The present invention discloses a method, primer and kit for detecting SLC25A13 gene mutation related to Citrin deficiency. The primers and kits include amplification primers and sequencing primers for SLC25A13 exons 6, 7, 8, 9, 10, 11, 13, 16 and 17. Based on PCR amplification and Sanger sequencing, the present invention can quickly detect mutations in the SLC25A13 mutation site associated with Citrin deficiency.
【技术实现步骤摘要】
检测SLC25A13基因突变的方法、引物和试剂盒
本专利技术属生命科学和生物
,特别涉及检测Citrin缺陷病相关的SLC25A13基因突变的方法、引物和试剂盒。
技术介绍
Citrin缺陷病是由于SLC25A13基因突变导致的一种常染色体隐性遗传病,包括成年发病Ⅱ型瓜氨酸血症(CTLN2)和新生儿肝内胆汁淤积症(NICCD)。该病最早见于日本报道,近年来研究发现该病呈世界性分布,但以东亚地区为主,我国为此病高发地区。Citrin缺陷病临床上主要表现为:新生儿或婴儿期起病,肝大、黄疸、肝功能异常等症状,部分患儿有凝血功能异常、半乳糖血症等表现,有时需要与胆道闭锁进行鉴别。尽管NICCD与CTLN2均为SLC25A13基因突变引起,但两者临床表现不同。CTLN2发病年龄多为11~79岁,男女患病比例约为2:1,大多数男性患者多于20~50岁发病,而女性患者起病年龄高于男性。CTLN2的主要症状是神经系统症状,典型表现为突发性意识、行为异常、定向力障碍、记忆丧失、嗜睡和昏迷等,与肝性脑病极为相似。CTLN2可因应激、外科术后、感染或饮酒等诱发,且患者常在发病数年 ...
【技术保护点】
检测SLC25A13基因突变的引物,其特征在于,包括至少一对扩增引物用于扩增SLC25A13基因,所述至少一对扩增引物选自SLC25A13‑E6‑F/SLC25A13‑E6‑R,SLC25A13‑E7‑F/SLC25A13‑E7‑R,SLC25A13‑E8_9‑F/SLC25A13‑E8_9‑R,SLC25A13‑E10‑F/SLC25A13‑E10‑R,SLC25A13‑E11‑F/SLC25A13‑E11‑R,SLC25A13‑E13‑F/SLC25A13‑E13‑R,SLC25A13‑E16_17‑F/SLC25A13‑E16_17‑R,其碱基序列为:SLC25A13 ...
【技术特征摘要】
1.检测SLC25A13基因突变的引物,其特征在于,包括至少一对扩增引物用于扩增SLC25A13基因,所述至少一对扩增引物选自SLC25A13-E6-F/SLC25A13-E6-R,SLC25A13-E7-F/SLC25A13-E7-R,SLC25A13-E8_9-F/SLC25A13-E8_9-R,SLC25A13-E10-F/SLC25A13-E10-R,SLC25A13-E11-F/SLC25A13-E11-R,SLC25A13-E13-F/SLC25A13-E13-R,SLC25A13-E16_17-F/SLC25A13-E16_17-R,其碱基序列为:SLC25A13-E6-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTCATTGGGTAGCAGAGTAAGGSLC25A13-E6-R:AACAGCTATGACCATGAACCACTTCATTAGGGCAAG;SLC25A13-E7-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGATTTTGCTACTGGTTCCTTGCSLC25A13-E7-R:AACAGCTATGACCATGCAGGCTGGTCTCAAACTCC;SLC25A13-E8_9-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTCATTCCAGTGCCTTGAGTTSLC25A13-E8_9-R:AACAGCTATGACCATGTGCTAAGGAAACCCCAGAATG;SLC25A13-E10-F:TGTAAAACGACGGCCAGTAAAGTGCTGGGATTACAGGCSLC25A13-E10-R:AACAGCTATGACCATGTAACTGGCATTGGGAAAGAC;SLC25A13-E11-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTTACTAATGAGGTTGGGCTGSLC25A13-E11-R:AACAGCTATGACCATGTTGTCAGTGTGTCTCCCTTC;SLC25A13-E13-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTTGTCAGTGTGTCTCCCTTCSLC25A13-E13-R:AACAGCTATGACCATGCATTTACCCTTCCACCTCTG;SLC25A13-E16_17-F:TGTAAAACGACGGCCAGTAAGACGAGATTACAGGTGGCSLC25A13-E16_17-R:AACAGCTATGACCATGCTGGATTTAGGAACTGGCTC。2.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述引物还包括一对测序引物M13F和M13R,其碱基序列为:M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT;M13R:AACAGCTATGACCATG。3.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述突变选自851del4、IVS11+1G>A、1638ins23、S225X、IVS13+1G>A、1800ins1、R605X和IVS6+5G>A。4.一种检测检测样品中SLC25A13基因突变的方法,其特征在于,其包括如下步骤:(1)提取样品DNA;(2)利用至少一对扩增引物对(1)中的DNA进行扩增,获得扩增产物,其中,所述至少一对扩增引物选自SLC25A13-E6-F/SLC25A13-E6-R,SLC25A13-E7-F/SLC25A13-E7-R,SLC25A13-E8_9-F/SLC25A13-E8_9-R,SLC25A13-E10-F/SLC25A13-E10-R,SLC25A13-E11-F/SLC25A13-E11-R,SLC25A13-E13-F/SLC25A13-E13-R,SLC25A13-E16_17-F/SLC25A13-E16_17-R;(3)利用测序引物M13F与M13R对(2)中的扩增产物分别进行正向和反向测序,获得所述扩增产物的基因序列;(4)将(3)中的基因序列与野生型SLC25A13基因序列进行比较,确定SLC25A13基因是否发生突变;所述扩增引物和测序引物的碱基序列为:SLC25A13-E6-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTCATTGGGTAGCAGAGTAAGGSLC25A13-E6-R:AACAGCTATGACCATGAACCACTTCATTAGGGCAAG;SLC25A13-E7-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGATTTTGCTACTGGTTCCTTGCSLC25A13-E7-R:AACAGCTATGACCATGCAGGCTGGTCTCAAACTCC;SLC25A13-E8_9-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTCATTCCAGTGCCTTGAGTTSLC25A13-E8_9-R:AACAGCTATGACCATGTGCTAAGGA...
【专利技术属性】
技术研发人员:柏忠良,
申请(专利权)人:上海艾迪康医学检验所有限公司,
类型:发明
国别省市:上海,31
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