的阴性结果，所述第一测试模块与MED12基因突变和/或RARA基因突变的检测相关联，所述第二测试模块与FLNA基因突变、SETD2基因突变和/或MLL2基因突变的检测相关联；以及基于所提供的所述第一和第二测试模块的结果，识别乳腺组织的肿瘤类型；其中，当第一测...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.01.21 SG 10201500462U1.一种用于鉴定受试者的乳腺组织中的肿瘤类型的方法，包括：执行一种或多种基于核酸的测定，从而通过第一测试模块和第二测试模块鉴定从受试者获得的乳腺组织中存在的突变，所述第一和第二测试模块中的每一个均与一个或多个基因中的至少一个预定突变的检测相关联，并且均配置为提供与组织中检测到至少一个预定突变相对应的阳性结果或与样品中不存在可检测的预定突变相对应的阴性结果，所述第一测试模块与MED12基因突变和/或RARA基因突变的检测相关联，所述第二测试模块与FLNA基因突变、SETD2基因突变和/或MLL2基因突变的检测相关联；以及基于所提供的所述第一和第二测试模块的结果，识别乳腺组织的肿瘤类型；其中，当第一测试模块和第二测试模块的结果分别为阳性和阴性时，肿瘤的类型被认为是纤维腺瘤，当第一测试模块和第二测试模块的结果均为阳性时，肿瘤的类型被认为是叶状肿瘤。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述执行一种或多种基于核酸的测定的步骤还包括第三测试模块，所述第三测试模块与NF1基因突变、RB1基因突变和/或PIK3CA基因突变的检测相关联。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第一测试模块还与受试者TERT基因突变的检测相关联。4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，当所述第一测试模块、所述第二测试模块以及所述第三测试模块的结果都为阳性时，肿瘤的类型被认为是恶性叶状肿瘤。5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述乳腺组织为基质细胞。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述MED12基因突变是位于MED12基因的外显子2的位置-8处的剪切位点突变，位于MED12基因cDNA的密码子44处的错义突变或位于MED12基因cDNA的密码子36处的错义突变。7.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述TERT基因突变对应于位于TERT基因启动子区域的-124和/或-146处的错义突变。8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述RARA基因突变对应于从其翻译的多肽中发现的p.F286del、p.F287L、p.N299H、p.R394Q、p.L409del和/或p.G289R。9.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述FLNA基因突变对应于从其翻译的多肽中发现的p.A1191T、p.S1199L、p.P1244S、p.1687-1688TV>M和/或p.S1186W。10.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述SETD2基因突变对应于从其翻译的多肽中发现的p.R1674-1675EA>D、p.K1587fs、p.Q1545*、p.Y1605fs和/或p.F1651fs。11.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述MLL2基因突变对应于从其翻译的多肽中发现的p.V5482fs、p.Q1139*、p.G2668fs、p.Q3814*和/或p.L3457fs。12.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述NF1基因突变对应于从其翻译的多肽中发现的p.K1014...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑敏展，陈文炜，陈佩云，谭静，王俊杰，林永康，黄全扬，
申请(专利权)人：郑敏展，陈文炜，陈佩云，
类型：发明
国别省市：新加坡,SG