一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用制造技术

技术编号:13397799 阅读:90 留言:0更新日期:2016-07-23 18:49
本发明专利技术公开了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用。本发明专利技术基于10个白菜核心资源的重测序,发掘了白菜全基因组的序列变异,筛选了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的96组SNP核心引物。本发明专利技术的96组SNP核心引物具有较高的多态性信息量、最小等位基因频率以及较低的期望杂合度,能够准确的对329份商业品种进行鉴别,并且基因分型结果稳定。本发明专利技术提供的SNP位点和检测方法可应用于大白菜的遗传多样性分析和品种核酸指纹库构建等研究,可为新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。同时,可建立对大白菜品种的高通量、低成本和标准化的检测体系。

【技术实现步骤摘要】
一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用
本专利技术属于生物
,具体涉及一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用。
技术介绍
我国是世界蔬菜生产和消费第一大国,2014年蔬菜播种面积达3.6亿亩,总产量8.4亿吨,产值超过1.3万亿元,已超过粮食作物成为我国的第一大种植业。而大白菜(BrassicarapaL.ssp.Pekinensis)是我国栽培面积最大的蔬菜作物,在我国菜篮子工程中的作用举足轻重。同时由于白菜为杂交作物、重组率高、遗传多样性丰富、以及较好的基因组学研究基础而成为遗传学研究的模式植物。随着我国育种工作的快速发展,通过国家和各省审定的品种剧增,尤其是如白菜这种较大蔬菜作物,每年新推出的品种数以百计,而在众多的品种中还存在一系列近似品种,大量存在“同种多名、同名多种”的问题,导致我国蔬菜种子市场“多乱杂”,市场监管和品种保护非常困难。另一方面,由于种质资源日趋狭窄,少数骨干亲本被集中应用,在原品种基础上仅改良少数甚至单个性状的依赖性派生品种增多,品种间的遗传差异越来越小,如何有效地管理和甄别数量庞大的白菜品种成为品种管理的难题。造成这些问题的主要原因是我国缺乏高水准的育种和种检技术体系,而国外育种公司、国际种子联盟ISF等均建立了功能强大的蔬菜品种核酸指纹鉴定技术,能够准确迅速进行品种创制与鉴定,为种子质量监控和知识产权保护提供了有力武器。因此,我国亟需建立开展白菜及其它蔬菜种子DNA指纹鉴定,规范蔬菜种子市场秩序,强化知识产权保护。鉴于此,从DNA水平对我国白菜品种进行管理,对快速、准确的查处不真实品种行为具有重要意义。近年来,蔬菜作物的高通量基因组测序和基因分型科技发展迅速。2011年,白菜基因组测序完成,继而完成了多份白菜作物核心种质的重测序工作,建立了白菜遗传变异的大数据,为开发覆盖全基因组的SSR、InDel和SNP等特异分子标记奠定了重要基础。与此同时,高通量基因分型技术也得到了快速发展,我国多个企业机构引进了高通量基因分型的技术和平台,为开展多位点、多样品的分子检测工作提供了重要支撑。SNP(singlenucleotidepolymorphism)是由单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态,作为第三代分子标记,与其它标记技术相比具有无可比拟的优势,因此在品种分子检测方面被推荐为更新换代的标记。与此同时,高通量基因分型技术也得到了快速发展,为开展多位点、多样品的分子检测工作提供了重要支撑。与传统的SSR核酸指纹分析技术相比,SNP标记有诸多优势:①遗传变异稳定;②适于高通量规模化筛选和易于准确基因分型;③在样品DNA的使用量上,仅需要ng级的DNA,而且适用于多个方法提取的DNA(包括NaOH法等快速提取方法),可以实现全程高通量检测分型。核心引物对遗传多样性分析、种质资源鉴定、品种纯度和真实性检测、指纹图谱构建等研究具有重要价值。但我国还没有利用SNP标记技术进行结球白菜DNA指纹数据库构建和品种鉴定的有关报道。