新的抗原结合蛋白制造技术

技术编号:8719303 阅读:163 留言:0更新日期:2013-05-17 20:49
本发明专利技术涉及与MAGE-A3结合的抗原结合蛋白如抗体、编码这种抗原结合蛋白的多核苷酸、所述抗原结合蛋白的诊断应用和制备方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及与人MAGE-A3结合的抗原结合蛋白如抗体、编码这种抗原结合蛋白的多核苷酸、所述抗原结合蛋白的诊断应用和制备方法。背景 “癌症-睾丸”抗原在几 种类型的肿瘤中表达,但它们在正常组织中的表达限于睾丸,睾丸不可以将抗原递呈给T细胞,因为它们缺乏MHC(主要组织相容性复合体)I类分子的表达。因此,癌症-睾丸抗原被认为是肿瘤特异性抗原,并且是肿瘤免疫治疗的潜在目标。已知人MAGE-A3经常在各种人肿瘤中表达,包括黑色素瘤、非小细胞肺癌(NSCLC)、膀胱癌、头颈癌、鳞状食道癌和肝癌。MAGE-A3属于MAGE-A亚家族,其包括11个已知成员(MAGEA 1_6和8_12)。尽管已经报道了其他“MAGE A”(黑色素瘤抗原家族A)基因(如MAGE A7、A13_15),这些基因的表达模式提示它们是假基因(参见,例如,Chomez等,Cancer Research, 61:5544 (2001))。11个MAGE-A基因具有位于最后的外显子中的它们的整个编码序列。与MAGE-A3基因具有最高的序列相似性的MAGE-A基因是MAGE-A6,是99 %相同的,并且这两个基因之间的差异位于最后的外显子内。与MAGE-A3接下来最密切相关的两个基因是MAGE-A2和MAGE-A12。在蛋白水平上,MAGE-A6与MAGE-A3具有95%的序列同一性,MAGE-A2与MAGE-A3具有84%的序列同一性,MAGE-A12与MAGE-A3具有85%的序列同一性。(附图说明图1)。MAGE-N是MAGE家族的新成员,是从由人肝细胞癌细胞系分离的mRNA鉴定的(Wu等,Chin.J.Cell Mol.1mmunol.18:270-4 (2002))。已经报道 MAGE-N 与肝细胞癌密切相关(Dong 等,Cancer Biol.Ther.3(9): 891-8 (2004)。在预测蛋白水平,MAGE-N 与MAGE-A3和MAGE-A6具有〈85%的序列相似性。MAGE-N可能是MAGE-A3、A12和Al的组合-其中MAGE-N的N-末端区域(氨基酸1-129)与MAGE-A3的N-末端区域具有99%同一性,MAGE-N的中央区域与MAGE-A12的中央区域相比差异一个氨基酸,MAGE-N的C-末端区域与MAGE-Al的C-末端区域是相同的。专利技术简述 本专利技术提供与MAGE-A3和MAGE-A6特异性结合的抗原结合蛋白。本专利技术提供与MAGE-A3和MAGE-A6特异性结合但不与MAGE-A2或MAGE-A12结合或特异性结合的抗原结合蛋白。本专利技术提供与MAGE-A3特异性结合并包含选自SEQ ID NO: 52、58和64的CDRH3或其变体的抗原结合蛋白。本专利技术提供与MAGE-A3特异性结合并包含选自SEQ ID N0:55、61和67的⑶RL3或其变体的抗原结合蛋白。本专利技术还提供与MAGE-A3特异性结合的抗原结合蛋白,其包含: ⑴SEQ ID NO:47的重链可变区和/或SEQ ID N0:49的轻链可变区;或与SEQ IDNO: 47具有75%或更高序列同一性的变体重链可变区;或与SEQ ID NO: 49具有75%或更高序列同一性的轻链可变区; (ii)SEQ ID NO:39的重链可变区和/或SEQ ID NO:41的轻链可变区;或与SEQ IDNO: 39具有75%或更高序列同一性的变体重链可变区;或与SEQ ID NO: 41具有75%或更高序列同一性的轻链可变区;或 (iii)SEQ ID NO: 43的重链可变区;和/或SEQ ID NO: 45的轻链可变区;或与SEQ IDNO: 43具有75%或更高序列同一性的变体重链可变区;或与SEQ ID NO: 45具有75%或更高序列同一性的轻链可变区。