基质金属蛋白酶底物和其它可切割部分及其使用方法技术

本发明专利技术一般涉及包括是至少一种基质金属蛋白酶(MMP)的底物的可切割部分的多肽、包括是至少一种MMP蛋白酶的底物的可切割部分的可激活抗体和其它较大分子，以及涉及制备和在各种治疗、诊断和预防适应症中使用包括是至少一种MMP蛋白酶的底物的可切割部分的这些多肽的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请本申请要求2013年9月25日提交的美国临时申请号61/882,377和2014年3月27日提交的美国临时申请号61/971,332的权益，其每一个的内容通过引用以其整体结合到本文中。专利
总的来讲，本专利技术涉及包括是至少一种基质金属蛋白酶(MMP)的底物的可切割部分的多肽、包括是至少一种MMP蛋白酶的底物的可切割部分的可激活抗体和其它较大分子，及制备包括是至少一种MMP蛋白酶的底物的可切割部分的这些多肽的方法和在各种治疗、诊断和预防适应症中使用所述多肽的方法。专利技术背景蛋白酶是通过切割氨基酸残基间的肽键而使蛋白质降解的酶。蛋白酶天然存在于所有生物中，并参与从简单降解到高度调节的途径的各种生理反应。已知一些蛋白酶根据蛋白质内存在的特殊氨基酸序列使特定的肽键断裂。因此，存在鉴定蛋白酶的新的底物和在各种治疗、诊断和预防适应症中使用这些底物的需要。专利技术概述本公开内容提供包括是至少一种基质金属蛋白酶(MMP)的底物的可切割部分(CM)的氨基酸序列。这些CM可用于各种治疗、诊断和预防适应症中。在一些实施方案中，CM是至少一种基质金属蛋白酶(MMP)的底物。MMP的实例包括MMP1、MMP2、MMP3、MMP7、MMP8、MMP9、MMP10、MMP11、MMP12、MMP13、MMP14、MMP15、MMP16、MMP17、MMP19、MMP20、MMP23、MMP24、MMP26和MMP27。在一些实施方案中，CM是MMP9、MMP14、MMP1、MMP3、MMP13、MMP17、MMP11和MMP19的底物。在一些实施方案中，CM是MMP9的底物。在一些实施方案中，CM是MMP14的底物。在一些实施方案中，CM是两种或更多种MMP的底物。在一些实施方案中，CM是至少MMP9和MMP14的底物。在一些实施方案中，CM包含相同MMP的两种或更多种底物。在一些实施方案中，CM包含至少两种或更多种MMP9底物。在一些实施方案中，CM包含至少两种或更多种MMP14底物。在一些实施方案中，CM是MMP的底物并包括序列ISSGLLSS (SEQ ID NO: 14)、QNQALRMA (SEQ ID NO: 15)、AQNLLGMV (SEQ ID NO: 16)、STFPFGMF (SEQ ID NO: 17)、PVGYTSSL (SEQ ID NO: 18)、DWLYWPGI (SEQ ID NO: 19)、MIAPVAYR (SEQ ID NO: 20)、RPSPMWAY (SEQ ID NO: 21)、WATPRPMR (SEQ ID NO: 22)、FRLLDWQW (SEQ ID NO: 23)、LKAAPRWA (SEQ ID NO: 24)、GPSHLVLT (SEQ ID NO: 25)、LPGGLSPW (SEQ ID NO: 26)、MGLFSEAG (SEQ ID NO: 27)、SPLPLRVP (SEQ ID NO: 28)、RMHLRSLG (SEQ ID NO: 29)、LAAPLGLL (SEQ ID NO: 30)、AVGLLAPP (SEQ ID NO: 31)、LLAPSHRA (SEQ ID NO: 32)、PAGLWLDP (SEQ ID NO: 33)和/或ISSGLSS (SEQ ID NO: 159)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列ISSGLLSS (SEQ ID NO: 14)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列QNQALRMA (SEQ ID NO: 15)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列AQNLLGMV (SEQ ID NO: 16)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列STFPFGMF (SEQ ID NO: 17)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列PVGYTSSL (SEQ ID NO: 18)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列DWLYWPGI (SEQ ID NO: 19)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列MIAPVAYR (SEQ ID NO: 20)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列RPSPMWAY (SEQ ID NO: 21)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列WATPRPMR (SEQ ID NO: 22)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列FRLLDWQW (SEQ ID NO: 23)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列LKAAPRWA (SEQ ID NO: 24)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列GPSHLVLT (SEQ ID NO: 25)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列LPGGLSPW (SEQ ID NO: 26)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列MGLFSEAG (SEQ ID NO: 27)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列SPLPLRVP (SEQ ID NO: 28)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列RMHLRSLG (SEQ ID NO: 29)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列LAAPLGLL (SEQ ID NO: 30)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列AVGLLAPP (SEQ ID NO: 31)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列LLAPSHRA (SEQ ID NO: 32)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列PAGLWLDP (SEQ ID NO: 33)。