一种检测基因融合的方法及装置制造方法及图纸

技术编号:12033145 阅读:158 留言:0更新日期:2015-09-10 21:31
本发明专利技术公开了一种检测基因融合的方法及装置。其中,该方法包括以下步骤:S1,提取待检测样本RNA,将RNA进行反转录,得到cDNA;S2,在已知的融合基因的断点两侧设计引物,以cDNA为模板扩增出融合形式的序列,构建测序文库;S3,通过高通量的方法对测序文库进行测序,得到融合形式的序列;S4,检测融合形式的序列;S4具体包括:S41,利用比对软件将S3得到的融合形式的序列与相应的融合形式的参考序列相比对;S42,判断S41所得到的数据是否符合分析需求;S43,检测已知融合形式。本方法具有灵敏度高,特异性好且较为经济的优势。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物学领域,具体而言,涉及一种检测基因融合的方法及装置
技术介绍
基因突变是指基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象(gene mutation)。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改 变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定 的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个位点 上,突然出现了一个新基因,代替了原有基因,这个基因叫做突变基因。于是后代的表现中 也就突然地出现祖先从未有的新性状。 基因突变是生物进化的重要因素之一,所以研宄基因突变除了本身的理论意义以 外还有广泛的生物学意义。基因突变为遗传学研宄提供突变型,为育种工作提供素材,所以 它还有科学研宄和生产上的实际意义。 有的基因突变是由于染色体发生结构变异形成。在自然条件或人为因素的影响 下,染色体发生的结构变异主要有:缺失、重复、倒位和易位,其中,基因融合也是染色体发 生结构变异的一种。所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连,置于同一套 调控序列(包括启动子、增强子、核糖体本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测基因融合的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,提取待检测样本RNA,将所述RNA进行反转录,得到cDNA;S2,在已知的融合基因的断点两侧设计引物,以所述cDNA为模板扩增出融合形式的序列,构建测序文库;S3,通过高通量的方法对所述测序文库进行测序,得到所述融合形式的序列;S4,检测所述融合形式的序列;所述S4具体包括:S41,利用比对软件将所述S3得到的所述融合形式的序列与相应的融合形式的参考序列相比对,并根据比对的位置进行排序,然后建立比对结果的索引文件;S42,判断所述S41所得到的数据是否符合分析需求,如果符合分析需求,进行S43,如果不符合分析需求,重复步骤S1,S2,S3...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:蒋智曹志生李宗文张广鑫张兰英孟雪红王玉梅尹静妮谭泽民曹银川吴晓朦潘凯
申请(专利权)人:天津诺禾致源生物信息科技有限公司
类型:发明
国别省市:天津;12

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