PRV毒力基因突变的检测方法及检测试剂盒技术

技术编号:9855617 阅读:186 留言:0更新日期:2014-04-02 18:17
本发明专利技术公开了用于检测PRV毒力基因gE、gC、gD、TK的引物组,还公开了所述引物组的用途、包含所述引物组的试剂盒以及使用所述引物组对PRV毒力基因进行PCR扩增的方法。所述的引物组可以专一性的鉴别PRV毒力基因是否突变,该引物组具有高特异性和敏感性,可以确保测定结果的精准,对指导实践生产具有重要的意义。

【技术实现步骤摘要】
PRV毒力基因突变的检测方法及检测试剂盒
本专利技术涉及病毒检测领域,具体涉及PRV毒力基因突变的检测方法及检测试剂盒。
技术介绍
伪狂犬病(Pseudorabies,PR 又名 Aujeszky’s disease, AD)是由伪狂犬病病毒(Pseudorabies Virus, PRV)引起的多种家畜、野生动物、伴侣动物和实验动物的一种急性传染病。在自然条件下,本病最常见于猪、牛、羊、犬、猫和鼠类。伪狂犬病病毒除对猪以外,对所有易感动物都是致死性病程。对猪主要表现为神经症状、流涎、呼吸困难、繁殖障碍、生长停滞、失重及高死亡率。哺乳仔猪感染伪狂犬病的临床表现最为典型、严重和一致,均出现神经症状、麻痹、衰竭死亡,死亡率几乎高达100% ;随着年龄增长死亡率逐渐下降,成猪仅为2%,但一般情况下成猪感染不发病,而呈隐形经过,仅见打喷嚏、咳嗽、体温升高等轻微症状;妊娠母猪感染伪狂犬病毒可引起流产、死胎、产弱仔和木乃伊化胎儿;对公猪可引起睾丸鞘膜炎。该病具有高度的传染性,一旦在猪群中发现,将很快通过空气和接触经呼吸道传播给其他猪只和猪场,近来的研究表明伪狂犬病病毒还可以通过乳汁和生殖道感染。不同的伪狂犬病毒具有不同的毒力,据其毒力的不同可以分为:强毒株,普通野毒株,减毒不彻底毒株,减毒完全弱毒株。不同毒力的毒株引起的临床症状不同,强毒株引起的临床症状为:除常见症状外,还可以引起皮肤奇痒。普通野毒株引起的临床症状主要是:繁殖障碍等。减毒不彻底的毒株主要引起:仔猪腹泻、母猪轻微的繁殖障碍。减毒完全弱毒株不致病,安全毒株,所以作为疫苗使用。PRV的毒力的不同由其毒力基因决定,目前国内外对伪狂犬的基因研究表明,影响伪狂犬毒力的主要决定基因集中在gE ,gC,gD, TK, gB, RR这几个基因。经过对现有技术的文献检索发现,目前中国专利技术专利申请并没有关于检测PRV这四个毒力基因的试剂盒,但是近年来,PRV呈现一定的流行性,为了能够更好的监测毒力基因的变化,以分析PRV的毒力变化,研制一种可以快速检测几个毒力基因突变的试剂盒非常有必要。
技术实现思路
因此本专利技术旨在设计一组引物,用于这些基因的扩增,然后对PCR产物进行序列测定,根据结果比对分析出不同毒株之间的差异,并且结合抗原性预测软件分析,可以分析出病毒毒力和抗原性是否发生变化,这可以指导实践用于分子流行病学调查,指导疫苗效力检验,根据预测的结果判断伪狂犬病毒的毒力变化趋势,再结合疫苗的免疫攻毒实验结果指导疫苗的效力检验。本专利技术提供的用于检测PRV毒力基因突变的引物组,包括分别扩增PRV毒力基因gE、gC、gD和TK的引物组,其中,扩增gE的引物组包括SEQ ID N0.1所示序列引物和SEQ ID N0.2所示序列引物的引物组、具有SEQ ID N0.3所示序列引物和SEQ ID N0.4所示序列引物的引物组以及SEQ ID N0.5所示序列引物和SEQ ID N0.6所示序列引物的引物组;其中,扩增gC的引物组包括SEQ ID N0.7所示序列引物和SEQ ID N0.8所示序列引物的引物组以及SEQ ID N0.9所示序列引物和SEQ ID N0.10所示序列引物的引物组;其中,扩增所述gD的引物组包括SEQ ID N0.11所示序列引物和SEQ ID N0.12所示序列引物的引物组以及SEQ ID N0.13所示序列引物和SEQ ID N0.14所示序列引物的引物组;其中,扩增所述TK的引物组为SEQ ID N0.15所示序列引物和SEQ ID N0.16所示序列引物的引物组。本专利技术还提供所述的引物组在检测PRV毒力基因突变中的应用。本专利技术还提供所述的引物组的PRV毒力基因突变检测试剂或试剂盒。本专利技术还提供一种检测PRV毒力基因突变的方法,其为以PRV的DNA为模板,用所述的引物组进行PCR扩增,将各PCR产物分别测序后,进行序列比对。其中,每25 μ I的反应体系中使用0.5~1.5μ I的引物和50~IOOng的DNA模板,反应条件为:96 ~94°C 预变性 2min ~5min ;96 ~94°C变性 30s ~40s ;60 ~64°C退火 30s ~60s ;72?延伸 30s ~60s ;30-40 个循环;72O延伸 IOmin。本专利技术根据GeneBank中PRV中的gE,gC,gD, TK基因序列进行了特异性的引物设计,所以所扩增的PCR产物可以鉴定出gE,gC,gD,TK四个毒力基因是否发生突变,并且可以确保所扩增的序列的测序结果的准确性和唯一性。本专利技术提供的引物组及试剂盒可以用于检测gE,gC,gD, TK这四个毒力基因是否发生突变,用于分子流行病学调查和指导PRV毒力变化趋势同时可以指导疫苗使用效果的评价,因此具有重要的现实意义。本专利技术不同的毒力基因PCR可以在相同的反应条件和相同的反应体系下完成,全程所花费的时间不到两个小时,扩增产物可以直接进行测序,因此在集中检测PRV样品时具有快速简便的特点。【附图说明】图1为扩增的不同目的基因的PCR产物的电泳结果。图2为用Vector NTI软件分析的gC基因的突变位置。【具体实施方式】`以下实施例用于说明本专利技术,但不用来限制本专利技术的范围。实施例1根据NCBI GenBank公布的NC_001651序列公布的gE,gD, gC, TK的序列,设计出用于目的基因gE,gD,gC,TK扩增的PCR引物对,结果见表1。本文档来自技高网
...

