一组用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点及检测试剂盒制造技术

本发明专利技术公开了一组用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点及检测试剂盒。本发明专利技术所提供的试剂盒中含有用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点的引物对组，由用于检测rs7181866、rs6311、rs7305115、rs4680、rs1799983、rs5065、rs1801133、rs3759584、rs4340、rs11549465、rs1800544和rs699947这12个SNP位点的24个引物对组成，其序列为序列表中序列1-37；同时所述试剂盒中还含有配合24个引物对使用的固定有24条单链DNA探针的杂交芯片。本发明专利技术提供的试剂盒支持高通量、快速、准确地同时检测12个飞行员LOD易感基因SNP位点，本发明专利技术为飞行人员选拔提供参考。

A set of polymorphic loci and detection kits for detection of LOD susceptibility genes in pilots

The invention discloses a group of LOD susceptibility gene polymorphism loci and a detection kit for detecting pilots. The pilot for the detection of primers containing LOD susceptible gene polymorphism site kit provided by the invention of the group, from 24 primers for detection of rs7181866, rs6311, rs7305115, rs4680, rs1799983, rs5065, rs1801133, rs3759584, rs4340, rs11549465, rs1800544 and rs699947 of the 12 SNP loci on the composition, its sequence sequence in sequence table 1-37; at the same time, the kit also contains with 24 primers, using fixed Hybridization Chip 24 single strand DNA probe. The kit provided by the invention supports high throughput, rapid and accurate detection of 12 SNP loci of the LOD susceptibility genes of the pilots, and provides reference for flight personnel selection.

【技术实现步骤摘要】
一组用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点及检测试剂盒
本专利技术属于核酸扩增
，涉及一组用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点及检测试剂盒。
技术介绍
飞行人员的选拔是世界各国都十分重要的问题。国内外相关研究表明，科学的医学选拔不仅能够提高飞行人员最终成飞的预测效率和提高飞机飞行安全，还能大大降低飞行人员训练成本。科学的医学选拔也能提高飞行安全。因此选拔和训练对建设高素质的飞行人员队伍具有重要意义。单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphism，SNP)是由单个核苷酸的改变而引起的DNA序列的改变，造成染色体基因组的多样性。SNP分布广、密度高，已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志，在肿瘤、糖尿病等复杂疾病的研究中起重要作用。其中，全基因组关联分析(GenomeWideAssociationStudy，GWAS)是研究这类复杂疾病易感基因的重要手段。飞行人员作为一个特殊群体，其职业有着高风险和高难度的特点，使得他们要承受很大的生理和心理压力，因而对他们的体质和心理健康有着特定的要求。研究表明，不同个体基础正加速度(+Gz)耐力、高空缺氧耐力、认识反应速度、信息加工能力和突发性心脑血管疾病的发生率存在差异，这种差异与遗传因素有关。
技术实现思路
本专利技术的第一个目的是提供一种用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点的引物对组。其中，所述飞行员LOD易感基因为飞行员迟发性疾病易感基因，所述飞行员LOD易感基因多态性位点为如下12个SNP位点：rs7181866位点、rs6311位点、rs7305115位点、rs4680位点、rs1799983位点、rs5065位点、rs1801133位点、rs3759584位点、rs4340位点、rs11549465位点、rs1800544位点和rs699947位点。这12个SNP位点是对飞行员这一特殊群体飞行寿命影响较大的一组位点，主要含有加速度耐力相关基因、缺氧耐力相关基因、心理和认知相关基因及心脑血管疾病相关基因等。所述rs7181866位点为人基因组中如下序列中括号处所示：gatccaacatagaataggagagagt[A/G]cccaaaatgatggtgaagggagacc；所述rs6311位点为人基因组中如下序列中括号处所示：ATGTCCTCGGAGTGCTGTGAGTGTC[C/T]GGCACTTCCATCCAAAGCCAACAGT；所述rs7305115位点为人基因组中如下序列中括号处所示：ATGGCTCAGATCCCCTCTACACCCC[A/G]GAACCGTGAGTACCTACATTAAAGC；所述rs4680位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCAGCGGATGGTGGATTTCGCTGGC[A/G]TGAAGGACAAGGTGTGCATGCCTGA；所述rs1799983位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCCTGCTGCTGCAGGCCCCAGATGA[G/T]CCCCCAGAACTCTTCCTTCTGCCCC；所述rs5065位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CTTGTCCTCCCTGGCTGTTATCTTC[A/G]GTACTGCAAAGAGAACACAGACATA；所述rs1801133位点为人基因组中如下序列中括号处所示：TTGAAGGAGAAGGTGTCTGCGGGAG[C/T]CGATTTCATCATCACGCAGCTTTTC；所述rs3759584位点为人基因组中如下序列中括号处所示：GGCCTTTTCTCCTGTCTCATCCCCA[C/T]GGTCACTGCAGAGGAGACACATGCC；所述rs4340位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCATTTCTCTAGACCTGCTGCCTAT[(288BPINDEL)/(ALU)/-]ACAGTCACTTTTATGTGGTTTCGCC；其中，288BP的插入/缺失序列如序列表中序列38所示；所述rs11549465位点为人基因组中如下序列中括号处所示：GTTACGTTCCTTCGATCAGTTGTCA[C/T]CATTAGAAAGCAGTTCCGCAAGCCC；所述rs1800544位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCGTTGCGTTCTGCTCCGTCGGCCC[C/G]GAGCTGCATGGCCAACTCCCAGCAG；所述rs699947位点为人基因组中如下序列中括号处所示：GCCAGCTGTAGGCCAGACCCTGGCA[A/C]GATCTGGGTGGATAATCAGACTGAC。本专利技术所提供的用于检测人基因组中12个SNP位点的引物对组，具体由如下1)-12)组成：1)用于检测所述rs7181866位点的引物对1和引物对2；所述引物对1为如下(a1)或(a2)所示的引物对，所述引物对2为如下(a3)或(a4)所示的引物对：(a1)由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a2)由将序列表中序列1和序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对；(a3)由序列表中序列1和序列3所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a4)由将序列表中序列1和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a3)中所述引物对功能相同的引物对；2)用于检测所述rs6311位点的引物对3和引物对4；所述引物对3为如下(a5)或(a6)所示的引物对，所述引物对4为如下(a7)或(a8)所示的引物对：(a5)由序列表中序列4和序列5所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a6)由将序列表中序列4和序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a5)中所述引物对功能相同的引物对；(a7)由序列表中序列4和序列6所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a8)由将序列表中序列4和序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a7)中所述引物对功能相同的引物对；3)用于检测所述rs7305115位点的引物对5和引物对6；所述引物对5为如下(a9)或(a10)所示的引物对，所述引物对6为如下(a11)或(a12)所示的引物对：(a9)由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a10)由将序列表中序列7和序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a8)中所述引物对功能相同的引物对；(a11)由序列表中序列7和序列9所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a12)由将序列表中序列7和序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a10)中所述引物对功能相同的引物对；4)用于检测所述rs4680位点的引物对7和引物对8；所述引物对7为如下(a13)或(a14)所示的引物对，所述引物对8为如下(本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于检测人基因组中12个SNP位点的引物对组，所述12个SNP位点为rs7181866位点、rs6311位点、rs7305115位点、rs4680位点、rs1799983位点、rs5065位点、rs1801133位点、rs3759584位点、rs4340位点、rs11549465位点、rs1800544位点和rs699947位点；所述引物对组由如下1)‑12)组成：1)用于检测所述rs7181866位点的引物对1和引物对2；所述引物对1为如下(a1)或(a2)所示的引物对，所述引物对2为如下(a3)或(a4)所示的引物对：(a1)由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a2)由将序列表中序列1和序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对；(a3)由序列表中序列1和序列3所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a4)由将序列表中序列1和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a3)中所述引物对功能相同的引物对；2)用于检测所述rs6311位点的引物对3和引物对4；所述引物对3为如下(a5)或(a6)所示的引物对，所述引物对4为如下(a7)或(a8)所示的引物对：(a5)由序列表中序列4和序列5所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a6)由将序列表中序列4和序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a5)中所述引物对功能相同的引物对；(a7)由序列表中序列4和序列6所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a8)由将序列表中序列4和序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a7)中所述引物对功能相同的引物对；3)用于检测所述rs7305115位点的引物对5和引物对6；所述引物对5为如下(a9)或(a10)所示的引物对，所述引物对6为如下(a11)或(a12)所示的引物对：(a9)由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a10)由将序列表中序列7和序