本发明专利技术涉及分子生物学领域，公开了用于检测CYP2C19基因rs4244285681G/A和rs4986893636G/A的SNP位点的特异性寡核苷酸探针，以及检测上述SNP位点时，用于扩增CYP2C19基因的特异性引物对。这种探针其能够特异地与CYP2C19不同基因型杂交，包括CYP2C19*1型，CYP2C19*2型和CYP2C19*3型。本发明专利技术产品可用于检测中国人群相关药物的代谢能力（如波立维，奥美拉唑，伏立康唑等），进行临床用药方案指导和调整，为临床个体化用药提供依据，可提高疗效，降低毒副作用风险。
【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术涉及分子生物学领域，公开了用于检测CYP2C19基因rs4244285681G/A和rs4986893636G/A的SNP位点的特异性寡核苷酸探针，以及检测上述SNP位点时，用于扩增CYP2C19基因的特异性引物对。这种探针其能够特异地与CYP2C19不同基因型杂交，包括CYP2C19*1型，CYP2C19*2型和CYP2C19*3型。本专利技术产品可用于检测中国人群相关药物的代谢能力（如波立维，奥美拉唑，伏立康唑等），进行临床用药方案指导和调整，为临床个体化用药提供依据，可提高疗效，降低毒副作用风险。【专利说明】用于CYP2C19基因芯片检测的特异性引物对和探针
本专利技术涉及分子生物学领域和核酸检测领域，具体设计用于扩增CYP2C19基因的特异性引物对和用于CYP2C19基因芯片检测的特异性探针。
技术介绍
细胞色素P450同功酶也称药酶，是由一系列结构和功能相关的酶组成的超家族，是人体内药物代谢的主要酶系。P450酶系组成复杂，由基因多样性控制。目前已知至少有12个亚族。许多P450同功酶具有遗传多态性，使得相应的酶活性表现出差异，对药物的代谢能力也不同。根据对药物代谢能力的差异将人群分为:超快代谢(UM)、快代谢(EM)、中等代谢(頂)、慢代谢(PM)等四种类型。CYP2C19是细胞色素P450(Cytochrome P450，CYP)酶系第二亚家族中的重要一员。通过CYP2C19代谢的药物(如氯吡咯雷、质子泵抑制剂，抗惊厥药等)随患者基因型不同，其疗效和副作用也有明显不同。通过检测患者DNA中CYP2C19基因型，判定患者的药物代谢速率类型，可帮助医生正确选择药物并合理调整药物剂量，提高药物使用有效性，并降低毒副作用。在中国人中，CYP2C19等位基因主要是*1，*2，*3型。*2、*3等位基因编码的酶无活性，由此导致的慢代谢在中国人中的发生率约为35%。目前测定CYP2C19基因型的方法主要采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)、手工或自动测序、序列特异性引物PCR等方法，操作繁琐，检测周期长，检测结果不易准确，难以满足临床检验的要求。近几年在高科技领域内出现的最具时代特征的重大科技进展之一便是基因芯片。用基因芯片检测CYP2C19基因亚型，发挥基因芯片检测操作简单、快捷、结果准确的特点，它是将能反映样本中大量基因信息的基因探针(寡核苷酸探针、cDNA克隆、PCR产物等)，有序固定在固相支持物(如醛基、氨基、巯基、羧基等活性基团修饰的载玻片或硅片、尼龙膜、硝酸纤维素膜)上形成阵列，通过与实`际样本(或扩增产物)进行杂交反应，只需一次实验，就可高通量获得所有待检基因的信息。这种平行检测、高信息通量的特点使其在基因表达、基因多态性检测等方面的应用具有很强的先进性和明显的优势。对于指导临床个性化用药，具有重要的现实意义。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种用于检测CYP2C19基因SNP位点的特异性扩增引物对和特异性寡核苷酸杂交探针。这种用于检测CYP2C19基因SNP位点的特异性寡核氨酸探针可用于检测CYP2C19*2 (681G/A, rs4244285)和 CYP2C19*3 (636G/A, rs4986893)位点。寡核氨酸探针序列如下，使用时可从下列三条序列中挑选一条:所述的检测位点为681A时，特异性寡核苷酸探针序列为含有以下核苷酸序列之(I)SEQ ID N0.1:5’-ATTATTTCCCAGGAACCCAT-3’ ；(2) SEQ ID N0.2:5’-TGATTATTTCCCAGGAACCCAT-3’ ；(3) SEQ ID N0.3:5’-TATTTCCCAGGAACCCAT-3’ ；所述的检测位点为681G时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一:(4) SEQ ID N0.4:5’-ATTATTTCCCGGGAACCC-3’ ；(5) SEQ ID N0.5:5’-TTATTTCCCGGGAACCCAT-3’ ；(6) SEQ ID N0.6:5’-GATTATTTCCCGGGAACCCATA-3’ ；所述的检测位点为636G时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一:(7) SEQ ID N0.7:5’-ACCCCCTGGATCCAGGTA-3’ ； (8) SEQ ID N0.8:5’-GCACCCCCTGGATCCAGGT-3’ ；(9) SEQ ID N0.9:5’-ACCCCCTGGATCCAGGTAAG-3’ ；所述的检测位点为636A时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一:(IO)SEQ ID N0.10:5，-ACCCCCTGAATCCAGGTAAG-3，；(Il)SEQ ID N0.11:5’-GCACCCCCTGAATCCAGG-3’ ；(12) SEQ ID N0.12:5’ -AGCACCCCCTGAATCCAG-3’。