检测样本中ZNF198‑FGFR1融合基因的寡核苷酸、方法和试剂盒技术

本发明专利技术公开一种用于检测8p11骨髓增殖综合征(EMS)患者中ZNF198‑FGFR1融合基因的试剂盒，其包括扩增ZNF198‑FGFR1融合基因的引物和探针，及内参基因ABL的引物和探针。本发明专利技术可快速检测EMS患者体内是否存在ZNF198‑FGFR1融合基因及其表达量的多少。利用本发明专利技术完成的检测结果准确，灵敏，可辅助诊断骨髓增殖综合征，确定融合类型，对在疾病发生的早期使用针对性的靶向药物具有较强的指导作用，对于及时干预治疗、调整治疗方案、评价治疗效果、预测预后都具有重要意义。

Oligonucleotides, methods and kits for ZNF198 FGFR1 fusion gene in a sample detection

The invention discloses a method for detecting 8p11 myeloproliferative syndrome (EMS) ZNF198 kit FGFR1 fusion gene in patients, including amplification primers and probes ZNF198 FGFR1 fusion gene, primer and probe and reference gene ABL. The invention can detect the presence of ZNF198 in patients with EMS FGFR1 fusion gene and its expression amount. By using the invention to complete the detection result is accurate, sensitive and can assist in diagnosis of myeloproliferative syndrome, determine fusion type, for use in early disease targeted drug targeting has a strong guiding role, for timely intervention, adjust the treatment and assessment of therapeutic efficacy and prognosis has important significance.

【技术实现步骤摘要】
检测样本中ZNF198-FGFR1融合基因的寡核苷酸、方法和试剂盒
本专利技术提供检测样本中ZNF198-FGFR1融合基因的寡核苷酸、方法和试剂盒，采用探针Taqman实时荧光定量PCR技术，用于检测人类8p11骨髓增殖综合征(EMS)患者体内ZNF198-FGFR1融合基因表达水平，同时对高危人群进行较为准确的筛查。该试剂盒可有效的节约检测时间，提高检测精度。
技术介绍
8p11骨髓增殖综合征(EMS)是一种伴FGFRl基因重排的非常罕见的侵袭性血液肿瘤，定位于髓系和淋巴系细胞8p11。在2008年最新修订的WHO造血与淋巴组织肿瘤分型建议中，8p11/FGFR1重排被作为特异性分类标志，EMS被正式命名为伴有FGFR1异常的髓系和淋巴系肿瘤。伴FGFR1重排的恶性血液肿瘤的主要生物学特征为：染色体涉及8p11异常，常伴嗜酸细胞增多，淋巴结肿大并伴有淋巴母细胞淋巴瘤，短期内迅速进展为急性血病。目前已报道FGFR1的伙伴基因有14种，其中报道最多的为ZNF198。ZNF198-FGFR1融合基因是通过平衡易位t(8；13)(p11；q12)方式形成，融合结果导致ZNF198基因的第本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于检测样本中ZNF198‑FGFR1融合基因的寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸包括检测ZNF198‑FGFR1融合基因的上游引物ZNF198‑FGFR1‑F、下游引物ZNF198‑FGFR1‑R和探针ZNF198‑FGFR1‑Probe，其碱基序列为：ZNF198‑FGFR1‑F:TGCCTATCCCTGTGCCTG；ZNF198‑FGFR1‑R:GAGTCCCACTGGAGGAGAGC；ZNF198‑FGFR1‑Probe:FAM‑TGATGGCCGAACCAGAAGAACCC‑TAMRA。

【技术特征摘要】
1.用于检测样本中ZNF198-FGFR1融合基因的寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸包括检测ZNF198-FGFR1融合基因的上游引物ZNF198-FGFR1-F、下游引物ZNF198-FGFR1-R和探针ZNF198-FGFR1-Probe，其碱基序列为：ZNF198-FGFR1-F:TGCCTATCCCTGTGCCTG；ZNF198-FGFR1-R:GAGTCCCACTGGAGGAGAGC；ZNF198-FGFR1-Probe:FAM-TGATGGCCGAACCAGAAGAACCC-TAMRA。2.如权利要求1所述的寡核苷酸，其特征在于，ZNF198-FGFR1-F：ZNF198-FGFR1-R：ZNF198-FGFR1-Probe的摩尔比为2:2:1。3.如权利要求1所述的寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸还包括检测abl内参基因的上游引物abl-F、下游引物abl-R和探针abl-Probe，其碱基序列为：abl-F:GATACGAAGGGAGGGTGTACCA；abl-R:CTCGGCCAGGGTGTTGAA；abl-Probe:FAM-GCTTCTGATGGCAAGCTCTACGTCTCCT-TAMRA。4.如权利要求3所述的引物和探针，其特征在于，abl-F：abl-R：abl-Probe的摩尔比为2:2:1。5.一种检测样本中ZNF198-FGFR1融合基因的方法，其特征在于：(1)提取样本中的RNA；(2)将(1)提取出的RNA逆转录为cDNA；(3)加入(2)中所述的cDNA到反应管中，利用检测ZNF198-FGFR1融合基因的上游引物ZNF198-FGFR1-F、下游引物ZNF198-FGFR1-R和探针ZNF198-FGFR1-Probe检测样本中的ZNF198-FGFR1融合基因荧光信号；利用检测abl内参基因的上游引物abl-F、下游引物abl-R和探针abl-Probe检测样本中的abl内参基因荧光信号，其中ZNF198-FGFR1-F:TGCCTATCCCTGTGCCTG；ZNF198-FGFR1-R:GAGTCCCACTGGAGGAGAGC；ZNF198-FGFR1-Probe:FAM-TGATGGCCGAACCAGAAGAACCC-TAMRA；abl-F:GATACGAAGGGAGGGTG...

【专利技术属性】
技术研发人员：林筱剑，黄开新，王淑一，
申请(专利权)人：南京艾迪康医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏,32