本研究利用英国LGC(LaboratoryoftheGovernmentChemist,政府化学家实验室)有限公司的KASP技术,基于10个白菜核心资源的重测序,发掘了白菜全基因组的序列变异,筛选了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的96组SNP核心引物。利用96对SNP核心引物对329个结球白菜品种进行基因分型,获得了不同品种的SNP分型数据;利用GGT2.0对上述数据进行分析,形成了各个品种的SNP指纹代码;进而使用PowerMarkerV3.25和MEGA6.06软件对不同品种进行聚类分析,结果可以将这些品种完全分开。利用KASP技术,我们建立了结球白菜标准化、高通量、低成本的分子检测技术平台,提供的SNP位点和检测方法可实现高通量、低成本、标准化和稳定可靠品种真实性检测,实际操作过程还可获得实验数据的全程记录和清晰的可视化效果,从而为高效、准确的进行大白菜品种的真实性和特异性鉴定奠定了基础。
技术实现思路
本专利技术的一个目的是提供大白菜基因组中的96个SNP位点或检测大白菜基因组中的96个SNP位点的物质的新用途。本专利技术提供了大白菜基因组中的96个SNP位点或检测大白菜基因组中的96个SNP位点的物质在如下任一中的应用:(1)大白菜品种进行基因分型;(2)构建大白菜DNA指纹数据库;(3)大白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析和/或聚类分析;(4)鉴别或辅助鉴别大白菜品种;(5)检测任意两个大白菜的相似性;所述96个SNP位点如下:SNP位点1为A01染色体上的第1248141位核苷酸;SNP位点2为A01染色体上的第4225329位核苷酸;SNP位点3为A01染色体上的第7102966位核苷酸;SNP位点4为A01染色体上的第9716212位核苷酸;SNP位点5为A01染色体上的第14897192位核苷酸;SNP位点6为A01染色体上的第16592150位核苷酸;SNP位点7为A01染色体上的第18635734位核苷酸;SNP位点8为A01染色体上的第22449302位核苷酸;SNP位点9为A01染色体上的第24456539位核苷酸;SNP位点10为A01染色体上的第26752589位核苷酸;SNP位点11为A02染色体上的第751652位核苷酸;SNP位点12为A02染色体上的第2421548位核苷酸;SNP位点13为A02染色体上的第6035955位核苷酸;SNP位点14为A02染色体上的第9423555位核苷酸;SNP位点15为A02染色体上的第11181828位核苷酸;SNP位点16为A02染色体上的第14862673位核苷酸;SNP位点17为A02染色体上的第18425637位核苷酸;SNP位点18为A02染色体上的第21426261位核苷酸;SNP位点19为A02染色体上的第23096858位核苷酸;SNP位点20为A02染色体上的第23181920位核苷酸;SNP位点21为A02染色体上的第25360564位核苷酸;SNP位点22为A03染色体上的第128271位核苷酸;SNP位点23为A03染色体上的第3151130位核苷酸;SNP位点24为A03染色体上的第4471683位核苷酸;SNP位点25为A03染色体上的第7828461位核苷酸;SNP位点26为A03染色体上的第12523505位核苷酸;SNP位点27为A03染色体上的第15431305位核苷酸;SNP位点28为A03染色体上的第18277222位核苷酸;SNP位点29为A03染色体上的第21003111位核苷酸;SNP位点30为A03染色体上的第23890389位核苷酸;SNP位点31为A03染色体上的第26316567位核苷酸;SNP位点32为A03染色体上的第30080620位核苷酸;SNP位点33为A04染色体上的第1223515位核苷酸;SNP位点34为A04染色体上的第6933634位核苷酸;SNP位点35为A04染色体上的第8662680位核苷酸;SNP位点36为A04染色体上的第9741929位核苷酸;SNP位点37为A04染色体上的第11311194位核苷酸;SNP位点38为A04染色体上的第1257989本文档来自技高网
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【技术保护点】
