本文显示涉及肺癌的生物标记。本文鉴定的唾液生物标记（CCNI、EGFR、FGF9、GREB1蛋白、LZTS、BRAF、FRS2、ANXA1、触珠蛋白Hp2、锌α2糖蛋白、钙卫蛋白、剀托卟啉单胞菌16S?rRNA、昭和弯曲菌16S?rRNA、唾液链球菌16S?rRNA、直肠弯曲菌16S?rRNA、小韦荣菌16S?rRNA、口金杆菌16SrRNA和毗邻颗粒链菌16S?rRNA）为具有灵敏度和特异性的肺癌检测生物试验创造基础。也包含了某些方式和方法，所述方式和方法使用多种生物标记评价生成的数据，以证实发现并且在临床、诊断和治疗应用中进一步使用多重肺癌试验。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】肺癌检测的唾液生物标记相关申请的交叉引用本申请要求2010年2月10日提交的临时申请USSN第61/303，205号的优先权，该专利申请通过引用全文纳入本文。联邦资助的研究或开发下完成专利技术的权利声明本专利技术是在政府支持下由国家卫生研究院(National Institutes of Health)授予的基金号DE016275资助完成。政府享有本专利技术的某些权利。背景根据国家癌症研究院(National Cancer Institute),肺癌是癌症死亡的主要原因(http://www. cancer, gov/cancertopics/types/lung)。2008 年，仅在美国就诊断出约 215，000例新肺癌患者。约87%的这些患者有非小细胞肺癌(NSCLC)。吸烟特别是香烟，迄今为止是肺癌的主要原因。在美国，估计当前有4千5百万和4千5百万前吸烟者处于发生肺癌的风险中。估计肺癌至少在未来50年内仍然是主要的健康问题。因为没有可行的方法来筛选大量处于风险的人们，所以超过75%的肺癌在晚期才诊断出。早前诊断提供改善治愈率的希望。尝试就肺癌发展鉴定和分类高风险个体和早期检测。光谱细胞学(spectumcytology)和胸部X射线初始用作筛选工具。不幸的是,这些方案不能增加可治愈病例的数目。用灵敏度高于胸部X射线的计算机化断层(CT)扫描取代这些方案。不幸的是，风险人群CT筛选的广泛应用有数个缺陷，包含高假阳性(良性肺结节的检测)和鉴定中心肿瘤的能力弱。因为所述的高假阳性率接近50%，估计就CT筛选防止的每个肺癌死亡而言要进行两个不必要的侵入性操作。同样，需要用于检测肺癌的方法，并且特别是能检测所述疾病早期的生物标记并且很大程度是非侵入性的。专利技术概述根据所述专利技术的一些实施方式，提供测定测试对象中出现或发生肺癌可能性的方法。所公开的方法包含分析对象的唾液样品，用特异性检测唾液样品中生物标记的试验，所述生物标记选自下组=CCNI (细胞周期蛋白I) (SEQ ID NO: I)、EGFR(表皮生长因子受体)(SEQ ID N0:2)、FGF9(成纤维细胞生长因子 19) (SEQ ID NO:3)、GREB1 蛋白(SEQ ID N0:4)、LZTS(亮氨酸拉链、推定的抑制物I) (SEQ ID NO:5)、BRAF(v_raf鼠肉瘤病毒癌基因同源物BI (SEQ IDN0:6)、FRS2(成纤维细胞生长因子受体底物2) (SEQ ID NO: 7)、ANXAl (膜联蛋白Al) (SEQ ID N0:8)、Hp2(触珠蛋白 2) (SEQ ID N0:9)、锌 α2糖蛋白(SEQID NO: 10)、剀托口卜啉单胞菌(Porphyromonas catoniae) 16S rRNA、昭和弯曲菌(Campylobacter showae) 16SrRNA、唾液链球菌(Streptocococcus salivaris) 16S rRNA、直肠弯曲菌(Campylobacterrectus) 16S rRNA、小韦荣菌(Veillonella parvula) 16S rRNA、口金杆菌(Kigellaoralis) 16S rRNA 和Btt邻颗粒链菌(Granulicatella adiacens) 16S rRNA。测定所述生物标记的相对发生率并且与对照作比较，从而测定所述测试对象的肺癌状态。