用于对肝细胞癌复发进行诊断的单核苷酸多态性制造技术

本发明专利技术涉及用于对肝细胞癌复发进行诊断的单核苷酸多态性（SNP），其中，所述SNP显示出与肝细胞癌术后复发风险的显著相关性。因此，可将所述SNP用于开发对肝细胞癌复发进行诊断的微阵列或诊断试剂盒；以及用于筛选预防肝细胞癌复发的药物，从而预防肝细胞癌的术后复发。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及用于对肝细胞癌术后复发进行预测的单核苷酸多态性(SNP)、使用该SNP对肝细胞癌复发进行预测的微阵列或测试试剂盒、以及筛选减少肝细胞癌复发的药物的方法。
技术介绍
从癌症发育和死亡的角度来看，在韩国，肝细胞癌(HCC)是所有恶性肿瘤中第三常见且严重的癌症。肝细胞癌是最富血管性的肿瘤之一。对HCC进行治疗的最有效的方式是外科切除术或肝移植。然而，由于不能移除的肿瘤的大小和数量、肝功能不良、各种肝内转移或肝外转移等原因，只有10%-20%的肝细胞癌患者能进行手术。即使对于可进行手术的肝细胞癌患者来说，频繁的术后复发也是长期 生存率的主要限制因素。肝细胞癌的发育和快速发展涉及多种机制。其中，通过缺氧促进血管生成起了非常重要的作用。另外，在肝中的缺氧环境下，转移性肿瘤抗原I (MTAl)通过在结构上使缺氧诱导因子I (HIF I)稳定来增强血管内皮生长因子(VEGF)的表达，从而有助于恶性肿瘤的血管生成(MoonEJ 等，2004 ；Moon EJ 等，2006)。同时，在感染乙型肝炎病毒后，约有5%_10%变成慢性乙型肝炎，其中一些可能会发展成肝硬化或肝细胞癌。像这样，可以理解的是，感染乙型肝炎病毒后所表现出的各种临床发展取决于每个个体的遗传易感性(genetic predisposition)的差异和病毒自身的差巳遗传易感性意味着在个体间的不同基因中存在细微差异。近年来，通过基因组研究报道了不同个体间的差异水平。在遗传变异中，已知单核苷酸多态性(SNP)改变基因功能，并且迄今为止在人类基因组中已报道了约1100万个SNP中的710，000个多态性(NCBI，dbSNP)。近年来，为了确定碱基序列中的细微变化是否确实影响对某些疾病的敏感性(susceptibilities)、以及为了发现对疾病易感的遗传变异，正在积极地进行着大量研究(Ludwig JA 和 Weinstein JN, 2005 ；Suh Y 和 Vijgj，2005 ;Chanock S，2001)。
技术实现思路
技术问题为解决传统技术中的上述问题，本专利技术人发现SNP表现出与肝细胞癌术后的复发具有有意义的相关性。由此完成了本专利技术。因此，本专利技术的目的是提供用于对肝细胞癌术后复发进行预测的单核苷酸多态性(SNP)0另外，本专利技术的另一目的是提供使用单核苷酸多态性(SNP)对肝细胞癌复发进行预测的微阵列。另外，本专利技术的另一目的是提供对肝细胞癌复发进行预测的测试试剂盒。另外，本专利技术的另一目的是提供使用单核苷酸多态性(SNP)对肝细胞癌复发进行预测的方法。另外，本专利技术的另一目的是提供使用单核苷酸多态性(SNP)筛选预防肝细胞癌复发的药物的方法。技术方案为实现上述目的，本专利技术的示例性实施方式提供了用于对肝细胞癌复发进行预测的单核苷酸多态性(SNP)，其中，所述SNP包括选自于由下列多核苷酸或者它们的互补核苷酸所组成的组中的至少一种多核苷酸IGF2基因的-291C/G(rs3213221)中的C等位基因(CC基因型或GC基因型);IGF2基因的-13021C/T(rs3741208) 中的T等位基因(CT基因型或TT基因型)；FGF2基因的66378C/T (rsl048201) 中的T等位基因(CT基因型或TT基因型);FGF2基因的50012A/G (rs6534367) 中的G等位基因(GG基因型或GA基因型)；IGF2基因的6310 (rs2585) /4702 (rs3802971) 中的 GC 单倍型；IGF2 基因的-11228 (rs2239681)/-13021 (rs3741208) 中的纯合 CC 单倍型；以及 IGF2 基因的-11228 (rs2239681) /-13021 (rs3741208) 中的 CT 单倍型。