用于结直肠癌相关疾病的生物标志物制造技术

本发明专利技术涉及用于预测与微生物群相关的疾病特别是结直肠癌(CRC)的风险的生物标志物和方法。

Biomarkers for colorectal cancer related diseases

The present invention relates to biomarkers and methods for predicting diseases associated with microbial populations, in particular colorectal cancer (CRC) risk.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于结直肠癌相关疾病的生物标志物相关申请的交叉引用无。
本专利技术涉及用于预测与微生物群有关疾病(特别是结直肠癌(CRC)相关疾病)的风险的生物标志物及方法。
技术介绍
在西方国家，结直肠癌(CRC)是第三大常见癌症，也是第二大致死的癌症(SchetterAJ,HarrisCRC(2011)AlterationsofmicroRNAscontributetocoloncarcinogenesis.SeminOncol38:734–742,通过引用并入此处)。在全世界范围内，每年都有很多人被诊断出患有CRC，也有很多患者死于此病。尽管现有的治疗手段(包括手术、放射疗法、化学疗法)对CRC具有显著的临床治疗价值，然而，手术后癌症的复发和转移使得这些治疗手段不能成功治愈结直肠癌。因此，对CRC早期的诊断不仅可以降低死亡率，还可以减少手术治疗的费用。现在诊断CRC的手段，如可屈性乙状结肠镜检查和结肠镜检查是侵入式检查，被检查的患者在受检过程中可能会感觉不舒服甚至厌恶。CRC的发展是受遗传、生理和环境因素影响的多因素过程。对于环境因素，生活方式特别是饮食摄入可能会影响到CRC发生的风险。西方饮本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的基因标志物集，其包含如SEQ ID NO：1至20所示的一种或多种基因。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.用于预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的基因标志物集，其包含如SEQIDNO：1至20所示的一种或多种基因。2.权利要求1的基因标志物集用于预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的用途，所述预测通过以下步骤：1)从受试者收集样品j并从样品中提取DNA；2)确定基因标志物集中每个基因标志物的丰度信息；和3)通过以下公式计算样品j的指数：Aij是样品j中标志物i的相对丰度，其中i指所述基因标志物集中的每个基因标志物；N是基因标志物集中所有CRC富集标志物的子集；M是基因标志物集中所有对照富集标志物的子集；和|N|和|M|分别是这两个子集中生物标志物的大小(数量)；其中大于临界值的指数表明受试者患有结直肠癌(CRC)或处于发生结直肠癌(CRC)的风险中。3.权利要求1的基因标志物集用于制备用于预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途，所述预测通过以下步骤：1)从受试者收集样品j并从样品中提取DNA；2)确定基因标志物集中每个基因标志物的丰度信息；和3)通过以下公式计算样品j的指数：Aij是样品j中标志物i的相对丰度，其中i指所述基因标志物集中的每个基因标志物；N是基因标志物集中所有CRC富集标志物的子集；M是基因标志物集中所有对照富集标志物的子集；和|N|和|M|分别是这两个子集中生物标志物的大小(数量)；其中大于临界值的指数表明受试者患有结直肠癌(CRC)或处于发生结直肠癌(CRC)的风险中。4.权利要求2或权利要求3的用途，其中所述丰度信息是通过测序方法测定的所述基因标志物集中的每个基因标志物的基因相对丰度。5.权利要求2或权利要求3的用途，其中所述丰度信息是通过qPCR方法测定的所述基因标志物集中的每个基因标志物的基因相对丰度。6.根据权利要求2-5中任一项所述的用途，其中所述临界值通过接收者操作特征(ROC)方法获得，其中所述临界值对应于AUC(曲线下面积)达到其最大值。7.权利要求2-6中任一项的用途，其中所述基因标志物集由SEQI...

【专利技术属性】
技术研发人员：冯强，张东亚，王俊，
申请(专利权)人：深圳华大基因科技有限公司，深圳华大基因研究院，
类型：发明
国别省市：广东,44