【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种辅助诊断原发性肝细胞癌的检测试剂盒,尤其是涉及一种可用于检测肝癌相关基因TM4SF1和NPY基因启动子区特异性位点甲基化水平的试剂盒及其应用。
技术介绍
肝癌是全球范围内致死率排名第三的恶性肿瘤,也是我国位居第二的癌症“杀手”。目前对肝癌的治疗主要以手术、放化疗为主,同时结合免疫治疗、中医等其他治疗方法;但由于对于肝癌的发病机制尚不明确及缺乏有效的治疗靶点,中后期的病人治疗效果不佳,生存率低。研究表明,肝癌发生发展是一个表观遗传学调控的过程。DNA甲基化是目前表观遗传学研究的热点之一,它是指在DNA甲基转移酶(DNAmethyltransferase,DNMT)介导下,以S-腺苷蛋氨酸为甲基供体,将甲基基团转移到DNA某些碱基上的过程。DNA甲基化异常被认为是发生肿瘤的一个重要原因。研究肝癌相关基因特异性位点甲基化的改变,有助于了解肝癌的发病机理,为肝癌的预防和治疗提供有效的作用靶点。TM4SF1(transmembrane4Lsixfamilymember1,四跨膜蛋白超家族成员1)基因位于3号染色体长臂,是细胞膜上的糖蛋白,调节细胞的发育、 ...
【技术保护点】
一种可用于检测与原发性肝细胞癌相关的TM4SF1基因启动子区特异位点甲基化水平的试剂盒,其特征在于:焦磷酸测序法定量检测TM4SF1基因特异性甲基化位点cg06800962,特异性甲基化位点的引物,包括PCR引物和甲基化测序引物,其中,PCR上游引物序列如SEQ ID NO.1所示:5’‑GAGAAGGTTGTTGGGAAAATTATAGA‑3’;下游引物序列如SEQ ID NO.2所示:biotin‑5′‑CCAACCTTTCTAAACCCTTTATATTAACT‑3;甲基化测序引物序列如SEQ ID NO.3所示:5′‑TGTTTATAGTAAGTTTTGTAGG‑3′。
【技术特征摘要】
1.一种可用于检测与原发性肝细胞癌相关的TM4SF1基因启动子区特异位点甲基化水平的试剂盒,其特征在于:焦磷酸测序法定量检测TM4SF1基因特异性甲基化位点cg06800962,特异性甲基化位点的引物,包括PCR引物和甲基化测序引物,其中,PCR上游引物序列如SEQIDNO.1所示:5’-GAGAAGGTTGTTGGGAAAATTATAGA-3’;下游引物序列如SEQIDNO.2所示:biotin-5′-CCAACCTTTCTAAACCCTTTATATTAACT-3;甲基化测序引物序列如SEQIDNO.3所示:5′-TGTTTATAGTAAGTTTTGTAGG-3′。2.权利要求1所述肝癌相关的TM4SF1基因特异性甲基化位点的应用,其特征在于:应用焦磷酸测序对TM4SF1基因cg06800962位点甲基化程度检测中,原发性肝细胞癌与对应的癌旁组织存在显著性差异;该位点在原发性肝癌中甲基化程度显著降低;该位点甲基化定量信息的测定,有助于开发肝癌的辅助检...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨小丽,张悦宁,李佳桐,刘坤,张成东,
申请(专利权)人:杨小丽,
类型:发明
国别省市:广西;45
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