大白菜基因组中的96个SNP位点或检测大白菜基因组中的96个SNP位点的物质在如下任一中的应用:(1)大白菜品种进行基因分型;(2)构建大白菜DNA指纹数据库;(3)大白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析和/或聚类分析;(4)鉴别或辅助鉴别大白菜品种;(5)检测任意两个大白菜的相似性;所述96个SNP位点如下:SNP位点1为A01染色体上的第1248141位核苷酸;SNP位点2为A01染色体上的第4225329位核苷酸;SNP位点3为A01染色体上的第7102966位核苷酸;SNP位点4为A01染色体上的第9716212位核苷酸;SNP位点5为A01染色体上的第14897192位核苷酸;SNP位点6为A01染色体上的第16592150位核苷酸;SNP位点7为A01染色体上的第18635734位核苷酸;SNP位点8为A01染色体上的第22449302位核苷酸;SNP位点9为A01染色体上的第24456539位核苷酸;SNP位点10为A01染色体上的第26752589位核苷酸;SNP位点11为A02染色体上的第751652位核苷酸;SNP位点12为A02染色体上的第2421548位核苷酸;SNP位点13为A02染色体上的第6035955位核苷酸;SNP位点14为A02染色体上的第9423555位核苷酸;SNP位点15为A02染色体上的第11181828位核苷酸;SNP位点16为A02染色体上的第14862673位核苷酸;SNP位点17为A02染色体上的第18425637位核苷酸;SNP位点18为A02染色体上的第21426261位核苷酸;SNP位点19为A02染色体上的第23096858位核苷酸;SNP位点20为A02染色体上的第23181920位核苷酸;SNP位点21为A02染色体上的第25360564位核苷酸;SNP位点22为A03染色体上的第128271位核苷酸;SNP位点23为A03染色体上的第3151130位核苷酸;SNP位点24为A03染色体上的第4471683位核苷酸;SNP位点25为A03染色体上的第7828461位核苷酸;SNP位点26为A03染色体上的第12523505位核苷酸;SNP位点27为A03染色体上的第15431305位核苷酸;SNP位点28为A03染色体上的第18277222位核苷酸;SNP位点29为A03染色体上的第21003111位核苷酸;SNP位点30为A03染色体上的第23890389位核苷酸;SNP位点31为A03染色体上的第26316567位核苷酸;SNP位点32为A03染色体上的第30080620位核苷酸;SNP位点33为A04染色体上的第1223515位核苷酸;SNP位点34为A04染色体上的第6933634位核苷酸;SNP位点35为A04染色体上的第8662680位核苷酸;SNP位点36为A04染色体上的第9741929位核苷酸;SNP位点37为A04染色体上的第11311194位核苷酸;SNP位点38为A04染色体上的第12579896位核苷酸;SNP位点39为A04染色体上的第13764622位核苷酸;SNP位点40为A04染色体上的第14413900位核苷酸;SNP位点41为A05染色体上的第487586位核苷酸;SNP位点42为A05染色体上的第1283352位核苷酸;SNP位点43为A05染色体上的第2835432位核苷酸;SNP位点44为A05染色体上的第4379811位核苷酸;SNP位点45为A05染色体上的第8088873位核苷酸;SNP位点46为A05染色体上的第10705210位核苷酸;SNP位点47为A05染色体上的第14960042位核苷酸;SNP位点48为A05染色体上的第16182627位核苷酸;SNP位点49为A05染色体上的第19009544位核苷酸;SNP位点50为A05染色体上的第22962829位核苷酸;SNP位点51为A06染色体上的第18887位核苷酸;SNP位点52为A06染色体上的第6403261位核苷酸;SNP位点53为A06染色体上的第13545093位核苷酸;SNP位点54为A06染色体上的第14701558位核苷酸;SNP位点55为A06染色体上的第16193195位核苷酸;SNP位点56为A06染色体上的第18685199位核苷酸;SNP位点57为A06染色体上的第21632076位核苷酸;SNP位点58为A06染色体上的第23153503位核苷酸;SNP位点59为A06染色体上的第24717886位核苷酸;SNP位点60为A07染色体上的第246275位核苷酸;SNP位点61为A07染色体上的第1028346位核苷酸;SNP位点62为A07染色体上的第2970833位核苷酸;SNP位点63为A07染色体上的第610112...