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a8)中所述引物对功能相同的引物对；(a11)由序列表中序列7和序列9所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a12)由将序列表中序列7和序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a10)中所述引物对功能相同的引物对；4)用于检测所述rs4680位点的引物对7和引物对8；所述引物对7为如下(a13)或(a14)所示的引物对，所述引物对8为如下(a15)或(a16)所示的引物对：(a13)由序列表中序列10和序列11所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a14)由将序列表中序列10和序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a13)中所述引物对功能相同的引物对；(a15)由序列表中序列12和序列13所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a16)由将序列表中序列12和序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a15)中所述引物对功能相同的引物对；5)用于检测所述rs1799983位点的引物对9和引物对10；所述引物对9为如下(a17)或(a18)所示的引物对，所述引物对10为如下(a19)或(a20)所示的引物对：(a17)由序列表中序列14和序列15所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a18)由将序列表中序列14和序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a17)中所述引物对功能相同的引物对；(a19)由序列表中序列14和序列16所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a20)由将序列表中序列14和序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a19)中所述引物对功能相同的引物对；6)用于检测所述rs5065位点的引物对11和引物对12；所述引物对11为如下(a21)或(a22)所示的引物对，所述引物对12为如下(a23)或(a24)所示的引物对：(a21)由序列表中序列17和序列18所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a22)由将序列表中序列17和序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a21)中所述引物对功能相同的引物...

【技术特征摘要】
1.用于检测人基因组中12个SNP位点的引物对组，所述12个SNP位点为rs7181866位点、rs6311位点、rs7305115位点、rs4680位点、rs1799983位点、rs5065位点、rs1801133位点、rs3759584位点、rs4340位点、rs11549465位点、rs1800544位点和rs699947位点；所述引物对组由如下1)-12)组成：1)用于检测所述rs7181866位点的引物对1和引物对2；所述引物对1为如下(a1)或(a2)所示的引物对，所述引物对2为如下(a3)或(a4)所示的引物对：(a1)由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a2)由将序列表中序列1和序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对；(a3)由序列表中序列1和序列3所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a4)由将序列表中序列1和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a3)中所述引物对功能相同的引物对；2)用于检测所述rs6311位点的引物对3和引物对4；所述引物对3为如下(a5)或(a6)所示的引物对，所述引物对4为如下(a7)或(a8)所示的引物对：(a5)由序列表中序列4和序列5所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a6)由将序列表中序列4和序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a5)中所述引物对功能相同的引物对；(a7)由序列表中序列4和序列6所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a8)由将序列表中序列4和序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a7)中所述引物对功能相同的引物对；3)用于检测所述rs7305115位点的引物对5和引物对6；所述引物对5为如下(a9)或(a10)所示的引物对，所述引物对6为如下(a11)或(a12)所示的引物对：(a9)由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a10)由将序列表中序列7和序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a8)中所述引物对功能相同的引物对；(a11)由序列表中序列7和序列9所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a12)由将序列表中序列7和序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a10)中所述引物对功能相同的引物对；4)用于检测所述rs4680位点的引物对7和引物对8；所述引物对7为如下(a13)或(a14)所示的引物对，所述引物对8为如下(a15)或(a16)所示的引物对：(a13)由序列表中序列10和序列11所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a14)由将序列表中序列10和序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a13)中所述引物对功能相同的引物对；(a15)由序列表中序列12和序列13所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a16)由将序列表中序列12和序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a15)中所述引物对功能相同的引物对；5)用于检测所述rs1799983位点