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一种杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系及应用制造技术

技术编号:12171143 阅读:121 留言:0更新日期:2015-10-08 04:21
本发明专利技术属于生物技术领域,特别涉及一种杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系及应用。引物及探针序列:5’-ggttgaacagtctaccctcc-3’(上游);5’-gctaacatactactacgcaaaa-3’(下游):5’-tctcttcacgtaggtggtgtctcttcaatt-3’(探针)。采用杂色蛤物种特异性检测引物与探针进行实时荧光PCR扩增杂色蛤的CoxⅠ基因,实时荧光PCR扩增后会产生一条特异性扩增曲线,从而将杂色蛤成分进行特异性鉴定。本发明专利技术特异性引物、探针设计合理,用于杂色蛤物种检测,特异性好,检测灵敏度高,即经过荧光PCR分析,即可将杂色蛤成分进行准确鉴定,具有很好的特异性。

【技术实现步骤摘要】
【专利说明】-种杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系及应用
本专利技术属于生物
,特别涉及一种杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体 系及应用。
技术介绍
杂色蛤是贝壳类海产品,隶属帘蛤科,学名菲律宾蛤仔,南方俗称花蛤,辽宁称蚬 子,山东称蛤蜊。杂色蛤广泛分布在我国南北海区,它生长迅速,养殖周期短,适应性强(广 温、广盐、广分布),离水存活时间长,是一种适合于人工高密度养殖的优良贝类,是我国主 要海产经济贝类之一。通过形态学特征进行判断是对杂色蛤识别的传统方法,但是这些形 态学特征的可塑性强,受环境影响大,具有人为的主观倾向性,且存在丰富的近缘物种,近 缘种间的形态差异细微,所以传统的形态学特征识别方法存在识别困难与识别错误的问 题。 快速进化并呈母系遗传的线粒体DNA是种群遗传学和进化遗传学的理想研宄对 象。杂色蛤与其它近源物种的序列相似度在85-94%之间,而CoxI基因序列有较大差异, 目前,贝类动物的分子检测主要集中于这一序列。采用DNA技术鉴定动物物种是物种识别 方法中最为热门也是发展最快的分子技术。实时荧光PCR是DNA技术鉴定中快捷高效的技 术之一,指在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总 量的方法,研宄利用实时荧光PCR对杂色蛤进行物种识别对杂色蛤的物种保护及系统发育 研宄等领域均具有重大意义。
技术实现思路
本专利技术的目的是克服上述不足问题,提供一种杂色蛤物种特异性检测体系及该特 异性检测体系的应用方法。本专利技术可以检测出来自动物样品的微量DNA,完全区分杂色蛤的 基因与其它贝类动物基因,检测灵敏度高,方法快速,易操作。 本专利技术为实现上述目的所采用的技术方案是:一种杂色蛤物种实时荧光PCR特异 性检测体系,其特征在于:包括引物与探针的序列是: 上游引物:5' -ggttgaacagtctaccctcc-3' ; 下游引物:5' -gctaacatactactacgcaaaa_3' ; 探针:5> -tctcttcacgtaggtggtgtctcttcaatt_3,〇 进一步地,所述探针的5'端标记FAM荧光基团,3'端标记荧光淬灭基团。 进一步地,所述杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系还包括由其他试剂所组 成的反应体系如下表1 : 表1杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的反应体系 进一步地,所述杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的反应参数如下表2 : 表2杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的反应参数 一种根据所述的杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的应用,其特征在于: 利用所述杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系对杂色蛤物种进行实时荧光PCR特异性 检测。 进一步地,所述杂色蛤物种进行实时荧光PCR特异性检测方法为:采用杂色蛤 物种实时荧光PCR特异性检测组合物进行实时荧光PCR扩增杂色蛤的CoxI基因,以 HotstartTaqDNA聚合酶进行PCR反应,当DNA链延伸到杂色蛤物种特异性检测探针位置 时,以HotstartTaqDNA聚合酶的5'端外切酶活性切断杂色蛤物种特异性检测探针的淬 灭基团,使杂色蛤物种特异性检测探针发出荧光信号,经信号收集处理,获得特异性扩增曲 线。 本专利技术特异性引物设计合理,用于杂色蛤物种检测,特异性好,检测灵敏度高。采 用本方法检测杂色蛤动物成分结果显示,采用杂色蛤物种特异性检测引物与探针进行实时 荧光PCR扩增杂色蛤的CoxI基因,会产生一条特异性扩增曲线,即经过实时荧光PCR分 析,即可将杂色蛤成分进行准确鉴定,具有很好的特异性。【附图说明】 图1为5种引物PCR结果图,图中:M、DL2000marker;1、P1P2引物扩增结果,2、P3P4 引物扩增结果,3、P5P6引物扩增结果,4、P7P8引物扩增结果,5、P9P10引物扩增结果,6、阴 性对照,7、空白对照。 图2为杂色蛤实时荧光PCR特异性检测结果图,图中:1、杂色蛤,2、杂色蛤,3、阴性 对照,4、空白对照。 图3为杂色蛤与其他海洋动物的实时荧光PCR特异性检测结果图,图中:1、杂色蛤, 2、杂色蛤,3、杂色蛤,4、夏夷扇贝,5、紫海胆,6、太平洋牡蛎,7、魁蚶,8、阴性对照,9、空白对 照。 图4为灵敏度分析结果图,图中:1、5ng/yL扩增结果;2、lng/yL扩增结果;3、 0. 5ng/yL扩增结果;4、0.lng/yL扩增结果;5、0. 05ng/yL扩增结果;6、阴性对照;7、空 白对照。【具体实施方式】 下面结合附图和实施例对本专利技术进行详细说明,但本专利技术并不局限于具体实施 例。 本实施例中所利用的杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系包括引物与探针 的序列是: 5' -ggttgaacagtctaccctcc-3'(上游); 5' -gctaacatactactacgcaaaa-3'(下游); 5' -tctcttcacgtaggtggtgtctcttcaatt-3'(探针)。 所述杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系还包括由其他试剂所组成的反应 体系如下表3 : 表3杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的反应体系 所述杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的反应参数如下表4 : 表4杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的反应参数 一种所述杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系的应用,即利用所述杂色蛤物 种实时荧光PCR特异性检测体系对杂色蛤物种进行实时荧光PCR特异性检测,具体步骤如 下: 1.杂色蛤物种特异性检测引物合成:在宝生物公司合成杂色蛤物种特异性检测引物5对,其序列(见表5): 表5. PCR扩增杂色蛤的Cox当前第1页1 2 本文档来自技高网...
一种杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系及应用

【技术保护点】
一种杂色蛤物种实时荧光PCR特异性检测体系,其特征在于:包括引物与探针的序列是:上游引物:5’‑ggttgaacagtctaccctcc‑3’;下游引物:5’‑gctaacatactactacgcaaaa‑3’;探针:5’‑tctcttcacgtaggtggtgtctcttcaatt‑3’。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘淑艳万超孙晓飞丁健
申请(专利权)人:刘淑艳万超孙晓飞丁健
类型:发明
国别省市:辽宁;21

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