【技术特征摘要】
1.大白菜基因组中的96个SNP位点在如下任一中的应用:(1)大白菜品种进行基因分型;(2)构建大白菜DNA指纹数据库;(3)大白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析和/或聚类分析;(4)鉴别或辅助鉴别大白菜品种;(5)检测任意两个大白菜的相似性;所述96个SNP位点如下:SNP位点1为A01染色体上的第1248141位核苷酸;SNP位点2为A01染色体上的第4225329位核苷酸;SNP位点3为A01染色体上的第7102966位核苷酸;SNP位点4为A01染色体上的第9716212位核苷酸;SNP位点5为A01染色体上的第14897192位核苷酸;SNP位点6为A01染色体上的第16592150位核苷酸;SNP位点7为A01染色体上的第18635734位核苷酸;SNP位点8为A01染色体上的第22449302位核苷酸;SNP位点9为A01染色体上的第24456539位核苷酸;SNP位点10为A01染色体上的第26752589位核苷酸;SNP位点11为A02染色体上的第751652位核苷酸;SNP位点12为A02染色体上的第2421548位核苷酸;SNP位点13为A02染色体上的第6035955位核苷酸;SNP位点14为A02染色体上的第9423555位核苷酸;SNP位点15为A02染色体上的第11181828位核苷酸;SNP位点16为A02染色体上的第14862673位核苷酸;SNP位点17为A02染色体上的第18425637位核苷酸;SNP位点18为A02染色体上的第21426261位核苷酸;SNP位点19为A02染色体上的第23096858位核苷酸;SNP位点20为A02染色体上的第23181920位核苷酸;SNP位点21为A02染色体上的第25360564位核苷酸;SNP位点22为A03染色体上的第128271位核苷酸;SNP位点23为A03染色体上的第3151130位核苷酸;SNP位点24为A03染色体上的第4471683位核苷酸;SNP位点25为A03染色体上的第7828461位核苷酸;SNP位点26为A03染色体上的第12523505位核苷酸;SNP位点27为A03染色体上的第15431305位核苷酸;SNP位点28为A03染色体上的第18277222位核苷酸;SNP位点29为A03染色体上的第21003111位核苷酸;SNP位点30为A03染色体上的第23890389位核苷酸;SNP位点31为A03染色体上的第26316567位核苷酸;SNP位点32为A03染色体上的第30080620位核苷酸;SNP位点33为A04染色体上的第1223515位核苷酸;SNP位点34为A04染色体上的第6933634位核苷酸;SNP位点35为A04染色体上的第8662680位核苷酸;SNP位点36为A04染色体上的第9741929位核苷酸;SNP位点37为A04染色体上的第11311194位核苷酸;SNP位点38为A04染色体上的第12579896位核苷酸;SNP位点39为A04染色体上的第13764622位核苷酸;SNP位点40为A04染色体上的第14413900位核苷酸;SNP位点41为A05染色体上的第487586位核苷酸;SNP位点42为A05染色体上的第1283352位核苷酸;SNP位点43为A05染色体上的第2835432位核苷酸;SNP位点44为A05染色体上的第4379811位核苷酸;SNP位点45为A05染色体上的第8088873位核苷酸;SNP位点46为A05染色体上的第10705210位核苷酸;SNP位点47为A05染色体上的第14960042位核苷酸;SNP位点48为A05染色体上的第16182627位核苷酸;SNP位点49为A05染色体上的第19009544位核苷酸;SNP位点50为A05染色体上的第22962829位核苷酸;SNP位点51为A06染色体上的第18887位核苷酸;SNP位点52为A06染色体上的第6403261位核苷酸;SNP位点53为A06染色体上的第13545093位核苷酸;SNP位点54为A06染色体上的第14701558位核苷酸;SNP位点55为A06染色体上的第16193195位核苷酸;SNP位点56为A06染色体上的第18685199位核苷酸;SNP位点57为A06染色体上的第21632076位核苷酸;SNP位点58为A06染色体上的第23153503位核苷酸;SNP位点59为A06染色体上的第24717886位核苷酸;SNP位点60为A07染色体上的第246275位核苷酸;SNP位点61为A07染色体上的第1028346位核苷酸;SNP位点62为A07染色体上的第2970833位核苷酸;SNP位点63为A07染色体上的第6101124位核苷酸;SNP位点64为A07染色体上的第11498098位核苷酸;SNP位点65为A07染色体上的第14523031位核苷酸;SNP位点66为A07染色体上的第18060124位核苷酸;SNP位点67为A07染色体上的第19894600位核苷酸;SNP位点68为A07染色体上的第24460147位核苷酸;SNP位点69为A08染色体上的第100717位核苷酸;SNP位点70为A08染色体上的第2374634位核苷酸;SNP位点71为A08染色体上的第8933259位核苷酸;SNP位点72为A08染色体上的第10869244位核苷酸;SNP位点73为A08染色体上的第15287418位核苷酸;SNP位点74为A08染色体上的第16162051位核苷酸;SNP位点75为A08染色体上的第17179902位核苷酸;SNP位点76为A08染色体上的第20716882位核苷酸;SNP位点77为A09染色体上的第583658位核苷酸;SNP位点78为A09染色体上的第3817906位核苷酸;SNP位点79为A09染色体上的第5122605位核苷酸;SNP位点80为A09染色体上的第8876252位核苷酸;SNP位点81为A09染色体上的第8877380位核苷酸;SNP位点82为A09染色体上的第16265081位核苷酸;SNP位点83为A09染色体上的第18332606位核苷酸;SNP位点84为A09染色体上的第21636788位核苷酸;SNP位点85为A09染色体上的第26520788位核苷酸;SNP位点86为A09染色体上的第31873135位核苷酸;SNP位点87为A09染色体上的第34559009位核苷酸;SNP位点88为A09染色体上的第37238042位核苷酸;SNP位点89为A10染色体上的第617354位核苷酸;SNP位点90为A10染色体上的第5601251位核苷酸;SNP位点91为A10染色体上的第6477381位核苷酸;SNP位点92为A10染色体上的第8425118位核苷酸;SNP位点93为A10染色体上的第12492205位核苷酸;SNP位点94为A10染色体上的第13127812位核苷酸;SNP位点95为A10染色体上的第13859895位核苷酸;SNP位点96为A10染色体上的第15835648位核苷酸。