在一些实施方案中，CM包含氨基酸序列ISSGLSS (SEQ ID NO: 159)。在一些实施方案中，使CM与抗体连接或以别的方式相连。例如，使用CM将一种或多种作用剂与结合指定靶标的抗体或其抗原结合片段(AB)连接，使得当暴露于MMP时CM被切割，作用剂从AB中释放。示例性靶标包括但不限于表1所示靶标。示例性AB包括但不限于表2所示靶标。在一些实施方案中，未切割状态下的抗体具有如下从N端到C端的结构排列：作用剂-CM-AB或AB-CM-作用剂。在一些实施方案中，抗体包含AB和CM之间的连接肽。在一些实施方案中，抗体包含CM和缀合的作用剂之间的连接肽。在一些实施方案中，抗体包含第一连接肽(LP1)和第二连接肽(LP2)，且未切割状态下的抗体具有如下从N端到C端的结构排列：作用剂-LP1-CM-LP2-AB或AB-LP2-CM-LP1-作用剂。在一些实施方案中，LP1和LP2各自为长度为约1-20个氨基酸的肽。在一些实施方案中，两个连接肽彼此不必相同。在一些实施方案中，LP1或LP2的至少一个包含选自以下的氨基酸序列：(GS)n、(GGS)n、(GSGGS)n (SEQ ID NO: 1)和(GGGS)n (SEQ ID NO: 2)，其中n为至少1的整数。在一些实施方案中，LP1或LP2的至少一个包含选自以下的氨基酸序列：GGSG (SEQ ID NO: 3)、GGSGG (SEQ ID NO: 4)、GSGSG (SEQ ID NO: 5)、GSGGG (SEQ ID NO: 6)、GGGSG (SEQ ID NO: 7)和GSSSG (SEQ ID NO: 8)。在一些实施方案中，LP1包含氨基酸序列GSSGGSGGSGGSG (SEQ ID NO: 9本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 353‑363、372‑375、376‑378、395‑401、411‑419、426‑433、437‑449、454‑456、459‑469、475‑482、487‑495、318‑323、325‑327、330‑335、341‑347、14‑33和159的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.09.25 US 61/882377;2014.03.27 US 61/9713321. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 353-363、372-375、376-378、395-401、411-419、426-433、437-449、454-456、459-469、475-482、487-495、318-323、325-327、330-335、341-347、14-33和159的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。2. 权利要求1的分离的多肽，其中所述CM包含选自SEQ ID NO: 353-363、372-375、376-378、395-401、411-419、426-433、437-449、454-456、459-469、475-482和487-495的氨基酸序列。3. 权利要求1的分离的多肽，其中所述CM包含选自SEQ ID NO: 318-323、325-327、330-335和341-347的氨基酸序列。4. 权利要求1的分离的多肽，其中所述CM包含选自SEQ ID NO: 14-33和159的氨基酸序列。5. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 353-363的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。6. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 372-375的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。7. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 376-378的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。8. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 395-401的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。9. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 411-419的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。10. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 426-433的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。11. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 437-449的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。12. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 454-456的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。13. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 459-469的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。14. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 475-482的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。15. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 487-495的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。16. 一种分离的多肽，其含有包含选自SEQ ID NO: 318-323的氨基酸序列的可切割部分(CM)，其中所述可切割部分是蛋白酶的底物。17. 一种分离的多肽，...

【专利技术属性】
技术研发人员：SJ摩尔，MTL阮，DR霍斯特特，O瓦西尔杰瓦，JG弗兰德斯，
申请(专利权)人：西托姆克斯治疗公司，
类型：发明
国别省市：美国;US