在一些实施方式中，提供测定测试对象出现或发生肺癌可能性的方法，所述方法需要检测唾液样品中至少两种生物标记。在另一些实施方式中，提供测定测试对象出现和发生肺癌可能性的方法，所述方法需要检测剖托卩卜啉单胞菌(Porphyromonas catoniae)16S rRNA和昭和弯曲菌(Camplylobacter showae) 16S rRNA。例如，测定这些不例中所述生物标记或所述生物标志物(biomaker)和其他标记的相对发生率并且与对照作比较，从而测定所述测试对象的肺癌状态。在一些实施方式中，提供测定测试对象出现或发生肺癌可能性的方法，所述方法需要检测唾液样品中至少三种生物标记。在另一些实施方式中，提供测定测试对象出现或发生肺癌可能性的方法，所述方法需要检测GREB1、CCNI和FRS。在另一些实施方式中，提供测定测试对象出现或发生肺癌可能性的方法，所述方法需要检测。例如，测定这些示例中所述生物标记或所述生物标志物(biomaker)和其他标记的相对发生率并且与对照作比较，从而测定所述测试对象的肺癌状态。 在另一些实施方式中，测定测试对象出现或发生肺癌可能性的方法包含检测编码至少一种生物标记的核酸的试验。例如，所述核酸能通过质谱、聚合酶链反应(PCR)、微阵列杂交、热测序、毛细管阵列测序或固相测序来检测。在另一些实施方式中，测定测试对象出现或发生肺癌可能性的方法包含检测编码至少一种生物标记的多肽的试验。例如，所述多肽能通过酶联免疫吸附实验(ELISA)、Western印迹法、流式细胞术、免疫荧光、免疫组织化学或质谱来检测。根据本专利技术的其他实施方式，公开了评价治疗有效性的方法。所述方法包含用特异性检测生物标记的试验分析第一唾液样品，所述生物标记选自下组CCNI、EGFR、FGF9、GREB I蛋白、LZTS、BRAF、FRS2、ANXAl、Hp2、锌α 2糖蛋白、剖托卟啉单胞菌16S rRNA、昭和弯曲菌16S rRNA、唾液链球菌16S rRNA、直肠弯曲菌16S rRNA、小韦荣菌16S rRNA、口金杆菌16S rRNA和毗邻颗粒链菌16S rRNA。所述第一分析提供第一表达概况。将治疗应用于对象。用特异性检测至少两种生物标记的试验进行第二唾液样品分析，所述生物标记选自下组CCNI、EGFR、FGF9、GREBl 蛋白、LZTS、BRAF、FRS2、ANXAI、Hp2、锌 α 2 糖蛋白、剀托口卜啉单胞菌16S rRNA、昭和弯曲菌16S rRNA、唾液链球菌16S rRNA、直肠弯曲菌16S rRNA、小韦荣菌16S rRNA、口金杆菌16S rRNA和毗邻颗粒链菌16S rRNA，从而提供第二表达概况。比较所述第一和第二表达概况以评价治疗的有效性。在另一个实施方式中，提供固体支持物，其中所述固体支持物包含为至少两种生物标记选择的捕获结合探针，所述生物标记选自CCNI、EGFR、FGF9、GREBI蛋白、LZTS、BRAF,FRS2、剀托卟啉单胞菌16S rRNA、昭和弯曲菌16S rRNA、唾液链球菌16S rRNA、直肠弯曲菌16S rRNA、小韦荣菌16S rRNA、口金杆菌16S rRNA和毗邻颗粒链菌16S rRNA。在一些实施方式中，提供第一和第二固体支持物，其中所述第一固体支持物包含为生物标记选择的捕获结合探针，所述生物标记选自CCNI、EGFR、FGF9、GREBl蛋白、LZTS、BRAF, FRS2、剀托卟啉单胞菌16S rRNA、昭和弯曲菌16S rRNA、唾液链球菌16SrRNA、直肠弯曲菌16S rRNA、小韦荣菌16S rRNA、口金杆菌16S rRNA和毗邻颗粒链菌16S rRNA,并且其中所述第二固体支持物包含为生物标记选择的捕获结合配体，所述生物标记选自ΑΝ本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：D·T·王，张磊，肖华，H·周，
申请(专利权)人：加利福尼亚大学董事会，
类型：
国别省市：
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