2.检测大白菜基因组中的96个SNP位点的物质在如下任一中的应用:(1)大白菜品种进行基因分型;(2)构建大白菜DNA指纹数据库;(3)大白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析和/或聚类分析;(4)鉴别或辅助鉴别大白菜品种;(5)检测任意两个大白菜的相似性;所述96个SNP位点为权利要求1中所述的96个SNP位点;所述检测大白菜基因组中的96个SNP位点的物质为如下96组引物:(1)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点1的引物组1,所述引物组1由序列1所示的正向引物、序列2所示的正向引物和序列3所示的反向引物组成;(2)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点2的引物组2,所述引物组2由序列4所示的正向引物、序列5所示的正向引物和序列6所示的正向引物组成;(3)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点3的引物组3,所述引物组3由序列7所示的正向引物、序列8所示的正向引物和序列9所示的正向引物组成;(4)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点4的引物组4,所述引物组4由序列10所示的正向引物、序列11所示的正向引物和序列12所示的正向引物组成;(5)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点5的引物组5,所述引物组5由序列13所示的正向引物、序列14所示的正向引物和序列15所示的正向引物组成5;(6)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点6的引物组6,所述引物组6由序列16所示的正向引物、序列17所示的正向引物和序列18所示的正向引物组成;(7)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点7的引物组7,所述引物组7由序列19所示的正向引物、序列20所示的正向引物和序列21所示的正向引物组成;(8)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点8的引物组8,所述引物组8由序列22所示的正向引物、序列23所示的正向引物和序列24所示的正向引物组成;(9)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点9的引物组9,所述引物组9由序列25所示的正向引物、序列26所示的正向引物和序列27所示的正向引物组成;(10)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点10的引物组10,所述引物组10由序列28所示的正向引物、序列29所示的正向引物和序列30所示的正向引物组成;(11)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点11的引物组11,所述引物组2由序列31所示的正向引物、序列32所示的正向引物和序列33所示的反向引物组成;(12)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点12的引物组12,所述引物组12由序列34所示的正向引物、序列35所示的正向引物和序列36所示的反向引物组成;(13)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点13的引物组13,所述引物组13由序列37所示的正向引物、序列38所示的正向引物和序列39所示的反向引物组成;(14)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点14的引物组14,所述引物组14由序列40所示的正向引物、序列41所示的正向引物和序列42所示的反向引物组成;(15)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点15的引物组15,所述引物组15由序列43所示的正向引物、序列44所示的正向引物和序列45所示的反向引物组成;(16)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点16的引物组16,所述引物组16由序列46所示的正向引物、序列47所示的正向引物和序列48所示的反向引物组成;(17)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点17的引物组17,所述引物组17由序列49所示的正向引物、序列50所示的正向引物和序列51所示的反向引物组成;(18)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点18的引物组18,所述引物组18由序列52所示的正向引物、序列53所示的正向引物和序列54所示的反向引物组成;(19)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点19的引物组19,所述引物组19由序列55所示的正向引物、序列56所示的正向引物和序列57所示的反向引物组成;(20)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点20的引物组20,所述引物组20由序列58所示的正向引物、序列59所示的正向引物和序列60所示的反向引物组成;(21)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点21的引物组21,所述引物组21由序列61所示的正向引物、序列62所示的正向引物和序列63所示的正向引物组成;(22)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点22的引物组22,所述引物组22由序列64所示的正向引物、序列65所示的正向引物和序列66所示的反向引物组成;(23)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点23的引物组23,所述引物组23由序列67所示的正向引物、序列68所示的正向引物和序列69所示的反向引物组成;(24)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点24的引物组24,所述引物组24由序列70所示的正向引物、序列71所示的正向引物和序列72所示的反向引物组成;(25)