本专利技术还提供编 码本文所定义的抗原结合蛋白的核酸分子。本专利技术还提供包含本文所定义的核酸分子的表达载体。本专利技术还提供包含本文所定义的表达载体的重组宿主细胞。本专利技术还提供用于生产本文所定义的抗原结合蛋白的方法,所述方法包括培养如上所定义的宿主细胞和回收抗原结合蛋白的步骤。本专利技术还提供通过使用MAGE-A3的分歧肽(divergent peptides)免疫而产生如本文所述的抗原结合蛋白的方法。本专利技术还提供使用如本文所述的抗原结合蛋白在人福尔马林固定的石蜡包埋组织中检测MAGE-A3和/或MAGE-A6的方法。本专利技术还提供使用如本文所述的抗原结合蛋白在人福尔马林固定的石蜡包埋组织中检测MAGE-N的方法。附图简述 图1:AMAGE-A1、A2、A3、A4、A5、A6、A8、A9、A10、A11 和 A12 的序列比较。图2:对应于MAGE-A3 (SEQ ID NO: 3)的氨基酸66-91的MAGE-A3片段的比较。肽MA3#3 (SEQ ID NO:37)中含有的氨基酸标有下划线。图3:对应于MAGE-A3 (SEQ ID NO: 3)的氨基酸137-180的MAGE-A3片段的比较。肽MA3#1 (SEQ ID NO: 35)和MA3#2 (SEQ ID NO: 36)中含有的氨基酸标有下划线。图4A:图示在用三种与KLH缀合的MAGE-A3肽的混合物免疫的小鼠的血清中相对抗-MAGE-A3抗体滴度(方案IMM-134)。在ELISA中对全长重组MAGE-A3蛋白(血清稀释度为 1:1000、1:5000、1:10,000、1:50,000、1:100,000、1:200,000 和 1:500, 000)检测方案中包括的四只小鼠中每一只的免疫前血清(Pre)和血清稀释度。以如免疫前(Pre)血清上的顺序对于小鼠1、2、3和4给出每个稀释度的结果。图4B:图示在用全长重组MAGE-A3蛋白免疫的小鼠的血清中相对抗-MAGE-A3抗体滴度(方案IMM-135)。在ELISA中对全长重组MAGE-A3蛋白(血清稀释度为1:1000、1:5000、1:10,000、1:50,000、1:100,000、1:200,000 和 1:500,000)检测方案中包括的四只小鼠中每一只的免疫前血清(Pre)和血清稀释度。以如免疫前(Pre)血清上的顺序对于小鼠1、2、3和4给出每个稀释度的结果。图5:表示免疫小鼠的血清的反应性和特异性。在ELISA中对全长重组MAGE-A3、A2和A12以及对三种与KLH缀合的MAGE-A3肽测试IMM-134的小鼠#4和IMM-135小鼠#1的血清(1:1000稀释)。对于每份测试样品,从左到右给出下述结果:MAGE-A3、MAGE-A2、MAGE-A12、肽 MA3#1、肽 MA3#2 和肽 MA3#3。图6:显示与重组MAGE-A3反应的克隆上清液的特异性分析。MAb IBl显示在6A中,16G7和23D2显示在图6B中。对重组MAGE-A3, MAGE-A2和MAGE-A12蛋白和对三种与KLH缀合的MAGE-A3肽中每一种测试克隆。对于测试的每份上清液样品,从左到右给出下述结果:MAGE-A3、MAGE-A2、MAGE-A12、肽 MA3#1、肽 MA3#2 和肽 MA3#3。“Neg”表示孔中没有抗原的阴性对照。垂直轴是通过ELI本文档来自技高网...

【技术保护点】
抗原结合蛋白,其与MAGE‑A3 和 MAGE‑A6特异性结合,但其不与MAGE‑A2或MAGE‑A12特异性结合。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2010.07.22 US 61/3667421.抗原结合蛋白,其与MAGE-A3和MAGE-A6特异性结合,但其不与MAGE-A2或MAGE-A12特异性结合。2.抗原结合蛋白,其与MAGE-A3和MAGE-A6特异性结合,但其不与MAGE-A亚家族的任何其他成员特异性结合。3.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白,其包含具有选自SEQID NO:52, SEQ IDNO: 58、SEQ ID NO:64的氨基酸序列的⑶RH3。4.根据权利要求3所述的抗原结合蛋白,其进一步包含选自如下的一个或多个或所有CDR:CDRH1 (SEQ ID NO:50)、CDRHl (SEQ ID NO:56)、CDRHl (SEQ ID NO:62)、CDRH2 (SEQID NO:51)、CDRH2 (SEQ ID NO:57),CDRHl (SEQ ID NO:63),CDRLl (SEQ ID NO:53),CDRLl(SEQ ID NO:59)、CDRLl (SEQ ID NO:65)、CDRL2 (SEQ ID NO:54)、CDRL2 (SEQ ID NO:60)、CDRL2 (SEQ ID NO:66)、CDRL3 (SEQ ID NO:55)、CDRL3 (SEQ ID NO:61)、CDRL3 (SEQ IDNO:67)。5.根据前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中CDRHl是SEQID NO:50,CDRH2 是 SEQ ID NO: 51,并且 CDRH3 是 SEQ ID NO: 52。6.根据前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中CDRHl是SEQID NO:56,CDRH2 是 SEQ ID NO: 57,并且 CDRH3 是 SEQ ID NO: 58。7.根据前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中CDRHl是SEQID NO:62,CDRH2 是 SEQ ID NO:63,并且 CDRH3 是 SEQ ID NO:64。8.根据前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中CDRLl是SEQID NO:53,CDRL2 是 SEQ ID NO: 54,并且 CDRL3 是 SEQ ID NO: 55。9.根据前述权利要求中任一`项所述的抗原结合蛋白,其中CDRLl是SEQID NO:59,CDRL2 是 SEQ ID NO:60,并且 CDRL3 是 SEQ ID NO:61。10.根据前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中⑶RLl是SEQID NO:65,CDRL2 是 SEQ ID NO:66,并且 CDRL3 是 SEQ ID NO:67。11.根据前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其进一步包含下列中的至少一个: (a)与SEQID NO:39的构架区具有75%或更高的序列同一性的重链可变区受体抗体构架; (b)与SEQID NO:43的构架区具有75%或更高的序列同一性的重链可变区受体抗体构架; (c)与SEQID NO:47的构架区具有75%或更高的序列同一性的重链可变区受体抗体构架; (d)与如SEQID N0:41中所示的构架区具有75%或更高的序列同一性的轻链可变结构域受体抗体构架; (e)与如SEQID NO:45中所示的构架区具有75%或更高的序列同一性的轻链可变结构域受体抗体构架;或 (e)与如SEQ ID N0:49中所示的构架区具有75%或更高的序列同一性的轻链可变结构域受体抗体构架。