【技术保护点】
用于检测PRV毒力基因突变的引物组,其特征在于,包括分别扩增PRV毒力基因gE、gC、gD和TK的引物组,其中,扩增gE的引物组包括SEQ ID No.1所示序列引物和SEQ ID No.2所示序列引物的引物组、具有SEQ ID No.3所示序列引物和SEQ ID No.4所示序列引物的引物组以及SEQ ID No.5所示序列引物和SEQ ID No.6所示序列引物的引物组;其中,扩增gC的引物组包括SEQ ID No.7所示序列引物和SEQ ID No.8所示序列引物的引物组以及SEQ ID No.9所示序列引物和SEQ ID No.10所示序列引物的引物组;其中,扩增所述gD的引物组包括SEQ ID No.11所示序列引物和SEQ ID No.12所示序列引物的引物组以及SEQ ID No.13所示序列引物和SEQ ID No.14所示序列引物的引物组;其中,扩增所述TK的引物组为SEQ ID No.15所示序列引物和SEQ ID No.16所示序列引物的引物组。

【技术特征摘要】
1.用于检测PRV毒力基因突变的引物组,其特征在于,包括分别扩增PRV毒力基因gE、gC、gD和TK的引物组, 其中,扩增gE的引物组包括SEQ ID N0.1所示序列引物和SEQ ID N0.2所示序列引物的引物组、具有SEQ ID N0.3所示序列引物和SEQ ID N0.4所示序列引物的引物组以及SEQID N0.5所示序列引物和SEQ ID N0.6所示序列引物的引物组; 其中,扩增gC的引物组包括SEQ ID N0.7所示序列引物和SEQ ID N0.8所示序列引物的引物组以及SEQ ID N0.9所示序列引物和SEQ ID N0.10所示序列引物的引物组; 其中,扩增所述gD的引物组包括SEQ ID N0.11所示序列引物和SEQ ID N0.12所示序列引物的引物组以及SEQ ID N0.13所示序列引物和SEQ ID N0.14所示序列引物的引物组...

【专利技术属性】
技术研发人员:卢会英吴星亮侯艳红满坤焦连国王贵华赵亚荣
申请(专利权)人:北京大北农科技集团股份有限公司动物医学研究中心 北京大北农科技集团股份有限公司 福州大北农生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:北京;11

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1