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一种用于捕食线虫丝孢菌分子鉴定的标准基因及其应用制造技术

技术编号:16261995 阅读:288 留言:0更新日期:2017-09-22 17:21
本发明专利技术涉及一种用于捕食线虫丝孢菌的标准基因序列及鉴定方法,属物种分子鉴定领域。所述标准检测COX1基因,基因序列SEQ ID NO.1。使用线粒体细胞色素氧化酶I COX1基因通用引物PenF1,AspR1进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,再用特异引物序列PenF1‑chao:ATGCTAAAGACATTGGTA,AspR1‑chao:ACGTATACCTGGACTTC进行扩增,PCR产物经过琼脂糖胶进行验证后测序。根据COX1基因的序列差异,可以快速准确的鉴定捕食线虫丝孢菌。本发明专利技术可以快速、准确的鉴定该捕食线虫丝孢菌,为动植物线虫的防治提供有力的研究工具。

A standard gene for molecular identification of nematode trapping nematodes and its use

The invention relates to a standard gene sequence and an identification method for nematode trapping nematodes, belonging to the field of molecular identification of species. The standard for detection of COX1 gene, SEQ gene sequence ID NO.1. The use of mitochondrial cytochrome oxidase I gene COX1 universal primers PenF1, AspR1 polymerase chain reaction (PCR) amplification, with specific primers of PenF1 chao:ATGCTAAAGACATTGGTA, AspR1 chao:ACGTATACCTGGACTTC amplified PCR products by agarose gel were verified after sequencing. According to the sequence difference of COX1 gene, the nematode trapping nematode could be rapidly and accurately identified. The present invention can rapidly and accurately identify the nematode trapping nematode, and provides a powerful research tool for preventing and controlling nematodes in animals and plants.

【技术实现步骤摘要】
一种用于捕食线虫丝孢菌分子鉴定的标准基因及其应用
本专利技术涉及物种分子鉴定领域,具体涉及一种用于捕食线虫丝孢菌分子鉴定的标准基因及其应用。
技术介绍
植物寄生线虫病是一类在世界范围内普遍发生的植物病害,目前已知的根结线虫种类就有70多种,危害3000多种植物,全球每年因线虫病造成的损失高达1000多亿美元。在线虫和真菌复杂的相互关系中,专门有一类真菌,它们通过营养菌丝特化的捕食器官来捕捉线虫,这一类真菌称为捕食线虫丝孢菌。根据Zhang等2014年发表的最新版专著,现今已知的捕食线虫丝孢菌有3个属96个种,分别是Arthrobotrys属54个种,Drechslerella属14个种,Dactylellina属28个种。随着漫长的进化演变,其菌丝体为适应生存环境,营养菌丝变态为各种形态独特、结构精巧的捕食器官,如粘性球、粘性网和收缩环等结构,以便捕食线虫。就目前来说,生物防治线虫无疑是最可靠最安全的手段,故捕食线虫丝孢菌在线虫生物防治领域中扮演者重要的角色,具有特殊的生态学意义和经济价值。因捕食线虫丝孢菌包含无性型属种多,物种形态特征多样及其形态可塑性,以及潜在的多元生活史,使得某本文档来自技高网...
一种用于捕食线虫丝孢菌分子鉴定的标准基因及其应用

【技术保护点】
一种捕食线虫丝孢菌的DNA条形码标准基因序列,其特征在于核苷酸序列为序列表中序列1所示的DNA分子序列。

【技术特征摘要】
1.一种捕食线虫丝孢菌的DNA条形码标准基因序列,其特征在于核苷酸序列为序列表中序列1所示的DNA分子序列。2.应用权利要求1所述的标准基因进行捕食线虫丝孢菌分子鉴定的方法,包括以下4个步骤:(1)从样品菌丝中提取基因组DNA;(2)以步骤(1)所提取的基因组DNA为模板,用捕食线虫丝孢菌COX1通用外引物扩增,再用特异性内引物进行聚合酶链式反应;(3)对步骤(2)扩增得到的DNA产物进行测序;(4)将测序结果进行人工拼接和校正,与基因序列表中的捕食线虫丝孢菌的代表菌株序列SEQIDNO.1进行同源性比对,若核苷酸差异个数在10个以下,即可将该样品鉴定为捕食线虫丝孢菌。3.根据权利要求2所述的COX1基因通用引物,其特征在于外引物序列为:正向引物PenF1:5'GACAAGAAAGGTGATTTTTATCTTC3';反向引物AspR1:5'GG...

【专利技术属性】
技术研发人员:张颖张克勤张云润董建勇蒋力力
申请(专利权)人:云南大学
类型:发明
国别省市:云南,53

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