一种用于检测卵巢癌易感性的分子标记、试剂盒及其检测方法技术

技术编号:8188197 阅读:209 留言:0更新日期:2013-01-09 23:52
本发明专利技术公开了一种用于检测卵巢癌易感性的分子标记,其核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,第1098位存在一个单核苷酸多态性:G>T。一种用于检测卵巢癌易感性的试剂盒,包括特异性引物,该引物为一对,具有SEQ?ID?NO:2和SEQ?ID?NO:3的序列。一种体外检测样品是否存在GADD45A基因的单核苷酸多态性的方法,步骤如下:(1)用特异性引物扩增样品的GADD45A基因,得到扩增产物;(2)对扩增产物进行序列测定,检测扩增产物中是否存在以下单核苷酸多态性:1098G>T。本发明专利技术的方法,检测简单、准确、快速,特异性强,对于高危人群或易感个体及卵巢癌患者实施有效的早诊、早治和个体化防治具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及,具体地涉及GADD45A基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)及其与卵巢癌的相关性,及检测这些SNP的方法和试剂盒,属于分子生物学和医学领域。
技术介绍
卵巢癌是致死率最高的女性生殖系统肿瘤,2008年全球新发病例225500人,死亡140200人。由于起病隐匿,症状不明显,多数患者发现时已届晚期,晚期卵巢癌患者5年生存率仅为30 45%左右,预后差,而早期卵巢癌患者5年生存率高达90%,这提示我们提 高卵巢癌患者预后和生存的关键是早诊、早治,因此探讨卵巢癌发生发展的生物学机制,寻找鉴定卵巢癌易感人群的分子标记,卵巢癌患者分子分型和预后预测的分子标记,对于高危人群或易感个体及卵巢癌患者实施有效的早诊、早治和个体化防治具有重要意义。现有技术中,虽然已经有超过200个候选基因和20个遗传区域的1100个遗传变异与卵巢癌易感性相关,但是与卵巢癌相关性很强的遗传变异却很少。并且没有GADD45A基因与卵巢癌相关性的报道,更没有GADD45A基因SNP与卵巢癌相关性的报道。因此,本领域急需进一步寻找卵巢癌易感基因,开发检测卵巢癌高危人群和易感个体的方法、试剂盒,以及相关的治疗药物。
技术实现思路
针对上述现有技术,本申请的专利技术人经过深入而广泛的研究,对大量候选基因的SNP进行了测定和分析,首次发现GADD45A和卵巢癌易感性密切相关,可作为卵巢癌易感性检测或者早期诊断的分子标记,因此,本专利技术提供了一种用于检测卵巢癌易感性的试剂盒及其方法,以及体外检测样品是否存在GADD45A基因的单核苷酸多态性的方法。本专利技术是通过以下技术方案实现的一种用于检测卵巢癌易感性的分子标记,其核苷酸序列如SEQ ID NO :1所示,其与正常的GADD45A基因相比,区别在于第1098位存在一个单核苷酸多态性G>T,即第1098位的碱基包括碱基G和碱基T两种情形,当为碱基G时,为正常的GADD45A基因,当为碱基T时,为突变的GADD45A基因cagtggctgg taggcagtgg ctgggaggca gcggcccaat tagtgtcgtg cggcccgtgg 60cgaggcgagg tccggggagc gagcgagcaa gcaaggcggg aggggtggcc ggagctgcgg 120cggctggcac aggaggagga gcccgggcgg gcgaggggcg gccggagagc gccagggcct 180gagctgccgg agcggcgcct gtgagtgagt gcagaaagca ggcgcccgcg cgctagccgt 240ggcaggagca gcccgcacgc cgcgctctct ccctgggcga cctgcagttt gcaatatgac 300tttggaggaa ttctcggctg gagagcagaa gaccgaaagg tgagtcggcc tgcggactct 360tccggcccga acttctctta cctaccccgc gctccccggt gcagccgggc tgtggaaggc 420ttgcagggga ggaagctaaa aagtttgcac agggcaactc ccgcccttgc tccctcggga480ctctccgtgg agctcccacg gactgaaaga gcgtgccccc caacccgaac gagccccgcc540ggggcctttg caaagggcag c agtggccgt cgctgcccgt gcggctcccg tggctggcag600cctgtggcag gggcactctc gggacttctc acgggacgcc cggtccttgg gcgtgcaggg660gtcatggggg gtgacggggc cgcgggagcg ccgggttttc gtagagccca ggtgcgcggt720ggtgcttgca ttcgagaggg aggggcgtgg taccggacga ggggggcggc gatggccccg780agggcaccgg ggctgacggg acccctcgcc cttgcccgcg tgtaggatgg ataaggtggg840ggatgccctg gaggaagtgc tcagcaaagc cctgagtcag cgcacgatca ctgtcggggt900gtacgaagcg gccaagctgc tcaacgtgta agtggggccc ttgcgcgtcc cccatggcac960cccttcccgc cccagcccgg gaggtcgcct tggctgggcg cccctcgccc ggccgcgcca1020cttcctgtcg cttttctgcc tgtctcggaa gggagggggc gagcgggccg ggcggcgacc1080cccagggacc cgggcagrgg ttgagggcgc ccgcgcttct gcgctcactg gccccgcccg11401098ctgcccccag cgaccccgat aacgtggtgt tgtgcctgct ggcggcggac gaggacgacg1200acagagatgt ggctctgcag atccacttca ccctgatcca ggcgttttgc tgcgagaacg1260acatcaacat cctgcgcgtc agcaacccgg