一种锚定巢式多重 PCR 联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物和方法技术

本发明专利技术提供了一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物，包括多重PCR特异性引物组1和多重PCR特异性引物组2，所述多重PCR特异性引物组1为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列组成的引物组，所述多重PCR特异性引物组2为SEQ ID NO:33～SEQ ID NO:64所示的核苷酸序列组成的引物组。本发明专利技术还提供了一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物和方法，本发明专利技术检测方法通用性更高，本发明专利技术检测方法能够在仅部分知晓或未知晓融合基因结构的情况下，准确灵敏地检测融合基因。

Multiple PCR primers and methods for detection of gene fusion by anchored nested multiplex PCR combined with high-throughput sequencing

The invention provides a method for anchoring multiple PCR primer nested multiplex PCR combined with high-throughput sequencing to detect gene fusion, including multiple PCR specific primer set 1 specific primers and multiple PCR group 2, the multiple PCR primer pairs specific primers for SEQ ID 1 NO:1 ~ SEQ ID NO:32 the nucleotide sequence of the primer set the multiple PCR specific primer set 2 nucleotide sequence for SEQ ID NO:33 ~ SEQ ID NO:64 represented by the. The invention also provides a method for anchoring multiple PCR primers and nested multiplex PCR combined with high-throughput sequencing to detect gene fusion, detection method of the invention is more general, the testing method of the invention can only partially known or unknown fusion gene structure, accurate and sensitive detection of fusion gene.

【技术实现步骤摘要】
一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物和方法
本专利技术涉及检测领域，更具体地涉及一种一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物和方法
技术介绍
研究表明，在哺乳动物(如人)中，基因融合是导致某些疾病(如癌症)的原因之一。以混合谱系白血病基因(mixedlineage-leukemiagene，简称为“MLL”)为例，MLL融合蛋白可以引起下游基因的表观遗传学修饰异常，导致下游癌基因激活，从而诱发白血病。MLL异位产生的融合蛋白发挥着致癌基因的作用，除了最常见的MLL-MLLT3(acutemyeloidleukemia(AML)急性髓性白血病)、MLL-MLLT2(AF4)外，还有MLL与以下伙伴基因形成融合基因：MLLT1(ENL)、MLLT10(AF10)、MLLT4(AF6)、ELL等。在诸多的MLL融合基因中，对于acutemyeloidleukemia(AML)急性髓性白血病，大约有18％AML是MLLT3基因(也称为AF9)与MLL发生重排(MLL-r)导致的；目前，与MLL发生融合的50多种基因中，MLLT3基因是第二多本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物，其特征在于，包括多重PCR特异性引物组1和多重PCR特异性引物组2，所述多重PCR特异性引物组1为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列组成的引物组，所述多重PCR特异性引物组2为SEQ ID NO:33～SEQ ID NO:64所示的核苷酸序列组成的引物组。

【技术特征摘要】
1.一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的多重PCR引物，其特征在于，包括多重PCR特异性引物组1和多重PCR特异性引物组2，所述多重PCR特异性引物组1为SEQIDNO:1～SEQIDNO:32所示的核苷酸序列组成的引物组，所述多重PCR特异性引物组2为SEQIDNO:33～SEQIDNO:64所示的核苷酸序列组成的引物组。2.一种锚定巢式多重PCR联合高通量测序检测基因融合的试剂盒，其特征在于，包括如权利要求1所述的多重PCR引物，还包括接头序列、锚定引物1以及锚定引物2；所述接头序列包括接头序列的长序列和接头序列的短序列，所述接头序列的长序列由顺次连接的上游测序引物互补序列、barcode序列、接头序列的短序列的互补序列组成；所述锚定引物2由所述测序序列的一部分序列组成；所述锚定引物1由所述锚定引物2的一部分序列组成。3.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述barcode序列是长度为10个碱基的DNA序列。4.根据权利要求2或3所述的试剂盒，其特征在于，所述接头序列的长序列的序列如SEQIDNO:67所示，所述接头序列的短序列的序列如SEQIDNO:68所示。5.根...

【专利技术属性】
技术研发人员：周艳河，张燕菲，何广良，张纪斌，许少飞，赖炳权，
申请(专利权)人：广州永诺健康科技有限公司，广州永诺医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44