一种CDKAL1基因多态性检测特异性引物和液相芯片制造技术

技术编号:6548894 阅读:220 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种CDKAL1基因多态性检测特异性引物和液相芯片,该液相芯片主要包括有:由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的特异性引物,所述特异性引物序列分别选自:针对A107C的SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.10、针对G323C的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12、针对A210G的SEQ?ID?NO.13及SEQ?ID?NO.14、针对A75G的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16中的一对以上;所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1~SEQ?ID?NO.8中的序列;微球,扩增引物。所制备的CDKAL1基因多态性检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术屈于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种⑶KALl基因多态性检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
CDK5调节亚单位相关蛋白1类似物1 (cyckin-cbpendent kinase 5 regulatorysubunit-associated protein 1-like 1, CDKAL1)基因是 CDK5 (细胞周期素依赖激酶幻调节亚单位相关蛋白1的编码基因,位于第6号染色体短臂22. 3区,其信号区位于第5个内含子上,在人类胰腺和骨骼肌细胞中高度表达。CDK5在保护β细胞功能、降低血糖方面发挥重要的作用,CDK5在高糖毒性的作用下可导致β细胞变性,而CDKALl基因编码的蛋白质能够抑制CDK5的活化。若CDKALl基因位点发生变异,则对CDK5的抑制作用减弱,导致β细胞功能受损,胰岛素分泌减少。CDKALl基因通过影响胰岛β细胞的分泌功能,从而影响胰岛素的分泌。本专利技术目标检测的⑶KALl基因突变位点,如表所示

【技术保护点】
1.一种CDKAL1基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有:A.针对CDKAL1基因的不同多态性位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物,每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列分别选自:针对A107C的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、针对G323C的SEQID NO.11及SEQ ID NO.12、针对A210G的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对A75G的SEQ IDNO.15及SEQ ID NO.16中的一对以上;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8中的序列;B.分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与A中所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17~SEQ ID NO.24中的序列,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列,上述每种微球具有不同颜色编码;C.用于扩增具有A107C、G323C、A210G和A75G中的一个以上多态性位点目标序列的引物。

【技术特征摘要】
1.一种⑶KALl基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有A.针对CDKALl基因的不同多态性位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物, 每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列分别选自针对A107C的SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 10、针对 G323C 的 SEQID NO. 11 及 SEQ ID NO. 12、针对 A210G 的 SEQ ID NO. 13 及 SEQ ID NO. 14、针对A75G的SEQ IDN0. 15及SEQ ID NO. 16中的一对以上;所述tag序列选自SEQ ID NO. 1 SEQ ID NO. 8中的序列;B.分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与A中所选 tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 17 SEQ ID NO. M中的序列,所述 anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列,上述每种微球具有不同颜色编码;C.用于扩增具有A107C、G323C、A210G和A75G中的一个以上多态性位点目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的CDKALl基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物选自针对 A107C 和 / 或 G323C 的 SEQ ID NO. 25 和 SEQ ID NO. 26、针对 A2IOG 的 SEQ ID NO. 27 和 SEQ ID NO.沘、针对 A75G 的 SEQ ID NO. 29 和 SEQ ID NO. 30 中的一对以上。3.根据权利要求1所述的CDKALl基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物选自针对A107C的由SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 9组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ IDN0. 10组成的序列、针对G323C的由SEQ ID N0. 3和SEQ ID NO. 11组成的序列及由SEQ IDN0. 4 和 SEQ ID N0. 12 组成的序列、针对 A210G 的由 SEQ ID N0. 5 和 SEQ ID N0. 13 组成的序列及由SEQ ID N0. 6和SEQ ID N0...

【专利技术属性】
技术研发人员:许嘉森吴诗扬甘丹翠
申请(专利权)人:广州益善生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:81

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