肝细胞癌的复发可能与经根治性外科切除术治疗的HCC患者的根治性外科切除术后的肝细胞癌复发相关。另外，本专利技术的示例性实施方式提供了用于对肝细胞癌复发进行预测的微阵列，其中，所述微阵列包含用于对根治性外科切除术后的肝细胞癌复发进行预测的单核苷酸多态性(SNP)的多核苷酸、由该多核苷酸编码的多肽或其cDNA。另外，本专利技术的示例性实施方式提供了用于对肝细胞癌复发进行预测的测试试剂盒，所述试剂盒包含所述微阵列。除本专利技术的微阵列外，本专利技术所述的测试试剂盒可进一步包含引物组，所述引物组用于从临床样本中分离和扩增出包含相关SNP的DNA。另外，本专利技术的实施方式提供了用于对肝细胞癌复发进行预测的测试试剂盒，所述试剂盒利用单碱基延伸(SBE)反应对SNP进行基因分型。对利用单碱基延伸反应来预测肝细胞癌复发的测试试剂盒进行设计，以证实是否存在下述基因型IGF2基因的-291C/G(rs3213221)中的C等位基因(CC基因型或 GC 基因型);IGF2 基因的-13021C/T (rs3741208) 中的 T 等位基因(CT基因型或 TT 基因型);IGF2 基因的 6310 (rs2585) /4702 (rs3802971) 中的纯合GC单倍型；以及 IGF2基因的-11228(rs2239681)/-13021(rs3741208) 中的 CT 单倍型。本专利技术的实施方式提供了用于对肝细胞癌复发进行预测的测试试剂盒，所述试剂盒利用了单碱基延伸反应，所述试剂盒包含用于扩增IGF2基因的-13021 (rs3741208)区的正向引物；用于扩增IGF2基因的-13021 (rs3741208)区的反向引物；用于对IGF2基因的-13021 (rs3741208)区进行基因分型的引物；用于扩增IGF2基因的6310 (rs2585)区的正向引物；用于扩增IGF2基因的6310(rs2585)区的反向引物；用于对IGF2基因的6310(rs2585)区进行基因分型的引物；用于扩增IGF2基因的-11228 (rs2239681)区的正向引物；用于扩增IGF2基因的-11228 (rs2239681)区的反向引物；用于对IGF2基因的-11228(rs2239681)区进行基因分型的引物；用于扩增IGF2基因的4702 (rs3802971)区的正向引物；用于扩增IGF2基因的4702 (rs3802971)区的反向引物；用于对IGF2基因的4702(rs3802971)区进行基因分型的引物；用于扩增IGF2基因的-291C/G (rs3213221)区的正向引物；用于扩增IGF2基因的-291C/G(rs3213221)区的反向引物；以及用于对IGF2基因的-291C/G (rs3213221)区进行基因分型的引物。根据实施方式，在用于对肝细胞癌复发进行预测的测试试剂盒中，用于扩增IGF2基因的-13021 (rs3741208)区的正向引物可为引物SEQ IDN0. 17 ;用于扩增IGF2基因的-13021 (rs3741208)区的反向引物可为引物SEQ ID NO. 18 ;用于对IGF2基因的-13021(rs3741208)区进行基因分型的引物可为引物SEQ ID NO. 35 ;用于扩增IGF2基因的6310(rs2585)区的正向引物可为引物SEQ ID NO. 20 ;用于扩增IGF2基因的6本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑永化，维银实，李荣柱，金精我，李宗殷，
申请(专利权)人：蔚山大学校产学协力团，
类型：
国别省市：