EGFR基因突变筛查评估分子靶向药物疗效的检测方法技术

技术编号:3820173 阅读:1062 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及EGFR基因突变筛查评估分子靶向药物疗效的检测方法,其特征在于,具体步骤为:采集被测者血清或肿瘤组织样本,进行基因组DNA的抽提,对EGFR基因第18-21号外显子进行检测,相应位点特异性引物的设计以及用于序列测定的实验方案、试剂以及报告生成系统,通过同时检测分析个体的EGFR基因第18-21号外显子是否存在突变,来评估用于治疗癌症个体的表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂类药物的有效性。本发明专利技术的优点是可用于癌症个体表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂类药物的应用。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种EGFR基因突变筛查评估分子靶向药物疗效的检测方法,其特征在于,具体步骤为: 步骤1.采集被测者血清或肿瘤组织样本; 步骤2.基因组DNA的抽提方法: 采用硅胶吸附法抽提步骤1中被测者DNA,抽提时间为2-3小时,采用 电泳凝胶成像法对DNA浓度和纯度作检测,肉眼可见清晰白色条带即可判断获得的DNA能进入下一步检测; 步骤3.基因分型: 将每一个被测者样本分别放入4个反应孔,4个反应孔分别检测EGFR基因18-21号外显子突变情况,采用PCR技 术进行扩增、凝胶电泳技术检测纯度、测序技术对这些位点进行基因型进行确定: 步骤3-1,反应体系配置: 在每一个反应孔中加入PCR标准反应体系,标准反应体系的引物浓度为10uM,反应体系总体积为20ul,其中,PCR试剂5ul,正 向引物和反向引物各0.4ul,20ng/μl的步骤2得到的EGFR DNA模板3μl,去离子水11.2ul; EGFR基因第18外显子正向和反向引物: 正相引物:ttccaaatgagctggcaagt 反向引物:gtca atggcccctttcataa EGFR基因第19外显子正向和反向引物: 正相引物:ccccagcaatatcagcctta 反向引物:agtgctgggtagatgccagt EGFR基因第20外显子正向和反向引 物: 正相引物:gcacagcttttcctccatga 反向引物:gatgggacaggcactgattt EGFR基因第21外显子正向和反向引物: 正相引物:actaacgttcgccagccata 反向引 物:tcattcactgtcccagcaag 步骤3-2,PCR反应条件: 将反应孔在ABI9700型PCR扩增仪上进行反应,反应条件为95℃预热15分钟;再进行35个循环的95℃、45秒;60℃、45秒;72℃、60秒;72℃ 、7分钟后降温至4℃; 步骤3-3,将反应孔在PCR扩增仪反应后的产物进行电泳检测,有肉眼可见清晰白色条带即可进入下一步: a.1wt%琼脂糖凝胶插小号孔梳子; b.2000bpDNA标记物6ul c.步骤3-2的P CR产物4ul加入电泳缓冲液1ul d.电泳电压:120v e.电泳时间:20min拍摄一张电泳图;30min拍摄一张电泳图;...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:毛丹丹傅咏南
申请(专利权)人:上海中优医药高科技有限公司
类型:发明
国别省市:31[]

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