检测22个位点耳聋基因多态性的SNaPshot试剂的应用制造技术

技术编号:16262003 阅读:80 留言:0更新日期:2017-09-22 17:21
本发明专利技术提供了引物组在制备检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂中的应用,检测的耳聋基因多态性位点包括GJB2基因位点rs80338939、rs80338942、rs80338943、rs111033204、176_191del16、c.35dupG、508_511dupAACG;GJB3基因rs74315318、rs74315319;SLC26A4基因rs111033220、rs201562855、rs111033305、rs192366176、rs111033318、rs121908362、rs121908363、rs200455203、rs111033380、rs111033313、c.281C>T;线粒体DNArs267606619、rs267606617。

Application of SNaPshot reagent for detecting deafness gene polymorphism of 22 loci

The present invention provides a primer set by SNaPshot reagent was used to detect a variety of deafness gene polymorphism in the system, deafness gene polymorphism detection including GJB2 gene loci rs80338939, rs80338942, rs80338943, rs111033204, 176_191del16, c.35dupG, 508_511dupAACG, rs74315318, rs74315319; GJB3 gene; SLC26A4 gene rs111033220, rs201562855, rs111033305, rs192366176, rs111033318 rs121908363, rs200455203, rs121908362, rs111033380, c.281C>, rs111033313, DNArs267606619, rs267606617; T; mitochondria.

【技术实现步骤摘要】
检测22个位点耳聋基因多态性的SNaPshot试剂的应用
本专利技术涉及分子生物学诊断领域和遗传病领域。具体地,本专利技术提供了一种检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂盒。
技术介绍
先天性耳聋是最常见的出生缺陷之一,也是最常见的人类感觉系统疾病,发病率为0.1%-0.3%。60%的耳聋与遗传因素相关。在这些遗传因素中,主要包括GJB2、SLC26A4、GJB3基因和线粒体DNAm.1555A>G和m.1494C>T位点。在中国新生儿耳聋基因突变筛查中,GJB2基因突变具有较高的携带率,约2.6%,SLC26A4基因突变携带率约为1.9%,新生儿线粒体DNAm.1555A>G均质突变占0.1%,GJB3基因突变仅在少数患者中发现。GJB2基因编码的Cx26表达于耳蜗,位于内耳血管纹、基底膜和螺旋缘,与先天性遗传性中重度耳聋相关,GJB2基因突变后,K+进入内淋巴液的循环受到影响,导致常显或常隐感音神经性耳聋(DFNB1或DFNA3)。GJB3基因编码的Cx31是缝隙连接蛋白的一员,在耳蜗和听神经内表达,突变可导致常显或常隐非综合性耳聋、周围神经疾病伴听力丧失本文档来自技高网...
检测22个位点耳聋基因多态性的SNaPshot试剂的应用

【技术保护点】
引物组在制备检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂中的应用,引物具体序列为:管1的扩增引物:

【技术特征摘要】
1.引物组在制备检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂中的应用,引物具体序列为:管1的扩增引物:管2的扩增引物:管1的测序引物:管2的测序引物:2.权利要求1所述的应用,其中测序引物浓度比例如下:管1各测序引物的浓度:管2各测序引物的浓度:3.权利要求1或2任一项所述的试剂盒,其中扩增引物在进行扩增时,扩增试剂比例如下:其中,扩增引物的比例均为1:1。4.权利要求1或2任一项所述的试剂盒,扩增产物在进行微测序时,测序试剂比例如下:5.一种利用Snapshot技术一次性检测多个耳聋基因多态性位点的非诊断科研方法,具体包括步骤:DNA提取:以人血的采集样本进行DNA提供,具体参考公司有关《血液基因组DNA提取标准操作流程》,提取完毕的DNA计算其浓度并稀释至5-10μg/mL;试剂准备:a)配置二倍的MasterMix,这其中包括dNTP、MgCl2、热启动超保真DNA聚合酶、缓冲液,室温融化后,短暂离心;准备好合适数量的PCR反应管;b)配制权利要求1所列的扩增引物混合物:各引物的比例均为=1:1,震荡混匀;短暂离心后备用;c)反应体系配制d)震荡混匀,短暂离心后,分装23μL至标记好的PCR反应管。转移至标本制备区;加样a)若样品及质控品保存在-20℃,使用前置室温解冻,并短暂离心;b)向分装好的PCR反应管中加入10ngDNA模板,并进行稀释;c)盖好管盖后,震荡混匀,短暂离心,转移至PCR扩增区;PCR扩增:置PCR管放于PCR仪上。反应程序设置如...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵薇薇胡昌明徐艳艳陈白雪贺书香刘晶星于世辉
申请(专利权)人:广州金域医学检验中心有限公司
类型:发明
国别省市:广东,44

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