gccggctggc ggagctcctg ctcttggaga1320ccgacgctgg ccccgcggcg agcgagggcg ccgagcagcc cccggacctg cactgcgtgc1380tggtgacggt aagggactgg gggactgcag cctgcagggt agagccccgg aaggacggga1440gtcagggctg ggttgcctga ttgtggatct gtggtaggtg ggggtcagga gggtggctgc1500ctttgtccga ctagagtgtg gctggacttt cagccgagat gtgctagttt catcaccagg1560attttctgtg gtacagaaca tgtctaagca tgctggggac tgccagcagc ggaagagatc1620cctgtgagtc agcagtcagc ccagctactc cctacctaca tctgcactgc ctcccgtgac1680taattccttt agcagggcag attagataaa gccaaatgaa ttcctggctc acccctcatt1740aaggagtcag cttcattctc tgccagtcag agctaaaaat agaaattgtg taggagacaa1800accttgttaa ttccctagaa atacattaag aggatagagt ggaatttttt ttctctgcaa1860tcttgcattt 本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于检测卵巢癌易感性的分子标记,其特征在于:其核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,第1098位存在一个单核苷酸多态性:G>T,即第1098位的碱基包括碱基G和碱基T两种情形:cagtggctgg?taggcagtgg?ctgggaggca?gcggcccaat?tagtgtcgtg?cggcccgtgg????60cgaggcgagg?tccggggagc?gagcgagcaa?gcaaggcggg?aggggtggcc?ggagctgcgg????120cggctggcac?aggaggagga?gcccgggcgg?gcgaggggcg?gccggagagc?gccagggcct????180gagctgccgg?agcggcgcct?gtgagtgagt?gcagaaagca?ggcgcccgcg?cgctagccgt????240ggcaggagca?gcccgcacgc?cgcgctctct?ccctgggcga?cctgcagttt?gcaatatgac????300tttggaggaa?ttctcggctg?gagagcagaa?gaccgaaagg?tgagtcggcc?tgcggactct????360tccggcccga?acttctctta?cctaccccgc?gctccccggt?gcagccgggc?tgtggaaggc????420ttgcagggga?ggaagctaaa?aagtttgcac?agggcaactc?ccgcccttgc?tccctcggga????480ctctccgtgg?agctcccacg?gactgaaaga?gcgtgccccc?caacccgaac?gagccccgcc????540ggggcctttg?caaagggcag?cagtggccgt?cgctgcccgt?gcggctcccg?tggctggcag????600cctgtggcag?gggcactctc?gggacttctc?acgggacgcc?cggtccttgg?gcgtgcaggg????660gtcatggggg?gtgacggggc?cgcgggagcg?ccgggttttc?gtagagccca?ggtgcgcggt????720ggtgcttgca?ttcgagaggg?aggggcgtgg?taccggacga?ggggggcggc?gatggccccg????780agggcaccgg?ggctgacggg?acccctcgcc?cttgcccgcg?tgtaggatgg?ataaggtggg????840ggatgccctg?gaggaagtgc?tcagcaaagc?cctgagtcag?cgcacgatca?ctgtcggggt????900gtacgaagcg?gccaagctgc?tcaacgtgta?agtggggccc?ttgcgcgtcc?cccatggcac????960cccttcccgc?cccagcccgg?gaggtcgcct?tggctgggcg?cccctcgccc?ggccgcgcca????1020cttcctgtcg?cttttctgcc?tgtctcggaa?gggagggggc?gagcgggccg?ggcggcgacc????1080cccagggacc?cgggcagrgg?ttgagggcgc?ccgcgcttct?gcgctcactg?gccccgcccg????1140?????????????????1098ctgcccccag?cgaccccgat?aacgtggtgt?tgtgcctgct?ggcggcggac?gaggacgacg????1200acagagatgt?ggctctgcag?atccacttca?ccctgatcca?ggcgttttgc?tgcgagaacg????1260acatcaacat?cctgcgcgtc?agcaacccgg?gccggctggc?ggagctcctg?ctcttggaga????1320ccgacgctgg?ccccgcggcg?agcgagggcg?ccgagcagcc?cccggacctg?cactgcgtgc????1380tggtgacggt?aagggactgg?gggactgcag?cctgcagggt?agagccccgg?aaggacggga????1440gtcagggctg?ggttgcctga?ttgtggatct?gtggtaggtg?ggggtcagg...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:苑存忠孔北华杨其峰闫实刘晓燕杨宁
申请(专利权)人:山东大学齐鲁医院
类型:发明
国别省市:

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