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点25的引物组25,所述引物组25由序列73所示的正向引物、序列74所示的正向引物和序列75所示的反向引物组成;(26)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点26的引物组26,所述引物组26由序列76所示的正向引物、序列77所示的正向引物和序列78所示的反向引物组成;(27)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点27的引物组27,所述引物组27由序列79所示的正向引物、序列80所示的正向引物和序列81所示的反向引物组成;(28)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点28的引物组28,所述引物组28由序列82所示的正向引物、序列83所示的正向引物和序列84所示的反向引物组成;(29)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点29的引物组29,所述引物组29由序列85所示的正向引物、序列86所示的正向引物和序列87所示的反向引物组成;(30)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点30的引物组30,所述引物组30由序列88所示的正向引物、序列89所示的正向引物和序列90所示的反向引物组成;(31)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点31的引物组31,所述引物组31由序列91所示的正向引物、序列92所示的正向引物和序列93所示的反向引物组成;(32)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点32的引物组32,所述引物组32由序列94所示的正向引物、序列95所示的正向引物和序列96所示的正向引物组成;(33)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点33的引物组33,所述引物组33由序列97所示的正向引物、序列98所示的正向引物和序列99所示的反向引物组成;(34)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点34的引物组34,所述引物组34由序列100所示的正向引物、序列101所示的正向引物和序列102所示的反向引物组成;(35)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点35的引物组35,所述引物组35由序列103所示的正向引物、序列104所示的正向引物和序列105所示的反向引物组成;(36)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点36的引物组36,所述引物组36由序列106所示的正向引物、序列107所示的正向引物和序列108所示的反向引物组成;(37)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点37的引物组37,所述引物组37由序列109所示的正向引物、序列110所示的正向引物和序列111所示的反向引物组成;(38)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点38的引物组38,所述引物组2由序列112所示的正向引物、序列113所示的正向引物和序列114所示的反向引物组成;(39)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点39的引物组39,所述引物组39由序列115所示的正向引物、序列116所示的正向引物和序列117所示的反向引物组成;(40)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点40的引物组40,所述引物组40由序列118所示的正向引物、序列119所示的正向引物和序列120所示的反向引物组成;(41)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点41的引物组41,所述引物组41由序列121所示的正向引物、序列122所示的正向引物和序列123所示的反向引物组成;(42)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点42的引物组42,所述引物组42由序列124所示的正向引物、序列125所示的正向引物和序列126所示的反向引物组成;(43)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点43的引物组43,所述引物组43由序列127所示的正向引物、序列128所示的正向引物和序列129所示的正向引物组成;(44)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点44的引物组44,所述引物组44由序列130所示的正向引物、序列131所示的正向引物和序列132所示的反向引物组成;(45)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点45的引物组45,所述引物组45由序列133所示的正向引物、序列134所示的正向引物和序列135所示的反向引物组成;(46)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点46的引物组46,所述引物组46由序列136所示的正向引物、序列137所示的正向引物和序列138所示的反向引物组成;(47)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点47的引物组47,所述引物组47由序列139所示的正向引物、序列140所示的正向引物和序列141所示的反向引物组成;(48)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点48的引物组48,所述引物组48由序列142所示的正向引物、序列143所示的正向引物和序列144所示的反向引物组成;(49)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点49的引物组49,所述引物组49由序列145所示的正向引物、序列146所示的正向引物和序列147所示的反向引物组成;(50)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点50的引物组50,所述引物组50由序列148所示的正向引物、序列149所示的正向引物和序列150