优选的，所述的检测位点为681A时，特异性寡核苷酸探针为SEQ ID N0.1-3中的一个；所述的检测位点为681G时，特异性寡核苷酸探针为SEQ ID N0.4-6中的一个；所述的检测位点为636G时，特异性寡核苷酸探针为SEQ ID N0.7-9中的一个；所述的检测位点为 636A时，特异性寡核苷酸探针为SEQ ID N0.10-12中的一个。更优选的，在上述的特异性寡核苷酸探针的5’端还包含一段5’氨基(-NH2)修饰的PolydT (多聚脱氧胸苷酸)，长度为5-25。即特异性寡核苷酸探针的5’端还包含一段 5-25聚的聚脱氧胸苷酸。检测上述CYP2C19基因SNP位点时，用于扩增CYP2C19rs4244285681G/A和 CYP2C19rs4986893636G/A这两个位点所使用的特异性引物对如下:所述的检测位点为681G/A时，所述引物对序列含有以下核苷酸序列之一:(I)上游 SEQ ID N0.13:5，-CTTGGCATATTGTATCTATACCTTT-3，下游SEQ ID N0.14:5，-CAAAACACAAATGATGCCTACAAAT-3，；或者，(2)上游 SEQ ID N0.15:5，-TACAACCAGAGCTTGGCATA-3’下游SEQ ID N0.16:5’-TACACTGACGAACGCATAAA-3’ ；或者，(3)上游 SEQ ID N0.17:5，-ACAATAAAAATTTCCCCATC-3’下游SEQ ID N0.18:5，-GTCCAGTTCCTCATTACGAA-3，；所述的检测位点为636G/A，所述引物对序列含有以下核苷酸序列之一:(4)上游 SEQ ID N0.19:5，-CACCCTGTGATCCCACTTTC-3，下游SEQ ID N0.20:5，-TCTGTCGGTACCCCACTTAT-3，；或者，(5)上游 SEQ ID N0.21:5，-CCAATCATTTAGCTTCACCC-3，下游SEQ ID N0.22:5’ -AAGGTGATTTGAGGTTTCGG-3’，或者，(6)上游 SEQ ID N0.23:5，-CACTTTCATCCTGGGCTG-3，下游SEQ ID本文档来自技高网...
【技术保护点】
一组用于检测CYP2C19基因SNP位点的特异性寡核苷酸探针，其特征在于，所述特异性寡核苷酸探针用于检测CYP2C19rs4244285681G/A和CYP2C19rs4986893636G/A的SNP位点；所述的检测位点为681A时，特异性寡核苷酸探针序列为含有以下核苷酸序列之一：（1）SEQ?ID?No.1：5“?ATTATTTCCCAGGAACCCAT?3“；（2）SEQ?ID?No.2：5“?TGATTATTTCCCAGGAACCCAT?3“；（3）SEQ?ID?No.3：5“?TATTTCCCAGGAACCCAT?3“；所述的检测位点为681G时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（4）SEQ?ID?No.4：5“?ATTATTTCCCGGGAACCC?3“；（5）SEQ?ID?No.5：5“?TTATTTCCCGGGAACCCAT?3“；（6）SEQ?ID?No.6：5“?GATTATTTCCCGGGAACCCATA?3“；所述的检测位点为636G时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（7）SEQ?ID?No.7：5“?ACCCCCTGGATCCAGGTA?3“；（8）SEQ?ID?No.8：5“?GCACCCCCTGGATCCAGGT?3“；（9）SEQ?ID?No.9：5“?ACCCCCTGGATCCAGGTAAG?3“；所述的检测位点为636A时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（10）SEQ?ID?No.10：5“?ACCCCCTGAATCCAGGTAAG?3“；（11）SEQ?ID?No.11：5“?GCACCCCCTGAATCCAGG?3“；（12）SEQ?ID?No.12：5“?AGCACCCCCTGAATCCAG?3“。...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：邢军芬，朱滨，孙悦，张宇，张莹，
申请(专利权)人：上海百傲科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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