EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用及筛选方法技术

本发明专利技术提供了EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，属于基因工程技术领域，所述标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；所述rs13419896处的核苷酸为A；所述rs1868092处的核苷酸为A；所述rs1868093处的核苷酸为A；所述rs1868094处的核苷酸为T，携带具有上述标签位点的核苷酸的携带者进入高原后既可以更好地适应低氧环境，也可以降低血液粘滞度。

Application and screening of EPAS1 gene labelling single nucleotide in screening for people living in plateau environment

The present invention provides the application of EPAS1 gene tag single nucleotide in screening population adapted to plateau environment, belonging to the field of genetic engineering technology. The tag loci include rs13419896, rs1868092, rs1868093 and rs1868094; the nucleotide at rs13419896 is A; the nucleotide at rs1868092 is A; and the nucleotide at rs1868093 is A. The nucleotide at the rs1868094 is T, and the carriers carrying the nucleotides with the above tagging sites can adapt to hypoxic environment and reduce blood viscosity after entering the plateau.

【技术实现步骤摘要】
EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用及筛选方法
本专利技术涉及基因工程
，具体涉及EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用及筛选方法。
技术介绍
我国是一个多山的高原国家，3000米以上高原地区占我国陆地面积1/4,是西部大开发的主要方向和主战场。其中，青藏高原是最主要的地区，具有丰富的资源(矿产、石油、水利、旅游等)，亟待开发。同时，青藏高原还是我国重要的国防和军事保障区域。然而，对于初进高原的人群，高原低氧可引起高原反应，常见的症状有头痛、失眠、食欲减退、疲倦及呼吸困难等。一般来讲，平原人初次进入海拔3000m以上高原时，50～75％的人出现高原反应，6～24小时发病，3～10天习服后症状逐渐减轻至消失，少数可发展为高原脑水肿或高原肺水肿。因此，高原低氧对人体的危害大大影响了高原的建设、发展和稳定，故预防和减少急性高原反应，保持人体健康尤其重要，但是目前还没有方法能够对可能出现高原反应人群进行预测。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；rs13419896处的核苷酸为A；rs1868092处的核苷酸为A；rs1868093处的核苷酸为A；rs1868094处的核苷酸为T。携带具有上述标签位点的核苷酸的携带者进入高原后既可以更好地适应低氧环境，也可以降低血液粘滞度。本专利技术提供了EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，所述标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；所述rs13419896处的核苷酸为A；所述rs1868092处的核苷酸为A；所述rs1868093处的核苷酸为A；所述rs1868094处的核苷酸为T。本专利技术还提供了一种适应高原环境人群的筛选方法，包括以下步骤：1)提取待测样本基因组DNA，将所述待测样本基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物；所述PCR扩增使用的引物包括rs13419896引物对、rs1868092引物对、rs1868093引物对或rs1868094引物对；所述rs13419896引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.1所示，所述rs13419896引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.2所示；所述rs1868092引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.3所示，所述rs1868092引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.4所示；所述rs1868093引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.5所示，所述rs1868093引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.6所示；所述rs1868094引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.7所示，所述rs1868094引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.8所示；2)将所述步骤1)得到的扩增产物进行测序，根据所述测序确定的核苷酸序列确认rs13419896处、rs1868092处、rs1868093处和rs1868094处的核苷酸种类；所述测序使用的引物包括rs13419896测序引物、rs1868092测序引物、rs1868093测序引物或rs1868094测序引物；所述rs13419896测序引物的序列如SEQIDNo.9所示；所述rs1868092测序引物的序列如SEQIDNo.10所示；所述rs1868093测序引物的序列如SEQIDNo.11所示；所述rs1868094测序引物的序列如SEQIDNo.12所示；3)当所述rs13419896处的核苷酸为A、rs1868092处的核苷酸为A、rs1868093处的核苷酸为A且rs1868094处的核苷酸为T，判断待测样本属于适应高原环境的人群。优选的，所述步骤1)PCR扩增的体系每50μl包括：2×高保真PCR酶体系25μl，ddH2O19μl，浓度为10μM的上游引物0.5μl，浓度为10μM的下游引物0.5μl，样本基因组DNA5μl。优选的，所述步骤1)PCR扩增的条件包括：94℃5min，94℃30s，60℃30s，72℃30s，30个循环后72℃延伸10min。本专利技术还提供了一种试剂盒，包括上述技术方案所述的SEQIDNo.1～12所示序列的引物和2×高保真PCR酶体系。优选的，所述rs13419896引物对的上游引物的浓度为10μM的，所述rs13419896引物对的下游引物的浓度为10μM；所述rs1868092引物对的上游引物的浓度为10μM，所述rs1868092引物对的下游引物的浓度为10μM；所述rs1868093引物对的上游引物的浓度为10μM，所述rs1868093引物对的下游引物的浓度为10μM；所述rs1868094引物对的上游引物的浓度为10μM，所述rs1868094引物对的下游引物的浓度为10μM；所述rs1868094测序引物的浓度为10μM；所述rs13419896测序引物的浓度为10μM；所述rs1868092测序引物的浓度为10μM；所述rs1868093测序引物的浓度为10μM；所述2×高保真PCR酶体系的体积为3～8ml。优选的，所述rs13419896引物对的上游引物的体积为50～150μl，所述rs13419896引物对的下游引物的体积为50～150μl；所述rs1868092引物对的上游引物的体积为50～150μl，所述rs1868092引物对的下游引物的体积为50～150μl；所述rs1868093引物对的上游引物的体积为50～150μl，所述rs1868093引物对的下游引物的体积为50～150μl；所述rs1868094引物对的上游引物的体积为50～150μl的，所述rs1868094引物对的下游引物的体积为50～150μl；所述rs1868094测序引物的体积为50～150μl；所述rs13419896测序引物的体积为50～150μl；所述rs1868092测序引物的体积为50～150μl；所述rs1868093测序引物的体积为50～150μl。本专利技术提供了EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；rs13419896处的核苷酸为A；rs1868092处的核苷酸为A；rs1868093处的核苷酸为A；rs1868094处的核苷酸为T。携带具有上述标签位点的核苷酸的携带者进入高原后既可以更好地适应低氧环境，也可以降低血液粘滞度。本专利技术实施例的结果显示：EPAS1基因标签单核苷酸的标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；rs13419896处的核苷酸为A；rs1868092处的核苷酸为A；rs1868093处的核苷酸为A；rs1868094处的核苷酸为T。携带具有上述标签位点的核苷酸的携带者进入高原后既可以更好地适应低氧环境，也可以降低血液粘滞度。具体实施方式本专利技术提供了EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，标签的位点包括rs13419896、rs18680本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，所述标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；所述rs13419896处的核苷酸为A；所述rs1868092处的核苷酸为A；所述rs1868093处的核苷酸为A；所述rs1868094处的核苷酸为T。