所示的反向引物组成;(51)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点51的引物组51,所述引物组51由序列151所示的正向引物、序列152所示的正向引物和序列153所示的反向引物组成;(52)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点52的引物组52,所述引物组52由序列154所示的正向引物、序列155所示的正向引物和序列156所示的反向引物组成;(53)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点53的引物组53,所述引物组53由序列157所示的正向引物、序列158所示的正向引物和序列159所示的反向引物组成;(54)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点54的引物组54,所述引物组54由序列160所示的正向引物、序列161所示的正向引物和序列162所示的反向引物组成;(55)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点55的引物组55,所述引物组55由序列163所示的正向引物、序列164所示的正向引物和序列165所示的反向引物组成;(56)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点56的引物组56,所述引物组56由序列166所示的正向引物、序列167所示的正向引物和序列168所示的反向引物组成;(57)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点57的引物组57,所述引物组57由序列169所示的正向引物、序列170所示的正向引物和序列171所示的反向引物组成;(58)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点58的引物组58,所述引物组58由序列172所示的正向引物、序列173所示的正向引物和序列174所示的反向引物组成;(59)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点59的引物组59,所述引物组59由序列175所示的正向引物、序列176所示的正向引物和序列177所示的反向引物组成;(60)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点60的引物组60,所述引物组60由序列178所示的正向引物、序列179所示的正向引物和序列180所示的反向引物组成;(61)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点61的引物组61,所述引物组61由序列181所示的正向引物、序列182所示的正向引物和序列183所示的反向引物组成;(62)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点62的引物组62,所述引物组62由序列184所示的正向引物、序列185所示的正向引物和序列186所示的反向引物组成;(63)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点63的引物组63,所述引物组63由序列187所示的正向引物、序列188所示的正向引物和序列189所示的反向引物组成;(64)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点64的引物组64,所述引物组64由序列190所示的正向引物、序列191所示的正向引物和序列192所示的反向引物组成;(65)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点65的引物组65,所述引物组65由序列193所示的正向引物、序列194所示的正向引物和序列195所示的反向引物组成;(66)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点66的引物组66,所述引物组66由序列196所示的正向引物、序列197所示的正向引物和序列198所示的反向引物组成;(67)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点67的引物组67,所述引物组67由序列199所示的正向引物、序列200所示的正向引物和序列201所示的反向引物组成;(68)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点68的引物组68,所述引物组68由序列202所示的正向引物、序列203所示的正向引物和序列204所示的反向引物组成;(69)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点69的引物组69,所述引物组69由序列205所示的正向引物、序列206所示的正向引物和序列207所示的反向引物组成;(70)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点70的引物组70,所述引物组70由序列208所示的正向引物、序列209所示的正向引物和序列210所示的反向引物组成;(71)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点71的引物组71,所述引物组71由序列211所示的正向引物、序列212所示的正向引物和序列213所示的反向引物组成;(72)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点72的引物组72,所述引物组72由序列214所示的正向引物、序列215所示的正向引物和序列216所示的反向引物组成;(73)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点73的引物组73,所述引物组73由序列217所示的正向引物、序列218所示的正向引物和序列219所示的反向引物组成;(74)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点74的引物组74,所述引物组74由序列220所示的正向引物、序列221所示的正向引物和序列222所示的反向引物组成;(75)用于检测大白菜基因组DNA的SNP位点75的引...

【专利技术属性】
技术研发人员:于拴仓苏同兵张凤兰余阳俊张德双赵岫云汪维红卢桂香隋光磊
申请(专利权)人:北京市农林科学院
类型:发明
国别省市:北京;11

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