一种诊治食管癌的分子标志物制造技术

技术编号:13507344 阅读:115 留言:0更新日期:2016-08-10 16:50
本发明专利技术公开了DEPDC1B基因及其表达产物可作为食管癌早期诊断的分子标志物。本发明专利技术的实验表明DEPDC1B基因在食管癌患者和正常食管组织中存在差异表达,通过检测受试者食管组织中DEPDC1B基因的表达情况即可判断受试者是否患有食管癌。另外,本发明专利技术还公开了DEPDC1B基因及其表达产物可以作为食管癌治疗的靶标,用于指导新药的研发。

【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术公开了DEPDC1B基因及其表达产物可作为食管癌早期诊断的分子标志物。本专利技术的实验表明DEPDC1B基因在食管癌患者和正常食管组织中存在差异表达,通过检测受试者食管组织中DEPDC1B基因的表达情况即可判断受试者是否患有食管癌。另外,本专利技术还公开了DEPDC1B基因及其表达产物可以作为食管癌治疗的靶标,用于指导新药的研发。【专利说明】-种诊治食管癌的分子标志物
本专利技术设及生物
,具体地设及DEPDC1B基因在食管癌的诊断、治疗中的用 途。
技术介绍
食管癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一。中国是食管癌的高发国家,食管癌 在肿瘤相关的死因中排名第四。在河北省磁县,食管癌的发病率和死亡率均排名在所有肿 瘤的首位。由于食管癌早期缺乏特异症状,大部分患者在就诊时已处于疾病的中晚期。另 夕h尽管手术水平不断提高,食管癌细胞对放疗、化疗的耐受使食管癌患者五年生存率仍维 持在较低水平。因此,及早发现食管癌的高危人群,高危人群定期接受食管内镜检查,才能 早期发现、早期诊断、早期治疗食管癌患者,最终才能提高食管癌患者的生存率,改善患者 的生存质量,保存劳动力,更好地创造社会效益。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种可用于食管癌早期诊断的分子标志物。相比现有的食 管癌的诊断方法,使用基因标志物来诊断食管癌的具有及时性、特异性和灵敏性,从而使患 者在疾病早期就能知晓疾病风险,针对风险高低,采取相应的预防和治疗措施。 为了实现上述目的,本专利技术采用如下技术方案: 本专利技术提供了检测DEPDC1B基因表达的产品在制备诊断食管癌的工具中的应用。 进一步,所述检测DEPDC1B基因表达的产品包括检测DEPDC1B基因 mRNA水平的产 品、和/或检测DEPDC1B蛋白水平的产品。 进一步,所述检测DEPDC1B基因表达的产品包括:通过RT-PCR、实时定量PCR、免疫 检测、原位杂交或忍片检测DEPDC1B基因表达W诊断食管癌的产品。[000引进一步,所述用RT-PCR诊断食管癌的产品至少包括一对特异扩增DEPDC1B基因的 引物;所述用实时定量PCR诊断食管癌的产品至少包括一对特异扩增DEPDC1B基因的引物; 所述用免疫检测诊断食管癌的产品包括:与DEPDC1B蛋白特异性结合的抗体;所述用原位杂 交诊断食管癌的产品包括:与DEPDC1B基因的核酸序列杂交的探针;所述用忍片诊断食管癌 的产品包括:蛋白忍片和基因忍片;其中,蛋白忍片包括与DEPDC1B蛋白特异性结合的抗体, 基因忍片包括与DEPDC1B基因的核酸序列杂交的探针。 所述用实时定量PCR诊断食管癌的产品至少包括的一对特异扩增DEPDC1B基因的 引物如沈Q ID NO.3和沈Q ID NO.4所示。 所述检测DEPDC1B基因表达的产品可W是检测DEPDC1B基因表达的试剂、也可W是 包含所述试剂的试剂盒、忍片、试纸等,也可W是使用所述试剂的高通量测序平台。 所述诊断食管癌的工具包括但不限于忍片、试剂盒、试纸、或高通量测序平台;高 通量测序平台是一种特殊的诊断食管癌的工具,随着高通量测序技术的发展,对一个人的 基因表达谱的构建将成为十分便捷的工作。通过对比疾病患者和正常人群的基因表达谱, 容易分析出哪个基因的异常与疾病相关。因此,在高通量测序中获知DEPDCIB基因的异常与 食管癌相关也属于DEPDC1B基因的用途,同样在本专利技术的保护范围之内。 