的引物对9和引物对10；所述引物对9为如下(a17)或(a18)所示的引物对，所述引物对10为如下(a19)或(a20)所示的引物对：(a17)由序列表中序列14和序列15所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a18)由将序列表中序列14和序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a17)中所述引物对功能相同的引物对；(a19)由序列表中序列14和序列16所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a20)由将序列表中序列14和序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a19)中所述引物对功能相同的引物对；6)用于检测所述rs5065位点的引物对11和引物对12；所述引物对11为如下(a21)或(a22)所示的引物对，所述引物对12为如下(a23)或(a24)所示的引物对：(a21)由序列表中序列17和序列18所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a22)由将序列表中序列17和序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a21)中所述引物对功能相同的引物对；(a23)由序列表中序列17和序列19所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a24)由将序列表中序列17和序列19经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a23)中所述引物对功能相同的引物对；7)用于检测所述rs1801133位点的引物对13和引物对14；所述引物对13为如下(a25)或(a26)所示的引物对，所述引物对14为如下(a27)或(a28)所示的引物对：(a25)由序列表中序列20和序列21所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a26)由将序列表中序列20和序列21经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a25)中所述引物对功能相同的引物对；(a27)由序列表中序列20和序列22所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a28)由将序列表中序列20和序列22经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a27)中所述引物对功能相同的引物对；8)用于检测所述rs3759584位点的引物对15和引物对16；所述引物对15为如下(a29)或(a30)所示的引物对，所述引物对16为如下(a31)或(a32)所示的引物对：(a29)由序列表中序列23和序列24所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a30)由将序列表中序列23和序列24经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a29)中所述引物对功能相同的引物对；(a31)由序列表中序列23和序列25所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a32)由将序列表中序列23和序列25经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a31)中所述引物对功能相同的引物对；9)用于检测所述rs4340位点的引物对17和引物对18；所述引物对17为如下(a33)或(a34)所示的引物对，所述引物对18为如下(a35)或(a36)所示的引物对：(a33)由序列表中序列26和序列27所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a34)由将序列表中序列26和序列27经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a33)中所述引物对功能相同的引物对；(a35)由序列表中序列26和序列28所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a36)由将序列表中序列26和序列28经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a35)中所述引物对功能相同的引物对；10)用于检测所述rs11549465位点的引物对19和引物对20；所述引物对19为如下(a37)或(a38)所示的引物对，所述引物对20为如下(a39)或(a40)所示的引物对：(a37)由序列表中序列29和序列30所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a38)由将序列表中序列29和序列30经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a37)中所述引物对功能相同的引物对；(a39)由序列表中序列29和序列31所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a40)由将序列表中序列29和序列31经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a39)中所述引物对功能相同的引物对；11)用于检测所述rs1800544位点的引物对21和引物对22；所述引物对21为如下(a41)或(a42)所示的引物对，所述引物对22为如下(a43)或(a44)所示的引物对：(a41)由序列表中序列32和序列33所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a42)由将序列表中序列32和序列33经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a41)中所述引物对功能相同的引物对；(a43)由序列表中序列32和序列34所示的两条单链DNA分子组成的引物对；(a44)由将序列表中序列32和序列34经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a43)中所述引物对功能相同的引物对；12)用于检测所述rs699947位点的引物对23和引物对24；所述引物对23为如下(a45)...

【专利技术属性】
技术研发人员：蔡庆，邹志康，王广云，张岩，马中立，
申请(专利权)人：中国人民解放军空军总医院，博奥生物集团有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11