12.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白,其包含:(i)SEQ ID NO: 47的重链可变区或与SEQ ID NO: 47具有75%或更高的序列同一性的变体重链可变区,和SEQ ID NO: 49的轻 链可变区或与SEQ ID NO:49具有75%或更高的序列同一性的轻链可变区; (ii)SEQ ID NO: 39的重链可变区或与SEQ ID NO: 39具有75%或更高的序列同一性的变体重链可变区,和SEQ ID NO: 41的轻链可变区或与SEQ ID NO:41具有75%或更高的序列同一性的轻链可变区;或 (iii)SEQ ID NO: 43的重链可变区或与SEQ ID NO: 43具有75%或更高的序列同一性的变体重链可变区;和SEQ ID NO: 45的轻链可变区或与SEQ ID NO:45具有75%或更高的序列同一性的轻链可变区。13.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白,包含: (a)SEQ ID NO: 52 (GGNNGFAY)的CDRH3或具有在SEQ ID NO: 52的氨基酸残基2处的Trp取代Gly的变体; (b)SEQ ID NO:50 (SDYVffN)的CDRHl或具有在SEQ ID NO:50的氨基酸残基4处的Ala取代Val的变体;(c)SEQ ID NO: 51 (YIGHSGRTSY NPSLKS)的 CDRH2,或包含在 SEQ ID NO: 51 的第 2 个氨基酸残基处的Met或Val取代He、在SEQ ID NO: 51的第4个氨基酸残基处的Tyr取代His或在SEQ ID NO: 51的第10个氨基酸残基处的Leu取代Tyr的变体;(d)SEQ ID NO: 53 (KSSQSLLNSG NQKNYLT)的 CDRLl,或包含在 SEQ ID NO: 53 的第 5个氨基酸残基处的Asn、Asp、Thr或Glu取代Ser、在SEQ ID NO: 53的第7个氨基酸残基处StJ Asp>Tyr>Val> IIe>Ser>Asn Phe、His、Gly 或 Thr 取代 Leu、在 SEQ ID NO:53 的第 14 个氨基酸残基处的Ser、Thr、Lys或Gly取代Asn ;在SEQ ID NO: 53的第15个氨基酸残基处的Phe、Asn、Ala、His、Ser或Arg取代Tyr ;或在SEQ ID NO: 53的第16个氨基酸残基处的Met、Val、Ile或Phe取代Leu的变体;(e)SEQ ID NO:54 (WTSTRDS)的 CDRL2 ;和(f)SEQ ID NO: 55 (QNDYSYPPT)的 CDRL3,或包含在 SEQ ID NO: 55 的氨基酸残基 I 处的Ser、Gly、Phe或Leu取代Gin、在SEQ ID NO: 55的氨基酸残基2处的Gln或His取代Asn ;在 SEQ ID NO: 55 的氛基酸残基 3 处的 Asn、Phe、Gly、Ser、Arg、His、Thr、Tyr 或 Val 取代 Asp、在 SEQ ID NO: 55 的氛基酸残基 4 处的 Asn、Trp Thr、Ser、Arg、Gln、His、Ala 或 Asp取代Tyr;或在SEQ ID NO: 55的氨基酸残基5处的Glu、Asn、Gly、His、Thr、Arg、Ala取代Ser、在 SEQ ID NO: 55 的氛基酸残基 6 处的 Asp、Thr> Val、Leu、His、Asn、lie、Trp> Pro 或Ser取代Tyr ;或在SEQ ID NO: 55的氨基酸残 基8处的Leu、Tyr、Arg、Ile、Trp或Phe取代Pro的变体; 所述抗原结合蛋白结合MAGE A3。14.