用于鉴别并治疗白血病中对于CTA4拮抗剂的耐药性的组合物和方法技术

本发明专利技术涉及鉴别并治疗白血病中对于CTA4拮抗剂的耐药性的组合物和方法。特别地，本发明专利技术涉及用于鉴别并治疗伊匹单抗耐药性白血病的组合物和方法。

Composition and method for identification and treatment of resistance to cta4 antagonists in leukemia

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于鉴别并治疗白血病中对于CTA4拮抗剂的耐药性的组合物和方法相关申请基于35U.S.C.§119(e)，本申请主张2017年6月27日提交的美国临时申请62/525,401的优先权，该临时申请通过引用而整体并入本文。
本专利技术涉及鉴别并治疗白血病中对于CTA4拮抗剂的耐药性的组合物和方法。更特别地，本专利技术涉及用于鉴别并治疗伊匹单抗(Ipilimumab)耐药性白血病的组合物和方法。
技术介绍
细胞毒T淋巴细胞相关蛋白质4(CTLA4)拮抗剂(例如，伊匹单抗(Ipilimumab))可诱导一些类型的瘤形成(例如，白血病)的持久肿瘤缓解。不幸的是，很多白血病患者对使用伊匹单抗进行的治疗不产生应答。据此，在本文所述的专利技术之前，亟需确定更有效的预测对于CTLA4封锁的应答和耐药性的方法。
技术实现思路
本专利技术提供用于鉴别基因表达模式的技术，其区分CTLA4拮抗剂在瘤形成(例如，白血病)中的临床结果。特别地，本文的技术提供基因表达模式/签名，其鉴别可能对使用CTLA4拮抗剂诸如伊匹单抗进行的治疗本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种确定使用细胞毒T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)拮抗剂治疗患有白血病的受试者是否将导致所述受试者的临床受益的方法，所述方法包含：/n从患有白血病的受试者获得测试样本；/n测定所述测试样本中至少一种白血病相关基因的表达水平；/n将所述测试样本中所述白血病相关基因的所述表达水平与参考样本中所述白血病相关基因的表达水平比较；以及/n确定如果所述测试样本中所述白血病相关基因的所述表达水平相对于所述参考样本中所述白血病相关基因的所述水平表达上有差异，所述CTLA4拮抗剂是否将抑制所述受试者的白血病。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170627 US 62/525,4011.一种确定使用细胞毒T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)拮抗剂治疗患有白血病的受试者是否将导致所述受试者的临床受益的方法，所述方法包含：
从患有白血病的受试者获得测试样本；
测定所述测试样本中至少一种白血病相关基因的表达水平；
将所述测试样本中所述白血病相关基因的所述表达水平与参考样本中所述白血病相关基因的表达水平比较；以及
确定如果所述测试样本中所述白血病相关基因的所述表达水平相对于所述参考样本中所述白血病相关基因的所述水平表达上有差异，所述CTLA4拮抗剂是否将抑制所述受试者的白血病。


2.根据权利要求1所述的方法，其中所述测试样本从白血病组织、肿瘤微环境或肿瘤浸润免疫细胞获得。


3.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者体内的临床受益包含通过实体肿瘤的疗效评估标准(RECIST)界定的完全或部分应答；通过RECIST界定的病情稳定；或无论疾病级数或通过irRC标准界定的应答为何仍长期存活。


4.根据权利要求1所述的方法，其中所述测试样本从所述白血病获得，其中所述白血病相关基因包含CD47分子(CD47)基因；以及
确定如果所述测试样本中所述CD47基因的表达水平高于所述参考样本中所述CD47基因的水平，使用所述CTLA4拮抗剂治疗患有白血病的所述受试者将在所述受试者体内导致临床受益。


5.根据权利要求1所述的方法，其中所述测试样本从所述白血病获得，其中所述白血病相关基因包含CD47分子(CD47)基因；以及
确定如果所述测试样本中所述CD47基因的表达水平等于或低于所述参考样本中所述CD47基因的水平，使用所述CTLA4拮抗剂治疗患有白血病的所述受试者将不在所述受试者体内导致临床受益。


6.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本包含脱氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)。


7.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本包含血浆样本、血液样本、骨髓样本、淋巴结、或白血病感染的任何部位。


8.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本包含循环肿瘤细胞。


9.根据权利要求1所述的方法，其中所述参考样本是从健康的正常组织、接受来自CTLA4拮抗剂的临床受益的白血病、或未接受来自CTLA4拮抗剂的临床受益的白血病获得的。


10.根据权利要求1所述的方法，其中经由Affymetrix基因芯片杂交、下一代测序、核糖核酸测序(RNA-seq)、实时逆转录酶聚合酶链反应(实时RT-PCR)分析、免疫组化(IHC)、免疫荧光、或甲基化特异性PCR来检测所述白血病相关基因的表达水平。


11.根据权利要求1所述的方法，其中经由RNA-seq检测所述白血病相关基因的所述表达水平，且所述参考样本是从来自与所述测试样本相同个体的健康正常组织或来自不同个体的一个或多个健康正常组织获得。


12.根据权利要求1所述的方法，其中经由RT-PCR检测所述白血病相关基因的所述表达水平，且所述参考样本是从与所述测试样本相同的个体获得。


13.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者是人类。


14.根据权利要求1所述的方法，还包括以化疗剂、放射疗法、冷冻疗法、激素疗法或免疫疗法治疗所述受试者。


15.根据权利要求14所述的方法，其中所述化疗剂包含达卡巴嗪、替莫唑胺、nab-紫杉醇、紫杉醇、顺铂或卡铂。


16.根据权利要求4所述的方法，还包含给药所述CD47基因的抑制剂，从而治疗所述白血病。


17.根据权利要求16所述的方法，其中所述抑制剂包含小分子抑制剂、RNA干扰(RN...

【专利技术属性】
技术研发人员：P·巴切莱迪，
申请(专利权)人：达纳法伯癌症研究所有限公司，
类型：发明
国别省市：美国;US