辅助鉴别具有不同胸肌系水力鸡的方法及其专用引物技术

技术编号:13460740 阅读:95 留言:0更新日期:2016-08-04 11:16
本发明专利技术公开了一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力鸡的方法及其专用引物。本发明专利技术首先提供了一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力的鸡方法,是检测待测鸡基于特异SNP的基因型为CC基因型、CT基因型还是TT基因型,CT基因型鸡的胸肌系水力高于CC基因型;所述特异SNP为如下(a1)或(a2):(a1)鸡基因组中序列表的序列3所示DNA自5’末端第337位核苷酸;(a2)鸡基因组中引物F和引物R的靶序列中自5’末端第337位核苷酸;引物F为序列表的序列1所示的单链DNA分子;引物R为如下(b3)或(b4):(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子。本发明专利技术对于鸡的育种具有重要意义,也对于进一步研究鸡的系水力形成机理具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术公开了一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力鸡的方法及其专用引物。本专利技术首先提供了一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力的鸡方法,是检测待测鸡基于特异SNP的基因型为CC基因型、CT基因型还是TT基因型,CT基因型鸡的胸肌系水力高于CC基因型;所述特异SNP为如下(a1)或(a2):(a1)鸡基因组中序列表的序列3所示DNA自5’末端第337位核苷酸;(a2)鸡基因组中引物F和引物R的靶序列中自5’末端第337位核苷酸;引物F为序列表的序列1所示的单链DNA分子;引物R为如下(b3)或(b4):(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子。本专利技术对于鸡的育种具有重要意义,也对于进一步研究鸡的系水力形成机理具有重要意义。【专利说明】辅助鉴别具有不同胸肌系水力鸡的方法及其专用引物
本专利技术涉及一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力鸡的方法及其专用引物。
技术介绍
随着生活水平的提高、经济的发展,人们对于鸡肉的品质和口味的要求越来越高。 我国作为鸡肉的生产和消费大国,在一味追求产肉能力的家禽产业在发展的同时,也面临 着产肉量增加的同时所带来的肉质品质下降的觸尬境地。Andersen指出,在肌肉的加工过 程中,系水力是最重要的肉品质指标之一。Otto等人也认为系水力是衡量肉品质的最重要 指标。水分损失的同时会带来可溶性蛋白质的损失,Savage等人报道每毫升流失的水中约 含有112mg的蛋白质,同时水分损失也会造成可溶性风味物质的流失。而Luciano等指出水 分流失会带走肌肉中的血红素,对肉色造成影响。因此,水分的存在对肌肉的物理形态、风 味、肉色等都具有重要的意义。 鉴于系水力对肌肉肉质的影响至关重要,在家禽育种工作中,希望选择系水力高 的个体留种。但鸡胸肉的系水力在活体时难以度量,只能依靠同胞或后裔测定选种。测定耗 时,且资金投入大,难应用于育种实践。因此分子标记的快速发展,为标记辅助选择的应用 提供了有利条件。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力鸡的方法及其专用引物。 本专利技术首先提供了一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力的鸡方法,是检测待测鸡基 于特异SNP的基因型为CC基因型、CT基因型还是TT基因型,CT基因型鸡的胸肌系水力高于CC 基因型; 所述特异SNP为如下(al)或(a2): (al)鸡基因组中序列表的序列3所示DNA自5 '末端第337位核苷酸; (a2)鸡基因组中引物F和引物R的靶序列中自5'末端第337位核苷酸; 引物F为如下(bl)或(b2): (bl)序列表的序列1所示的单链DNA分子; (b2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有 相同功能的DNA分子; 弓丨物R为如下(b3)或(b4): (b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子; (b4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有 相同功能的DNA分子。 所述方法中,具体可采用引物F和引物R组成的特异引物对检测待测鸡基于特异 SNP的基因型。