权利要求13的抗原结合蛋白,其包含:(a)SEQ ID NO:52 的 CDRH3 ;(b)SEQ ID NO:50 的 CDRHl ;(c)SEQ ID NO:51 的 CDRH2 ;(d)SEQ ID NO:53 的 CDRLl ;(e)SEQ ID NO:54 的 CDRL2 ;(f)SEQ ID NO:55 的 CDRL3 ; (g)重链构架,如SEQID NO:39中所述,包含第2个氨基酸残基处的Val ;第20个氨基酸残基处的Leu ;第22个氨基酸残基处的Cys ;第24个氨基酸残基处的Val ;第26个氨基酸残基处的Gly ;第29个氨基酸残基处的Ile ;第36个氨基酸残基处的Trp ;第47个氨基酸残基处的Trp或Tyr ;第48个氨基酸残基处的Met ;第69个氨基酸残基处的Ile或Met ;第71个氨基酸残基处的Arg、Lys或Val ;第76个氨基酸残基处的Asn ;第78个氨基酸残基处的Phe ;第80个氨基酸残基处的Leu ;或第92个氨基酸残基处的Cys,其中氨基酸残基使用Kabat方案编号;和 (h)轻链构架,如SEQID NO:41中所述,包含第2个氨基酸残基处的Ile、Leu或Val ;第3个氨基酸残基处的Val、Gin、Leu或Glu ;第4个氨基酸残基处的Met或Leu ;第23个氨基酸残基处的Cys ;第35个氨基酸残基处的Trp ;第71个氨基酸残基处的Tyr或Phe ;第88个氨基酸残基处的Cys,或第98个氨基酸残基处的Phe,其中氨基酸残基使用Kabat方案编号; 并且其中所述抗原结合蛋白结合MAGE A3。15.权利要求14的抗原结合蛋白,其中 (a)所述重链构架包含第2个氨基酸残基处的Val;第20个氨基酸残基处的Leu ;第22个氨基酸残基处的Cys ;第24个氨基酸残基处的Val ;第26个氨基酸残基处的Gly ;第29个氨基酸残基处的Ile ;第36个氨基酸残基处的Trp ;第47个氨基酸残基处的Trp ;第48个氨基酸残基处的Met ;第69个氨基酸残基处的Ile ;第71个氨基酸残基处的Arg ’第76个氨基酸残基处的Asn ;第78个氨基酸残基处的Phe ;第80个氨基酸残基处的Leu ;和第92个氨基酸残基处的Cys ;其中氨基酸残基使用Kabat方案编号;和 (b)所述轻链构架包含第2个氨基酸残基处的Ile;第3个氨基酸残基处的Val ;第4个氨基酸残基处的Met ;第23个氨基酸残基处的Cys ;第35个氨基酸残基处的Trp ;第71个氨基酸残基处的Phe ;第88个氨基酸残基处的Cys,和第98个氨基酸残基处的Phe,其中氨基酸残基使用Kabat方案编号。16.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白,包含: (a)SEQ ID NO:58 (QDYFDY)的CDRH3或具有在SEQ ID NO:58的氨基酸残基6处的His、Val、lie、Ser> Asp 或 Gly 取代 Tyr 的变体; (b)SEQ ID NO: 56 (TNAMS)的CDRHl,或具有在SEQ ID NO: 56的氨基酸残基2处的lie、His、Tyr、Phe、Thr、Cys、Glue 或 Asp 取代 Asn ;在 SEQ ID NO: 56 的氨基酸残基 3 处的Tyr、Trp、Gly、Thr、Leu 或 Val 取代 Ala ;在 SEQ ID NO: 56 的氨基酸残基 4 处的 Ile、Val 或Trp取代Met ;或在SEQ ID NO: 56的氨基酸残基5处的Hi S、Glu、Asn、Gin、Tyr或Thr取代Ser的变体;(c)SEQ ID NO: 57 (TITSGGGSTY YPVSVKG)的 CDRH2,或包含在 SEQ ID NO: 57 的第 I个氨基酸残基处的Gly、Tyr、Phe、Ile、Glu或Val取代Thr;在SEQ ID NO: 57的第2个氨基酸残基处的Leu、Val、Thr、Ser或Asn取代lie ^SEQ ID NO:57的第3个氨基酸残基处的Ser、Phe、Trp或His取代Thr ;在SEQ ID NO: 57的第4个氨基酸残基处的Asp、Ser或Asn取...

【专利技术属性】
技术研发人员:A贝尔格伦N布莱斯Y弗拉代RM帕尔曼捷A皮罗尔热
申请(专利权)人:葛兰素史密丝克莱恩生物有限公司
类型:发明
国别省市:比利时;BE

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