TGM5基因突变检测特异性引物和液相芯片制造技术

本发明专利技术公开了一种TGM5基因突变检测液相芯片和特异性引物，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物所述特异性引物序列为：针对T116C位点的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8，针对A212G位点的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10，和/或针对A117G位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术公开了一种TGM5基因突变检测液相芯片和特异性引物，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物所述特异性引物序列为：针对T116C位点的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8，针对A212G位点的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10，和/或针对A117G位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本专利技术所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。【专利说明】TGM5基因突变检测特异性引物和液相芯片
本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种TGM5基因突变检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
TGM5称谷氨酸胺转移酶(Transglutaminase 5)。位于15号染色体15ql5.2的长臂上，更准确的说，TGM5基因的碱基在15号染色体上位于43524792到43559054碱基对之间，包含13个外显子和12个内含子。TGM5基因是转谷氨酰胺酶家族的成员，可以促进谷氨酰胺和赖氨酸残基之间形成蛋白的交叉连接，从而使蛋白质组装的稳定化，这种反应对钙存在依赖性，在这个基因的突变与肢端脱皮综合征有关。目前，TGM5基因突变检测方法主要有=Illumina光纤微珠芯片技术，虽然Illumina光纤微珠芯片技术是高灵敏度和精确性的高通量检测系统，但是自动化程度低，手工操作比较多，难以满足实际应用的需要。本专利技术目标检测的TGM5基因突变位点，如表所示:【权利要求】1.一种TGM5基因突变检测液相芯片，其特征在于，包括有: (A).针对TGM5基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对:每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为:针对T116C位点的SEQ ID N0.7及SEQ ID N0.8，针对A212G位点的SEQID N0.9 及 SEQ ID N0.10，和 / 或针对 A117G 位点的 SEQ ID N0.11 及 SEQ ID N0.12 ;所述tag 序列选自 SEQID N0.1 -SEQ ID N0.6 ； (B).有ant1-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述ant1-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述ant1-tag序列选自SEQ ID NO).13-SEQ ID N0.18，且所述ant1-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的TGM5基因突变检测液相芯片，其特征在于，所述扩增引物为:针对 T116C 位点的 SEQ ID N0.19 及 SEQ ID N0.20，针对 A212G 位点的 SEQ ID NO).21 及SEQ IDNO).22，和 / 或针对 A117G 位点的 SEQ ID NO).23 及 SEQ ID N0.24。3.根据权利要求1或2所述的TGM5基因突变检测液相芯片，其特征在于，所述ASPE引物为:针对T116C位点的由SEQ ID N0.1和SEQ ID N0.7组成的序列及由SEQ ID N0.2和SEQ ID N0.8组成的序列，针对A212G位点的由SEQ ID NO).3和SEQ ID N0.9组成的序列及由SEQ ID NO).4和SEQ ID N0.10组成的序列，和/或针对Al 17G位点的由SEQ ID N0.5和SEQ ID NO).11组成的序列及由SEQ ID N0.6和SEQ ID N0.12组成的序列。4.根据权利要求1所述的TGM5基因突变检测液相芯片，其特征在于，所述间隔臂为5-10 个 T。5.用于TGM5基因突变检测的特异性引物，其特征在于，所述特异性引物序列为:针对 T116C 位点的 SEQ ID N0.7 及 SEQ ID N0.8，针对 A212G 位点的 SEQ ID N0.9 及 SEQ IDN0.10，和 / 或针对 A117G 位点的 SEQ ID NO).11 及 SEQ ID NO).12 ?【文档编号】C12N15/11GK103451273SQ201210179355【公开日】2013年12月18日 申请日期:2012年5月31日 优先权日:2012年5月31日【专利技术者】许嘉森, 吴诗扬 申请人:益善生物技术股份有限公司本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种TGM5基因突变检测液相芯片，其特征在于，包括有：(A).针对TGM5基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对T116C位点的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8，针对A212G位点的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10，和/或针对A117G位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12；所述tag序列选自SEQID?NO.1～SEQ?ID?NO.6；(B).有anti?tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti?tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti?tag序列选自SEQ?ID?NO).13～SEQ?ID?NO.18，且所述anti?tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，吴诗扬，
申请(专利权)人：益善生物技术股份有限公司，
类型：发明
国别省市：