所述方法中,具体可采用如下步骤检测待测鸡基于特异SNP的基因型: (1)以待测鸡的基因组DNA为模板,用引物F和引物R组成的特异引物对进行PCR扩 增,得到PCR扩增产物; (2)用限制性内切酶Bfal酶切步骤(1)得到的PCR扩增产物,得到酶切产物;如果酶 切产物只有一种,且为794bp-814bp(具体可为804bp),待测鸡为CC基因型;如果酶切产物为 两种,分别为463bp-473bp(具体可为468bp)和331bp-341bp(具体可为336bp),待测鸡为TT 基因型;如果酶切产物为三种,分别为794bp-814bp (具体可为804bp)、463bp-473bp (具体可 为468bp)和331bp-341bp (具体可为336bp),待测鸡为CT基因型。所述方法中,具体可采用如下步骤检测待测鸡基于特异SNP的基因型: (1)以待测鸡的基因组DNA为模板,用引物F和引物R组成的特异引物对进行PCR扩 增,得到PCR扩增产物; (2)用限制性内切酶Bfal酶切步骤(1)得到的PCR扩增产物,然后进行琼脂糖凝胶 电泳;如果仅在750-1000bp之间显示一条带(在250-500bp之间不显示条带),待测鸡为CC基 因型;如果仅在250-500bp之间显示一条带或两条带(在750-1000bp之间不显示条带),待测 鸡为TT基因型;如果在750-1000bp之间显示一条带且在250-500bp之间显示一条带或两条 带,待测鸡为CT基因型。所述琼脂糖凝胶电泳具体可为3%琼脂糖凝胶电泳。本专利技术还保护特异引物对甲,由两条引物组成,其扩增产物包括特异DNA分子;所 述特异DNA分子为鸡基因组中引物F和引物R的靶序列。本专利技术还保护特异引物对乙,由两条引物组成,其扩增产物包括特异DNA分子;所 述特异DNA分子如序列表的序列3所示。 本专利技术还保护特异引物对丙,由引物F和引物R组成。 所述特异引物对甲、所述特异引物对乙或所述特异引物对丙的用途为:辅助鉴别 具有不同胸肌系水力的鸡。 本专利技术还保护一种试剂盒,所述特异引物对甲、特异引物对乙或特异引物对丙。所 述试剂盒还可包括限制性内切酶Bfal。所述试剂盒的用途为:辅助鉴别具有不同胸肌系水 力的鸡。 本专利技术还保护特异引物对甲、特异引物对乙、特异引物对丙或所述试剂盒的应用, 所述应用为辅助鉴别具有不同胸肌系水力的鸡。 本专利技术还保护一种鸡的育种方法,是选择以上任一所述方法鉴别得到的CT基因型 的鸡进行育种。 本专利技术发现了一个和鸡的胸肌系水力紧密相关的单核苷酸多态位点,并基于该多 态设计了特异性引物对以及用该引物对检测该多态的PCR-RFLP方法。基于该单核苷酸多态 位点的基因型与鸡的胸肌系水力显著相关。用本专利技术的方法,可以快速简便的鉴定待测鸡 基于该单核苷酸多态位点的基因型。应用本专利技术的方法可以辅助筛选具有高胸肌系水力的 鸡,具有快速、简便、可以早期筛选等优点,对于鸡的育种具有重要意义,也对于进一步研究 鸡的系水力形成机理具有重要意义。【附图说明】 图1为部分PCR扩增产物的电泳图。 图2为部分Bfal酶切产物的电泳图。【具体实施方式】 以下的实施例便于更好地理解本专利技术,但并不限定本专利技术。下述实施例中的实验 方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自 常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平 均值。 明星肉鸡:中国农业大学动物科技学院实验鸡场。寿光鸡:中国农业大学动物科技 学院实验鸡场。北京油鸡:中国农业大学动物科技学院实验鸡场。农大褐蛋鸡:中国农业大 学动物科技学院实验鸡场。藏鸡:中国农业大学动物科技学院实验鸡场。青脚矮小型隐性白 羽鸡:中国农业大学动物科技学院实验鸡场。提及明星肉鸡的文献:杨永升、邓学梅、李宁、 傅衍、朱睦元、吴常信,MC1R是控制鸡黑色素形成的候选主效基因,生物化学与生物物理进 展,2004,31(6),500-505。提及农大褐蛋鸡的文献:宁中华、吴常信,矮小型褐壳蛋鸡育种的 理论与实践。实施例1、检测鸡胸肌系水力的方法的建立及其效果验证 试验鸡群为(共本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种辅助鉴别具有不同胸肌系水力的鸡方法,是检测待测鸡基于特异SNP的基因型为CC基因型、CT基因型还是TT基因型,CT基因型鸡的胸肌系水力高于CC基因型;所述特异SNP为如下(a1)或(a2):(a1)鸡基因组中序列表的序列3所示DNA自5’末端第337位核苷酸;(a2)鸡基因组中引物F和引物R的靶序列中自5’末端第337位核苷酸;所述引物F为如下(b1)或(b2):(b1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;(b2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;所述引物R为如下(b3)或(b4):(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;(b4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:邓学梅葛雅琼秦昊高强
申请(专利权)人:中国农业大学
类型:发明
国别省市:北京;11

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