使用固定的引物直接捕获、扩增及测序靶标DNA制造技术

某些实施方案提供用于捕获基因组片段的方法。所述方法可以包括：获得包含第一群表面结合寡核苷酸和第二群表面结合寡核苷酸的基底；将所述第一群表面结合寡核苷酸的第一成员杂交到筛选寡核苷酸，所述筛选寡核苷酸包含与所述第一成员杂交的区域以及包含基因组序列的区域；延伸所述第一群表面结合寡核苷酸的所述第一成员以产生载体结合筛选引物，所述载体结合筛选引物包含与所述基因组序列互补的序列；将所述载体结合筛选引物杂交到包含所述基因组序列的核酸片段；延伸所述载体结合筛选引物以产生包含例如在基因组中位于所述基因组序列侧翼的序列的延伸产物；以及在所述基底上扩增所述延伸产物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用固定的引物直接捕获、扩增及测序靶标DNA交叉引用本专利申请要求2010年9月24日提交的美国临时专利申请序列号61/386，390以及2011年5月11日提交的美国临时专利申请序列号61/485，062的优先权，这两份专利全文并入本文中。政府权利本专利技术根据国立卫生研究院授予的第HG000205号合同在政府支持下完成。政府享有本专利技术的某些权利。背景在许多测序方法中，尤其是重测序方法(S卩，其中对基因座进行重测序的方法)中，首先捕获靶标，然后进行测序。多种靶标捕获方法已由人们开发并与高通量测序系统集成。具体地讲，使用珠粒或微阵列的基于杂交的测定法以及使用分子倒置探针或基因组环化寡核苷酸的基于溶液中的技术可应用于捕获靶标DNA。然后制备经捕获的DNA用于测序。通常采用复杂的分子生物学方案来制备富集的DNA样品，并且在某些情况下，测序文库的产生涉及许多酶促反应、纯化步骤以及通过凝胶电泳进行的大小选择。用于靶标捕获DNA测序的样品制备过程可能是劳动密集型的，而后续样品操作会导致DNA含量的偏差并增加测序错误率。专利技术概述本文提供用于捕获和扩增核酸片段例如由RNA制备的基因组片段或c本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：S·梅利坎加斯，J·布恩洛斯特罗，H·P·基，
申请(专利权)人：斯坦福大学托管董事会，
类型：
国别省市：