一种CYP2C8基因多态性检测特异性引物和液相芯片制造技术

本发明专利技术公开了一种CYP2C8基因检测液相芯片和特异性引物，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对A127T位点的SEQ?ID?NO.13及SEQ?ID?NO.14；针对A124G位点的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16；针对G145A位点的SEQ?ID?NO.17及SEQ?ID?NO.18；针对204delA位点的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20；针对C115G位点的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；和/或针对G315C位点的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种CYP2C8基因多态性检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
细胞色素P450酶系是一个超家族，由同源性基因编码的酶蛋白组成，在人基因组中含有57种CYP基因，编码相应的CYP酶，其中CYP1、CYP2和CYP3家族最为重要。CYP2C8是一种重要的肝脏CYP酶，占肝脏CYP总量的7%，参与I相代谢中近15%的药物催化过程，抗癌药物紫杉醇是CYP2C8的特异性代谢底物，紫杉醇的6a-羟基化反应是CYP2C8体外检测最常用的标志反应，同时，CYP2C8也是肝肾中将花生四烯酸转化为具有活性的二十碳三烯酸的主要CYP酶。·CYP2C8编码基因为30kb，其开方阅读框编码490个氨基酸，在其开方阅读框区域内，已发现很多单核苷酸多态性(SNPs)位点，该多态性位点与药物的代谢相关。本专利技术目标检测的CYP2C8基因突变位点(多态性位点)，如表所示权利要求1.一种CYP2C8基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有 (A).针对CYP2C8基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为针对A127T位点的SEQ ID NO. 13及SEQ ID NO. 14 ;针对A124G位点的 SEQ ID NO. 15 及 SEQ ID NO. 16 ;针对 G145A 位点的 SEQ ID NO. 17 及 SEQ ID NO. 18 ；针对 204delA 位点的 SEQ ID NO. 19 及 SEQ ID NO. 20 ;针对 C115G 位点的 SEQ ID NO. 21 及SEQ IDNO. 22 ;和 / 或针对 G315C 位点的 SEQ ID NO. 23 及 SEQ ID NO. 24 ;所述 tag 序列选自 SEQ IDNO. I SEQ ID NO. 12 ； (B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。2.根据权利要求I所述的CYP2C8基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对 A127T 位点的 SEQ ID NO. 37 及 SEQ ID NO. 38 ;针对 A124G 位点的 SEQ ID NO. 39及 SEQ IDNO. 40 ;针对 G145A、204delA 位点的 SEQ ID NO. 41 及 SEQ ID NO. 42 ;针对 C115G位点的 SEQID NO. 43 及 SEQ ID NO. 44 ;和 / 或针对 G315C 位点的 SEQ ID NO. 45 及 SEQ IDNO. 46。3.根据权利要求I所述的CYP2C8基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物是针对A127T位点的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 13组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ IDNO. 14组成的序列；针对A124G位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 15组成的序列及由SEQ IDNO. 4和SEQ ID NO. 16组成的序列；针对G145A位点的由SEQ ID NO. 5和SEQID NO. 17组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18组成的序列；针对204delA位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19组成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20组成的序列；针对C115G位点的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21组成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQ ID NO. 22组成的序列；和/或针对G315C位点的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 23组成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 24组成的序列。4.根据权利要求I所述的CYP2C8基因多态性检测液相芯片，其特征是， (A).所述ASPE引物是针对A127T位点的由SEQID NO. I和SEQ ID NO. 13组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 14组成的序列；针对A124G位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ IDNO. 15组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 16组成的序列；针对G145A位点的由SEQ IDNO. 5和SEQ ID NO. 17组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 18组成的序列；针对204delA位点的由SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 19组成的序列及由SEQ ID NO. 8和SEQ ID NO. 20组成的序列；针对C115G位点的由SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 21组成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQ ID NO. 22组成的序列；和针对G315C位点的由SEQ ID NO. 11和SEQ ID NO. 23组成的序列及由SEQ ID NO. 12和SEQ ID NO. 24组成的序列； (B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 25 SEQ ID NO. 36，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).所述扩增引物为:针对A127T位点的SEQID NO. 37及SEQ ID NO. 38 ;针对A124G位点的 SEQ ID NO. 39 及 SEQ ID NO. 40 ;针对 G145A、204delA 位点的 SEQ ID NO. 41 及 SEQIDNO. 42 ;针对 Cl 15G 位点的 SEQ ID NO. 43 及 SEQ ID NO. 44 ;和针对 G315C 位点的 SEQ IDNO. 45 及 SEQ ID NO. 46。5.根据权利要求1-4任一项所述的CYP2C8基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂为5-10个T。6.一种用于CYP2C8基因多态性检测的特异性引物，其特征是，所述特异性引物为针对 A127T 位点的 SEQ ID NO. 13 及 SEQ ID NO. 14 ;针对 A124G 位点的 SEQ ID NO. 15 及 SEQID NO. 16 ;针对 G145A 位点的 SEQ ID NO. 17 及 SEQ ID NO. 18 ;针对 204delA 位点的 SEQID NO. 19 及 SEQID NO. 20 ;针对 C115G 位点的 SEQ ID NO. 21 及 SEQ ID NO. 22 ;和 / 或针对G315C 位点的 SEQ ID本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种CYP2C8基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对CYP2C8基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对A127T位点的SEQ？ID？NO.13及SEQ？ID？NO.14；针对A124G位点的SEQ？ID？NO.15及SEQ？ID？NO.16；针对G145A位点的SEQ？ID？NO.17及SEQ？ID？NO.18；针对204delA位点的SEQ？ID？NO.19及SEQ？ID？NO.20；针对C115G位点的SEQ？ID？NO.21及SEQ？IDNO.22；和/或针对G315C位点的SEQ？ID？NO.23及SEQ？ID？NO.24；所述tag序列选自SEQ？IDNO.1～SEQ？ID？NO.12；(B).有anti？tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti？tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti？tag序列选自SEQ？ID？NO.25～SEQ？ID？NO.36，且所述anti？tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，邹凤文，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：