一种鉴别等位基因类型的方法技术

技术编号:1754688 阅读:230 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种鉴别等位基因的方法。该方法是以待测样品的DNA为模板,用待检测目的基因的一个或一个以上突变位点对应的等位基因的引物组和不具有5′→3′外切核酸酶活性的DNA聚合酶,进行多重PCR扩增包括突变位点在内的待测目的基因的等位基因片段,将得到的多重PCR扩增产物与通用芯片杂交,根据杂交结果确定是哪种等位基因;所述引物组包括一种通用引物,和用于扩增每种目的基因的每个突变位点对应的两种等位基因特异性引物和一种共用引物;所有的等位基因特异性引物中每种引物的5′端均连接有不同的Tag序列;所述通用芯片包括若干种Tag探针,所述Tag探针与所述Tag序列相同,其中,每一种Tag探针只与多重PCR产生的互补序列杂交结合。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种鉴别等位基因类型的方法,是以待测样品的基因组DNA为模板,用待检测目的基因的一个或一个以上突变位点对应的等位基因的引物组和不具有5′→3′外切核酸酶活性的DNA聚合酶,进行多重PCR扩增包括突变位点在内的待测目的基因的等位基因片段,将得到的多重PCR扩增产物与通用芯片杂交,根据杂交结果确定是哪种等位基因;    所述引物组包括一种通用引物,和用于扩增每种目的基因的每个突变位点对应的两种等位基因特异性引物和一种共用引物;每种等位基因特异性引物的5′端均连接有不同的Tag序列;    所述Tag序列可以和所述多重PCR产物具有的互补Tag序列杂交,所有的Tag序列的Tm值之差小于等于5℃,相互之间以及与所有的引物之间没有交叉杂交,并且无发夹结构,与含有所述目的基因的物种的基因组的同源性较低;    所述通用芯片包括若干种Tag探针,所述Tag探针与所述Tag序列一一对应,一种Tag探针含有只与其相对应的Tag序列相同的寡核苷酸序列;其中,每一种Tag探针可以与多重PCR反应产生的互补的序列杂交。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李彩霞高华方刘湘蔡斌张地程京
申请(专利权)人:博奥生物有限公司清华大学
类型:发明
国别省市:11[中国|北京]

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