一种鉴别HBV基因突变类型的方法及其专用芯片与试剂盒技术

技术编号:1752523 阅读:261 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了鉴别HBV基因突变类型的方法及其专用芯片与试剂盒。该鉴别HBV基因突变类型的方法,是以待检测乙型肝炎病毒的基因组为模板,用如下引物组和没有3′-5′端外切酶活性的DNA聚合酶进行多重PCR扩增,然后将得到的PCR产物与基因芯片进行杂交,根据杂交结果确定HBV基因突变类型;所述引物组包括一种共用引物和一种或一种以上的特异引物;所述特异引物的5′端是条码序列,所述条码序列的长度是5-25nt,所述条码序列与乙型肝炎病毒基因组较低的同源性;所述特异引物的3′端有5-25nt与乙型肝炎病毒的包括一个突变位点的野生型或突变型碱基在内的相应片段完全匹配;所述基因芯片包括若干种探针,所述探针与所述条码序列一一对应,每种探针只含有一种所述条码序列。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种鉴别HBV基因突变类型的方法,是以待检测乙型肝炎病毒的基因组为模板,用如下引物组和没有3′-5′端外切酶活性的DNA聚合酶进行多重PCR扩增,然后将得到的PCR产物与基因芯片进行杂交,根据杂交结果确定HBV基因突变类型;所述引物组包括一种共用引物和一种或一种以上的特异引物;所述共用引物与所述特异引物组成的每对引物能扩增包括乙型肝炎病毒基因组的一个突变位点的突变型或野生型碱基在内的核苷酸片段;所述特异引物的5′端是条码序列,所述条码序列的长度是5-25nt,所述条码序列与乙型肝炎病毒基因连续匹配或相同的碱基数小于5个;所述特异引物的3′端有5-25nt与乙型肝炎病毒的包括一个突变位点的野生型或突变型碱基在内的相应片段完全匹配;当所述引物组包括一种以上的所述特异引物时,一种所述特异引物的5′端是一种条码序列,各种条码序列之间Tm值之差小于等于5℃,相互之间以及与所有的引物之间没有交叉杂交,并且无发夹结构,与含有所述HBV目的基因的物种的基因组连续匹配或相同的碱基数小于10个;所述基因芯片包括若干种探针,所述探针与所述条码序列一一对应,每种探针只含有一种所述条码序列。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:郭永赵传赞程京高华方王国青
申请(专利权)人:博奥生物有限公司清华大学
类型:发明
国别省市:11[中国|北京]

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