【技术特征摘要】
1.EPAS1基因标签单核苷酸在筛选适应高原环境人群中的应用，所述标签的位点包括rs13419896、rs1868092、rs1868093和rs1868094；所述rs13419896处的核苷酸为A；所述rs1868092处的核苷酸为A；所述rs1868093处的核苷酸为A；所述rs1868094处的核苷酸为T。2.一种适应高原环境人群的筛选方法，包括以下步骤：1)提取待测样本基因组DNA，将所述待测样本基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物；所述PCR扩增使用的引物包括rs13419896引物对、rs1868092引物对、rs1868093引物对或rs1868094引物对；所述rs13419896引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.1所示，所述rs13419896引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.2所示；所述rs1868092引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.3所示，所述rs1868092引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.4所示；所述rs1868093引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.5所示，所述rs1868093引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.6所示；所述rs1868094引物对的上游引物的序列如SEQIDNo.7所示，所述rs1868094引物对的下游引物的序列如SEQIDNo.8所示；2)将所述步骤1)得到的扩增产物进行测序，根据所述测序确定的核苷酸序列确认rs13419896处、rs1868092处、rs1868093处和rs1868094处的核苷酸种类；所述测序使用的引物包括rs13419896测序引物、rs1868092测序引物、rs1868093测序引物或rs1868094测序引物；所述rs13419896测序引物的序列如SEQIDNo.9所示；所述rs1868092测序引物的序列如SEQIDNo.10所示；所述rs1868093测序引物的序列如SEQIDNo.11所示；所述rs1868094测序引物的序列如SEQIDNo.12所示；3)当所述rs13419896处的核苷酸为A、rs1868092处的核苷酸为A、rs1868093处的核苷酸为A且rs1868094处的核苷酸为T，判断待测样本属于适应高原环境的人群。3.根据权利要求2所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤1)PCR扩增...

【专利技术属性】
技术研发人员：肖军，李翠莹，李小薇，刘娟，范秀，
申请(专利权)人：中国人民解放军空军总医院，
类型：发明
国别省市：北京,11