本专利技术还提供了一种诊断食管癌的工具,所述工具包括检测DEPDC1B基因表达的 试剂;所述试剂包括检测DEPDC1B基因 mRNA的引物和/或探针、检测DEPDC1B蛋白的抗体。 所述工具包括但不限于忍片、试剂盒、试纸、或高通量测序平台。 其中,所述忍片包括基因忍片、蛋白质忍片;所述基因忍片包括固相载体W及固定 在固相载体的寡核巧酸探针,所述寡核巧酸探针包括用于检测DEPDC1B基因转录水平的针 对DEPDC1B基因的寡核巧酸探针;所述蛋白质忍片包括固相载体W及固定在固相载体的 DEPDC1B蛋白的特异性抗体;所述基因忍片可用于检测包括DEPDC1B基因在内的多个基因 (例如,与食管癌相关的多个基因)的表达水平。所述蛋白质忍片可用于检测包括DEPDC1B蛋 白在内的多个蛋白质(例如与食管癌相关的多个蛋白质)的表达水平。通过将多个与食管癌 的标志物同时检测,可大大提高食管癌诊断的准确率。[001引其中,所述试剂盒包括基因检测试剂盒和蛋白免疫检测试剂盒;所述基因检测试 剂盒包括用于检测DEPDC1B基因转录水平的试剂;所述蛋白免疫检测试剂盒包括DEPDC1B蛋 白的特异性抗体。进一步,所述试剂包括使用RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交或 忍片方法检测D E P D C1B基因表达水平过程中所需的试剂。优选地,所述试剂包括针对 DEPDC1B基因的引物和/或探针。根据DEPDC1B基因的核巧酸序列信息容易设计出可W用于 检测DEPDC1B基因表达水平的引物和探针。 所述试纸包括检测DEPDC1B基因表达的试剂。 所述高通量测序平台包括检测DEPDC1B基因表达的试剂。 与DEPDC1B基因的核酸序列杂交的探针可W是DNA、RNA、DNA-RNA嵌合体、PNA或其 它衍生物。所述探针的长度没有限制,只要完成特异性杂交、与目的核巧酸序列特异性结 合,任何长度都可W。所述探针的长度可短至25、20、15、13或10个碱基长度。同样,所述探针 的长度可长至60、80、100、150、300个碱基对或更长,甚至整个基因。由于不同的探针长度对 杂交效率、信号特异性有不同的影响,所述探针的长度通常至少是14个碱基对,最长一般不 超过30个碱基对,与目的核巧酸序列互补的长度W15-25个碱基对最佳。所述探针自身互补 序列最好少于4个碱基对,W免影响杂交效率。 进一步,所述DEPDCIB蛋白的特异性抗体包括单克隆抗体、多克隆抗体。所述 DEPDC1B蛋白的特异性抗体包括完整的抗体分子、抗体的任何片段或修饰(例如,,嵌合抗 体、3〇。乂^曰13^(曰13')2爪等。只要所述片段能够保留与06口0018蛋白的结合能力即可。用于 蛋白质水平的抗体的制备时本领域技术人员公知的,并且本专利技术可W使用任何方法来制备 所述抗体。 在本专利技术的具体实施方案中,所述检测DEPDC1B基因 mRNA的引物包括SEQ ID NO.3 和SEQ ID NO.4所示的引物对。 本专利技术还提供了 DEPDC1B基因和/或其表达产物的抑制剂在制备治疗食管癌的药 物中的应用。所述抑制剂包括抑制DEPDC1B基因表达的试剂、和/或抑制DEPDC1B基因表达产 物的试剂。 进一步,所述抑制DEPDC1B基因表达的试剂包括抑制基因转录的试剂、抑制基因翻 译的试剂;所述抑制DEPDC1B基因表达产物的试剂包括抑制DEPDC1B基因 mRNA的试剂、抑制 DEPDCIB蛋白的试剂。所述抑制DEPDCIB基因 mRNA的试剂包括抑制mRNA稳定性的试剂、抑制 mRNA翻译活性的试剂。所述抑制DEPDC1B蛋白的试剂包括抑制DEPDC1B蛋白稳定性的试剂、 抑制DEPDCIB蛋白活性的试剂、抑制DEPDCIB蛋白功能的试剂。 进一步,抑制DE本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测DEPDC1B基因表达的产品在制备诊断食管癌的工具中的应用。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:杨承刚肖枫宋宏涛
申请(专利权)人:北京泱深生物信息技术有限公司
类型:发明
国别省市:北京;11

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